Arquivo de Grupos de Investigação

GRUPO DE ONCOLOGIA CLÍNICA

The Clinical Oncology Research Group (GOC) was created in 2021.
Its main mission is to create a group of scientifically robust and capable elements among different health professionals.
GOC projects seek to answer clinical questions resulting from real needs, by analyzing real-life data, to continuously improve the quality of treatment offered to patients.
Although recent, the GOC team has been expanding, integrating elements that have invested in their academic progression and elements that have completed clinical internships at internationally renowned oncology centers, such as the MD Anderson Cancer Center and Gustave Roussy.
The multidisciplinary nature of its elements is a differentiating characteristic and promotes stimulating, fruitful and advantageous discussions for scientific research. Its members are committed to the group’s mission.

SCIENTIFIC COORDINATOR

Ana Espírito Santo, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4840-590X/ DA1B-35B9-E2D4
Consultant Clinical Hematologist
Email: ana.esanto@ipoporto.min-saude.pt

TEAM
Senior Researchers

Cláudia Vieira, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5396-9753/ 641E-265C-9730
Consultant Medical Oncologist
Email: claudia.vieira@ipoporto.min-saude.pt

Magda Andrea Silva Oliveira, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-0653-341X/ E614-C685-6817
Psychologist
Email: magda.oliveira@ipoporto.min-saude.pt

Maria Deolinda Pereira, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-2367-1299/ 991B-E677-158E
Senior Consultant Medical Oncologist
Email: dpereira@ipoporto.min-saude.pt

Mavilde Rodrigues Arantes da Silva Longarito, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-0297-2247/ 6E17-7D72-53E7
Consultant Neuroradiologist
Email: i11815@ipoporto.min-saude.pt

Miguel Henriques Abreu, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-3940-0688/ F61D-1E69-3148
Consultant Medical Oncologist
Email: antonio.m.abreu@ipoporto.min-saude.pt

Joaquim Castro Silva, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3934-9950/ B418-68AE-3A6A
Consultant Otorrinolaringologist
Email: joaquim.castro@ipoporto.min-saude.pt

Jorge Serafim Sobrado Marinho, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-1222-627X/ 311C-6EF7-EB13
Consultant Stomatologist
Email: jmarinho@ipoporto.min-saude.pt

Guest Researchers

Rita Ribeiro Silva, PhD
ORCID ID/ Ciência ID:
Attending Clinical Hematologist @
Email: rita.rbsilva@gmail.com

PhD Students

Daniela Rocha-Santos, MSc (with ETPG)
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-1081-5142/ 4617-DBEA-8AE6
Email: daniela.r.santos@ipoporto.min-saude.pt

José Manuel Ferrer Martinez, BSN, MSc; Specialist nurse
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-7909-7938/ DF1B-A0A1-2302
Email: jmmartinez@ipoporto.min-saude.pt

Pedro Miguel dos Reis Cruz, MD, MSc Resident in Medical Oncology (with ETPG)
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8813-0632/ 0610-621F-B88A
Email: pedro.reis.cruz@ipoporto.min-saude.pt

Valéria Delgado Tavares, MSc (with MOVPG)
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-3680-7757/ B715-3863-A1DA
Email: valeria.tavares@ipoporto.min-saude.pt

Other collaborators

Alina Rosinha, MD, MSc, Attending Medical Oncologist
Ana Alexandra Ferreira, MD, BSc, Consultant Medical Oncologist
Ana Filipa Carneiro, MD, BSc Attending Medical Oncologist
Ana Isabel Vaz Ferreira MD, MSc, Resident in Medical Oncology
Ana Maria Meireles MD, MSc,Resident in Clinical Hematology
Ana Raquel Teixeira MD, MSc, Resident in Medical Oncology
Ana Rita Lopes MD, MSc; Attending Medical Oncologist
Ana Sofia Jardim Patrão MD, MSc; Attending Medical Oncologist
Andreia Guimarães da Cruz, MD, MSc, Attending Medical Oncologist
Cátia Faustino, MD, BSc, Consultant Medical Oncologist
Cláudia Melissa de Paiva Agostinho MD, MSc, Resident in Medical Oncology
Cláudia Sílvia da Rocha Moreira, MD, BSc, Attending Clinical Hematologist
Dânia Sofia Marques Santos, MD, MSc Consultant Medical Oncologist
Dulcineia José Nunes de Alves Pereira, MD, BSc Attending Hemato-oncologist
Hugo André do Nascimento Ferreira, MD, MSc; Attending Nefrologist
Inês Baptista Freitas, MD, MSc, Resident in Medical Oncology
Joana Savva Bordalo e Sa, MD, MSc Consultant Medical Oncologist
João Pedro Gouveia da Fonseca, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
José Brito da Silva, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
Maria Cândida Silva, MD, MSc; Attending General and Family Medicine
Maria Gabriela Martins, MD, BSc; Consultant Medical Oncologist
Maria Isabel Vilas-Boas, MD, MSc; Attending Medical Oncologist
Maria Joaquina Maurício, MD, MSc; Senior Consultant Medical Oncologist
Maria Cassiano Neves, MD, BSc; Consultant Medical Oncologist
Marta Soares, MD, BSc, Senior Consultant Medical Oncologist
Marta Isabel Ribeiro Ferreira, MD, MSc; Consultant Medical Oncologist
Michael Sapateiro Luís, MD, MSc; Consultant Medical Oncologist
Nuno Duarte Gonçalves, MD, BSc; Senior Consult Clinical Patologist
Olga Dulce Sousa de Meneses, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
Paula Cristina da Silva Ferreira, MD, BSc; Consultant Medical Oncologist
Rita Amorim e Costa, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
Rute Fernandes, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
Sara Cristina Neves de Carvalho, MD, MSc; Resident in Medical Oncology
Sara Marina Carneiro Pinto Coelho, MD, MSc Attending Medical Oncologist
Susana Sousa Almeida, MD, MSc; Senior Consultant Psychiatrist
Vítor Costa, MD, BSc Attending Pediatrician

Aims

The main objective of the GOC is to establish bridges between clinical practice and translational research, in order to allow patients access to more efficient and innovative treatments.
The GOC encourages clinical studies of research initiative and promotes collaborative efforts both internally, with other groups at the Research Center, but also externally through partnerships with national and international organizations.
A cornerstone of the GOC is encouraging the continuous training of health professionals, with a focus on improving the quality of care provided to cancer patients.

PROJECTS WITH EXTERNAL FUNDING

Epidemiological characterization of the population of patients with chronic myeloid leukemia treated at the Porto IPO – Portuguese Association Against Leukemia, Portuguese Society of Hematology and Novartis; 15 000 € (2023); Dr. Ana Meireles (PI)

The introduction of tyrosine kinase inhibitors (TKI) was revolutionary in the treatment of chronic myeloid leukemia (CML). The focus changed from delaying the progression of the disease to more advanced stages, to obtaining a survival similar to the general population, achieving a profound molecular response and discontinuing therapy while maintaining remission. Furthermore, it is increasingly important to consider the effects of TKIs on patients’ quality of life and patient-reported outcomes in the therapeutic approach. There are several studies on responses and adverse effects in patients with CML. However, the characterization of these patients in Portugal is not yet known. This project’s main objective is to describe the population of patients with CML treated at IPOP and, in parallel, to describe adverse effects of TKIs documented in these patients and which patients are candidates for TKI suspension and whether there was a need to resume TKIs.

FAROL – Implementation of a financing model based on the measurement of clinical and non-clinical outcomes and integrated disease management in lung cancer at IPO Porto; (2018-2023); Dr. Marta Soares (PI)

The FAROL pilot project, focusing on Health Results and Integrated Disease Management, consists of developing a financing model focused on measuring results with incentives associated with quality.

CHIP-AML22 – Improved diagnostics and survival for all children with Acute Myeloid Leukemia treated within the NOPHO-DB- SHIP consortium; a cross-European collaboration;193 481,68€ (2022-2025); Dr. Vítor Costa (PI @ IPO Porto)

The CHIP-AML22 project seeks to implement new diagnostic techniques for Acute Myeloid Leukemia (AML) to improve the treatment of patients with these diseases. This consortium seeks to:

– Perform the genetic profile of AML cells to better stratify the risk group of patients.

-WGS and RNA seq analysis to incorporate and improve patient treatment;

– The implementation and evaluation of the response to treatment of both methods during and after treatment, across the consortium.

HENKO NET – Innovation and Digital Technologies for Social and Health Palliative Care at home; 157 886,96€ (2024-2026); Dr. Maria Paula Silva (PI @ IPO Porto)

In several European countries such as Spain, France and Portugal, only a portion of people in need of palliative care (PC) actually receive it.

However, PC are essential in controlling symptoms, providing relief, and respecting people’s dignity and as such are an ethical obligation. The significant number of patients needing PC would like to receive them at home, which constitutes an increase in well-being.

HENKO means in Japanese a profound and transformative change. Thus, this project seeks to establish a community of knowledge to strengthen CP systems and lead to organizational change. HENKO NET aims to promote innovation and the adoption of innovative digital technologies so that continuous care is possible at patients’ homes and in rural areas.

The partners in this project will seek a joint strategy to promote innovative advanced training and exchange of best practices in new care models and the adoption of effective digital technologies among healthcare professionals.

The most innovative result expected from this project will be the development of the HENKO platform based on artificial intelligence for the early detection of the need for CP and the anticipation of unwanted events (medical or social). This is expected to significantly improve the organization of care with more effective monitoring at home and a reduction in hospitalizations.

Patients, families and professionals will be actively involved in this development and will be piloted with 100 patients to determine its effectiveness and efficiency. Cooperation between beneficiaries from the three countries (SP, FR and PT) is essential, since innovation in this area is very scarce, so expanding the work scenario at a transnational level will provide sufficient knowledge to develop solutions.

Selected publications (up to five)

Almeida, S. N., Elliott, R., Silva, E. R., & Sales, C. M. D. (2019). Fear of cancer recurrence: A qualitative systematic review and meta-synthesis of patients’ experiences. Clinical psychology review, 68, 13–24. https://doi.org/10.1016/j.cpr.2018.12.001
Moreira, I., Ferreira, M., Garcia, S., Novais, P., Gama, J., Ferro, B., Leite-Silva, P., Frutuoso, C., Pires, M., Barbosa, A., Pinto, C., Teixeira, M. R., Pereira, D., & Bartosch, C. (2023). Practical lessons learned from real-world implementation of the molecular classification for endometrial carcinoma. Gynecologic oncology, 176, 53–61. https://doi.org/10.1016/j.ygyno.2023.07.005
Mazza, M., Piperis, M., Aasaithambi, S., Chauhan, J., Sagkriotis, A., & Vieira, C. (2022). Social Media Listening to Understand the Lived Experience of Individuals in Europe With Metastatic Breast Cancer: A Systematic Search and Content Analysis Study. Frontiers in oncology, 12, 863641. https://doi.org/10.3389/fonc.2022.863641
Henriques-Abreu, M., & Serrano, C. (2021). Avapritinib in unresectable or metastatic gastrointestinal stromal tumor with PDGFRA exon 18 mutation: safety and efficacy. Expert review of anticancer therapy, 21(10), 1081–1088. https://doi.org/10.1080/14737140.2021.1963235

Grupo de Abordagem de Lesões Pré-Cancerosas & Cancro Precoce

O grupo PRECAM representa uma rede ímpar na área da investigação clínica e de translação em Cancro Precoce, com maior foco em Oncologia Gastrointestinal, reunindo investigadores de diferentes instituições de referência no cancro, como o IPO do Porto, IPO de Coimbra e o Centro Hospitalar Universitário do Porto.

Esta equipa multidisciplinar revê-se na missão principal de criar novo conhecimento e avaliar tecnologias novas e disruptivas numa visão compreensiva e integrativa, com o intuito de melhorar o diagnóstico e seguimento de doentes com lesões precursoras e cancro precoce, através da personalização dos cuidados em saúde.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Mário Dinis Ribeiro, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-0121-6850
Ciência ID: 731E-7010-177F
Assistente Graduado Sénior
Diretor do Departamento de Medicina IPOP
Sub-coordenador LT2 – Cancro / RISE@CI-IPO (Rede de Investigação em Saúde, Centro de Investigação IPO)
Professor Catedrático Convidado MEDCIDS / FMUP
E-mail: mario.ribeiro@ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA
Investigadores Sénior

Ana Carina Pereira, PhD
ORCID ID: 0000-0003-4302-2501
Ciência ID: 3515-2BE2-B60D
Investigadora Auxiliar
Investigadora Auxiliar CI-IPOP
E-mail: ana.martins.pereira@ipoporto.min-saude.pt

Filipa Fontes, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9246-589X
Ciência ID: 5F10-FB9E-C805
Investigadora Auxiliar
Investigadora Auxiliar CI-IPOP
E-mail: filipa.fontes@ipoporto.min-saude.pt

Miguel Areia, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9787-8175
Ciência ID: 3516-7AAD-D948
Assistente Hospitalar Graduado de Gastrenterologia IPOC
Co-Editor Associado GE Portuguese Journal of Gastroenterology
Membro da Equipa Editorial do jornal Endoscopy
E-mail: miguel.areia75@gmail.com

Pedro Pimentel Nunes, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-7308-3295
Ciência ID: 0616-5C59-DC3B
Assistente Hospitalar Graduado
Diretor Clínico de Gastrenterologia Unilabs
Professor Associado Convidado FMUP
E-mail: pedronunesml@gmail.com

Ricardo Marcos Pinto, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9695-8261
Ciência ID: 791D-EF1B-B4C7
Assistente Hospitalar Graduado
Assistente Hospitalar Graduado de Gastrenterologia CHUSA
Professor Auxiliar Convidado ICBAS
E-mail: ricardomarcospinto@sapo.pt

Investigadores Júnior

Ana Paula Santos, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-8896-305X
Ciência ID: BC1E-DE39-17DF
E-mail: anapaulasantos@ipoporto.min-saude.pt

Andreia Albuquerque, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-5258-2987
Ciência ID: DD1A-51B5-316E
E-mail: a.albuquerque.dias@gmail.com

Diogo Libânio, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-2691-7522
Ciência ID: 1C13-7D9E-A4B5
E-mail: diogo.monteiro@ipoporto.min-saude.pt

Ricardo Kuttner Magalhães, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-8522-5756
Ciência ID: F31A-B091-3D92
E-mail: rkuttner@gmail.com

Doutorandos

Catarina Lopes, MSc
ORCID ID: 0000-0003-0176-286X
Ciência ID: 6719-02C2-856E
E-mail: catarina.p.lopes@ipoporto.min-saude.pt

Assistentes de Investigação

Tatiana Cruz Almeida, MSc
ORCID ID: 0000-0002-9444-8257
Ciência ID: CD18-88C4-CE90
E-mail: tatiana.almeida@ipoporto.min-saude.pt

Outros colaboradores

Catarina Brandão, MD
Diretora Serviço de Gastroenterologia
ORCID ID: 0009-0005-4718-9693
Ciência ID: 7D14-540E-A6BC

Inês Marques de Sá, MD
Assistente Hospitalar de Gastrenterologia IPOP
Ciência ID: F113-E6A1-43FD

Jéssica Chaves, MD
Interna de Gastrenterologia IPOP
ORCID ID: 0009-0009-2734-4755
Ciência ID: 6A17-89D0-34C7

Raquel Ortigão, MD
Assistente Hospitalar de Gastrenterologia IPOP
Ciência ID: CD1F-EABB-DC3B

OBJETIVOS

O grupo PRECAM tem como objetivos estruturantes no rastreio, diagnóstico e abordagem de condições/lesões precursores e cancro precoce digestivo (1) investigar o potencial do diagnóstico não invasivo, nomeadamente pelo recurso a biópsias líquidas e dispositivos point-of-care; (2) otimizar o diagnóstico minimamente invasivo através da avaliação de diferentes outcomes de tecnologias novas e disruptivas (p.e. endoscopia, qualidade em endoscopia, inteligência artificial); e (3) desenhar e avaliar abordagens e serviços clínicos compreensivos (p.e. definição de regras de decisão clínica, desenvolvimento de intervenções e estudos de custo-efetividade). Propomo-nos ainda explorar estas abordagens/plataformas noutros modelos tumorais.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

AIDA – An Artificially Intelligent Diagnostic Assistant for gastric inflammation; Horizon Europe; 101095359; 6 334 803,75€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP e líder de pacote de trabalhos)

A maioria dos casos de cancro gástrico (CG) é detetada numa fase avançada, quando os doentes têm uma esperança média de vida de cerca de 12 meses. Diagnosticar os doentes numa fase inicial, pré-sintomática e normalmente envolvendo a inflamação gástrica crónica, pode melhorar significativamente o prognóstico.

A Inteligência Artificial (IA) pode auxiliar a equipa médica a melhor compreender os dados, automatizando grande parte do tratamento e análise, que exige trabalho manual e anos de experiência. Mas pode fazer ainda mais: pode reunir dados de várias origens numa fonte robusta e correlacionar os dados por forma a derivar uma escala de risco para CG e esclarecer mecanismos da sua evolução.

O objetivo do AIDA é precisamente esse! Ajudar os investigadores a compreender os mecanismos que desencadeiam a carcinogénese gástrica, a diagnosticar a inflamação pré-cancerosa o mais cedo possível, a informar estratégias terapêuticas personalizadas para o tratamento e vigilância, assim como recomendações personalizadas para monitorização do estado de saúde dos doentes, contribuído assim para a prevenção de cancro gástrico. Isto posiciona o AIDA diretamente na agenda europeia de Staying healthy in a rapdly changing society.

Este consórcio reúne as maiores autoridades europeias no domínio da inflamação e cancro gástrico, peritos em IA e machine learning, governação de dados e privacidade, e representantes da administração pública e doentes. O AIDA tem também fortes ligações à indústria.

O desenho robusto e princípios do AIDA, a sua relevância social e durabilidade prometem um ecossistema dinâmico focado na inflamação crónica gástrica, sua compreensão e tratamento que pretende inspirar outras colaborações de dados na área da saúde – para outras inflamações crónicas, modelos de cancro ou doenças em geral.

TOGAS – TOwards GAstric cancer Screening implementation in the European countries; EU4H; 101101252; 11 337 063,81€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP e líder de pacote de trabalhos)

Atualmente, na Europa não existe nenhuma estratégia de rastreio eficaz na prevenção de cancro gástrico (CG). Espera-se, no entanto, que a erradicação da Helicobacter pylori conduza a uma redução da mortalidade em 40%. Outra abordagem passa pela deteção precoce de lesões pré-cancerosa e seu seguimento.

O objetivo principal do TOGAS é gerar conhecimento baseado na evidência para informar planos de implementação de estratégias de prevenção na União Europeia. Os resultados do TOGAS pretendem auxiliar os decisores políticos na inclusão do rastreio do CG nas suas prioridades em cuidados de saúde, sem ignorar a eficácia, aplicabilidade e aceitabilidade com os potenciais efeitos adversos a longo prazo.

O TOGAS envolverá a implementação de três estudos-piloto, cada um desenhado para abordar aspetos específicos do rastreio e deteção precoce de CG. Este consórcio reúne 18 parceiros e três parceiros associados que representam instituições de ensino superior, estruturas de investigação, clínicas e organizações da sociedade civil de 14 estados-membros.

ONCOSCREEN – A European “shield” against colorectal cancer based on novel, more precise and affordable risk-based screening methods and viable policy pathways; HORIZON EUROPE; 101097036; 12 972 076,25€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP) e Luís Lima (Co-IP@GPTE)

Uma campanha multinível para melhorar o rastreio de cancro colorretal.

O rastreio de cancro colorretal (CCR) de base populacional é recomendado na União Europeia (EU), no entanto apenas um em cada sete cidadãos da EU participa nestes programas, representado o CCR 12,4% de todas as mortes por cancro. O ONCOSCREEN pretende inverter este cenário através da promoção de abordagens precisas, não invasivas, custo-eficazes, baseadas em tecnologias inovadoras para uma maior sensibilização para esta doença. Variáveis genéticas, económicas e fatores ambientais serão integrados nestas abordagens personalizadas, permitindo uma estratificação de risco para CCR. O consórcio ONCOSCREEN reúne 38 parceiros e está alinhado com a Missão Cancro do Horizonte Europa.

BioFaeC – Novel faecal biomarkers for early detection of precancerous lesions and Cancer: Improving the current model for colorectal cancer screening; FCT; 2022.09051.PTDC; 49 909€ (2023-2024); Mário Dinis-Ribeiro (IP) e Luís Lima (Co-IP@GPTE)

Um dos maiores desafios no diagnóstico precoce e consequentemente melhor prognóstico de cancro colorretal (CCR) é a ausência de biomarcadores que permitam uma identificação precisa de doentes com um risco acrescido de progressão maligna. O desenvolvimento de um método de rastreio acessível e não invasivo que identifique também adenomas avançados (risco aumentado de progressão para CCR) fará avançar a deteção precoce de CCR face às atuais estratégias de base populacional aprovadas na União Europeia.

Assim, o BioFaeC propõe-se a identificar e validar um painel de biomarcadores que auxilie o diagnóstico precoce, pela deteção também de adenomas avançados a avaliar a sua aplicabilidade como ferramenta não invasiva.

O BioFaeC é um projeto exploratório, financiado no âmbito do Concurso FCT para Projetos de I&D em Todos os Domínios Científicos 2022 e resulta do consórcio de investigação IPOP e i3s (P.CCC Raquel Seruca) e terá a duração de 18 meses.

No IPOP e num esforço colaborativo, este projeto inovador está a ser desenvolvido nos grupos PRECAM e Grupo de Patologia e Terapêutica Experimental (GPTE).

CAGED – Computer Assisted Gastric Cancer Diagnosis; FCT; PTDC/EEI-EEE/5557/2020; 249.460,00€ (2021-2024); Miguel Coimbra (INESC TEC) & Mário Dinis-Ribeiro

O cancro gástrico é o terceiro mais mortal em todo o mundo e o rastreio minimamente invasivo e a endoscopia gastrointestinal desempenham um papel primordial para um diagnóstico precoce, crucial para a melhoria das taxas de sobrevivência. No entanto, devido a fatores técnicos e cognitivos, o risco de um falso diagnóstico causado por erro humano é possível.

Assim, o principal objetivo deste estudo é criar tecnologias baseadas em visão computacional para analisar, de forma automática, vídeos e imagens obtidos através de endoscopias gastrointestinais não invasivas.

A Inteligência Artificial, e mais especificamente a Visão Computacional, tem o potencial de mitigar as limitações existentes atualmente, ao fornecer ferramentas de avaliação automáticas da endoscopia que não só podem apoiar os médicos na deteção e caracterização de lesões de cancro gástrico, como podem monitorizar a próprias qualidade da endoscopia efetuada.

EUCANSCREEN – European Action on Cancer Screening

EU4H; 101162959;38 749 916,70€ (2024-2028); Mário Dinis-Ribeiro (PI@IPOP and Task leader)

O Plano Europeu de Luta contra o Cancro da União Europeia introduziu um novo Programa de Rastreio do Cancro apoiado pela UE, com o objetivo de assegurar a implementação de programas de rastreio oncológico de elevado desempenho em todos os Estados-Membros. O projeto EUCanScreen visa promover a implementação sustentável de programas de rastreio de elevada qualidade para os cancros da mama, do colo do útero e colorretal, bem como dos rastreios recomendados para os cancros do pulmão, da próstata e gástrico.

O principal objetivo do projeto é reduzir o impacto do cancro e promover a equidade no acesso aos programas de rastreio em toda a União Europeia.

Objetivos:

Assegurar a implementação plena, custo-efetiva e com garantia de qualidade dos programas de rastreio do cancro da mama, do colo do útero e colorretal.
Preparar a implementação futura dos programas de rastreio do cancro do pulmão, da próstata e gástrico.
Reforçar a recolha e monitorização de dados, assegurando um acesso equitativo aos programas de rastreio.
Promover a colaboração com outros projetos financiados pela UE, garantindo a sustentabilidade a longo prazo.

O consórcio reúne 29 países, incluindo 25 Estados-Membros da UE, bem como a Ucrânia, a Moldávia, a Noruega e a Islândia. O projeto é coordenado pela Universidade da Letónia e envolve 98 parceiros: 29 autoridades competentes; 61 parceiros afiliados e 8 parceiros associados. O EUCanScreen terá a duração de 48 meses, com um orçamento total de 38,7 milhões de euros.

Publicações

Martins ML, Pedroso M, Libanio D, Dinis-Ribeiro M, Coimbra M, Renna F. Diagnostic Performance of Deep Learning Models for Gastric Intestinal Metaplasia Detection in Narrow-band Images. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2023 Jul;2023:1-4. doi: 10.1109/EMBC40787.2023.10340055.

Lima G, Coimbra M, Dinis-Ribeiro M, Libanio D, Renna F. Analysis of classification tradeoff in deep learning for gastric cancer detection. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2022;2022:2177-2180. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9871040.

Lopes I, Silva A, Coimbra M, Dinis-Ribeiro M, Libanio D, Renna F. Supervised and semi-supervised training of deep convolutional neural networks for gastric landmark detection. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2022;2022:2025-2028. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9870992

Renna F, Martins M, Neto A, Cunha A, Libânio D, Dinis-Ribeiro M, Coimbra M. Artificial Intelligence for Upper Gastrointestinal Endoscopy: A Roadmap from Technology Development to Clinical Practice. Diagnostics (Basel). 2022;12(5):1278. doi: 10.3390/diagnostics12051278

IMAGE – Individualized Gastric Adenocarcinoma Early Diagnosis and Improved Patients’ Survival: From Liquid Biopsies to a Comprehensive Management Approach; NORTE2020; NORTE-01-0145-FEDER-000050; 601.320,91€ (2021 – 2023); Mário Dinis-Ribeiro

O projeto IMAGE visa identificar e validar novos biomarcadores em circulação passíveis de serem facilmente detetados por metodologias não invasivas no diagnóstico precoce de cancro gástrico, que representa um problema social significativo em Portugal. A ferramenta de diagnóstico final abordará a doença numa fase precoce do seu desenvolvimento, resultando num aumento da sobrevida e qualidade de vida dos doentes, pelo recurso a procedimentos terapêuticos menos agressivos e invasivos. Este projeto encontra-se estruturado em três linhas de investigação (LI):

na LI1 será implementada uma abordagem transcriptómica para identificar e validar um painel de biomarcadores salivares que permita o rastreio e seguimento não invasivo de cancro gástrico;
na LI2, o foco é o conceito de endoscopia funcional, ou seja, a visão puramente morfológica/imagiológica da endoscopia será desafiada pela integração da informação de biomarcadores no suco gástrico (microbiota);
na LI3, será desenhada uma regra de decisão clínica compreensiva, integrando dados clínicos, endoscópicos e moleculares com vista a um rastreio e seguimento de cancro gástrico personalizado.

Espera-se que as evidências que derivem deste estudo acrescentem ao conhecimento e melhorem as tecnologias disponíveis no diagnóstico precoce e vigilância de cancro gástrico. O recurso a biópsias líquidas permitirá potencialmente diminuir as disparidades no acesso aos cuidados de saúde, oferecendo melhores cuidados a quem mais beneficiará dos mesmos.

Publicações

Lopes C, Almeida TC, Pimentel-Nunes P, Dinis-Ribeiro M, Pereira C. Linking dysbiosis to precancerous stomach through inflammation: Deeper than and beyond imaging. Front Immunol. 2023;14:1134785. doi: 10.3389/fimmu.2023.1134785

Lopes C, Chaves J, Ortigão R, Dinis-Ribeiro M, Pereira C. Gastric cancer detection by non-blood-based liquid biopsies: A systematic review looking into the last decade of research. United European Gastroenterol J. 2023;11(1):114-130. doi: 10.1002/ueg2.12328

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

Rei A, et al. Metachronous lesions after gastric endoscopic submucosal dissection: First assessment of the FAMISH predicting score. Endoscopy. 2023 May 9. doi: 10.1055/a-2089-6849
Arribas J, et al. Standalone performance of artificial intelligence for upper GI neoplasia: a meta-analysis. Gut 2020. doi.org/10.1136/gutjnl-2020-321922
Libânio D, et al. Prospective comparative study of endoscopic submucosal dissection and gastrectomy for early neoplastic lesions including patients’ perspectives. Endoscopy 2019;51(1):30-39. doi.org/10.1055/a-0628-6601
Areia M, et al. Endoscopic screening for gastric cancer: A cost-utility analysis for countries with an intermediate gastric cancer risk. United European Gastroenterol J 2018;6(2):192-202. doi.org/10.1177/2050640617722902
Hess T, et al. Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer. EBioMedicine. 2023;18(92):104616. doi: 10.1016/j.ebiom.2023.104616

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS / CONSÓRCIOS

Johannes Schumacher
Centro de Genética Humana, Universidade de Marburgo | Alemanha

Marino Venerito / Peter Malfertheiner
Consórcio: staR – European Network on the Germline Genetics of Gastric Cancer | Alemanha

Javier P. Gisbert / Francis Megraud / Colm O’Morain / Adrian G. McNicholl
Consórcio: Hp-EuReg – European Registry on the Management of Helicobacter Pylori Infection | Espanha

Rodrigo Jover | Consórcio: European Polyp Surveillance (EPoS) Trials | Europa

Talía Malagón / Kimon Chatzistamatiou / Elisabeth McClymont / Staci Sudenga / Anna R Giuliano
Consórcio: IPVS Early Career Working Group | Suiça

Tania Fleitas / Marcis Leja / Fátima Carneiro / Javier P. Gisbert / Leticia Moreira / Tamara Matysiak-Budnik / Laimas Jonaitis / Mário Dinis-Ribeiro / Manon Spaander
Consórcio: AIDA Consortium | Espanha

Marcis Leja / Tamara-Matysiak-Budnik / Iris Vogelaar-Lansdorp / Zorana Maravic / Javier P. Gisbert / Juozas Kupcinskas / Dan Lucian Dumitrascu / Annemieke Smet / Mike Morrissey / Katarzyna Neubauer / Nadan Rustemovic / Sandra Milic / Wessel vaonn de Veerdonk / Victoria McEneaney / Jochen Weigt
Consórcio: TOGAS Consortium | Grécia

Anax Fotopoulos / Markus Mohler |
Consórcio: ONCOSCREEN Consortium | Grécia

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respetivo coordenador.

Grupo de Epidemiologia, Resultados, Economia & Gestão em Oncologia

A atividade de investigação do GEREGO engloba investigação a nível populacional (RORENO e RON) e hospitalar (IPOP) e em várias áreas de conhecimento, indo ao encontro do nível de desafios que os sistemas de saúde enfrentam globalmente e assumindo que a gestão dos cuidados de saúde deve ter uma forte componente de resultados clínicos (Value-Based Health Care). Assim, o grupo tem contribuído para o conhecimento sobre a epidemiologia do cancro, incluindo distribuição geográfica da incidência, influência de determinantes socioeconómicos, avaliação do impacto da doença na população através da quantificação da carga global de doença. Além disso, o grupo tem produzido conhecimento nas áreas de gestão, resultados em saúde e economia em cuidados de saúde.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Maria José Bento, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-7690-9830 / 2A1A-1FCE-F83E
Médica Especialista em Saúde Pública
Diretora do Serviço de Epidemiologia do IPOP
Coordenadora do Registo Oncológico Nacional
E-mail: mjbento@ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA
Investigadores Sénior

Ana Filipa Gonçalves, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4962-3260 / 4E1E-3BC4-6DA3
Registadora do registo oncológico / Data manager
E-mail: ana.goncalves@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Luísa Lopes-Conceição, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5064-9911 / B912-6BD5-D2C8
E-mail: luisa.conceicao@ipoporto.min-saude.pt

Teresa Monjardino, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4944-3366 / FE17-375E-777F
E-mail: teresa.monjardino@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Joana Moreira, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0009-0357-5137 / 3D18-0F4F-C586
Estatista
IQVIA
E-mail: i38014@ipoporto.min-saude.pt

Doutorandos

Carlos Matos, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-1134-0396 / 2619-ED62-0978
E-mail: cmdmatos@arsnorte.min-saude.pt

Mariana Pinto de Sousa, MSc
Ciência ID: 151A-5FC2-8034 / Bolsa de investigação FCT: UI/BD/154828/2023
E-mail: marianapsousa07@gmail.com

Débora Abreu, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-0531-4047 / A113-1238-5DF2
E-mail: up201304244@edu.fpce.up.pt

Outros colaboradores:

Ana Catarina Alves Rodrigues, MD MSc
ORCID ID / Ciência ID: 0009-0004-3034-4530 / 8018-881D-7BDE
Médica Especialista em Saúde Pública
E-mail: ana.a.rodrigues@ipoporto.min-saude.pt

Ana Sofia Oliveira, BSc
Ciência ID: 4C1F-9CAC-E47F
Técnica de gestão
E-mail: ana.oliveira@ipoporto.min-saude.pt

Ana Sofia Teixeira da Silva, BSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0005-5815-682X / C316-FA1F-00E6
Técnica de gestão
E-mail: ana.t.silva@ipoporto.min-saude.pt

Cláudia Teixeira, MSc
ORCID ID / Ciência ID: 0000-0002-9139-090X / 9B17-E7C0-CDA4
Registadora do registo oncológico / Data manager
E-mail: i12918@ipoporto.min-saude.pt

José Taveira-Barbosa, MSc
ORCID ID / Ciência ID: 0009-0005-3645-8296 / 6B1B-1544-1C6F
Registador do registo oncológico / Data manager
E-mail: i12918@ipoporto.min-saude.pt

Marta Rangel, BSc
Ciência ID: 5D13-1785-2D17
Técnica de gestão
E-mail: marta.rangel@ipoporto.min-saude.pt

Pedro Leite-Silva, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-7015-242X / 8F1A-B281-8B8E
Estatístico
E-mail: pedro.silva@ipoporto.min-saude.pt

Rita Calisto, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5151-5245 / 231E-FA55-2A54
Estatístico
E-mail: rita.silva.calisto@ipoporto.min-saude.pt

Teresa Mota Garcia, MD MSc
ORCID ID / Ciência ID: 0000-0003-4452-4140 / CB1C-62D4-54C6
Médica Especialista em Saúde Pública
E-mail: teresa.garcia@ipoporto.min-saude.pt

Virgínia Sousa, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5650-5401 / 191F-91F9-13BC
Técnica de gestão
E-mail: virginia.sousa@ipoporto.min-saude.pt

OBJETIVOS

O grupo pretende ter impacto local e global nos cuidados de saúde através da incorporação de uma perspetiva multidisciplinar na produção de conhecimentos nas seguintes áreas:

– Epidemiologia do cancro, incluindo etiologia do cancro e determinantes socioeconómicos;

– Investigação epidemiológica clínica em fatores preditores e de prognóstico da sobrevivência dos doentes;

– Gestão dos cuidados de saúde, investigação de resultados e economia da saúde.

Estando o CI-IPOP sediado num instituto de cancro, o papel do GEREGO nestas áreas pode ser alavancando pela forte integração com a prática clínica.

No futuro, o grupo pretende continuar a procurar parcerias nacionais e internacionais para os projetos, apoiar estudos observacionais e publicar e comunicar.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

ONCOVALUE; Implementing value-based oncology care at European cancer hospitals: An AI-based framework for assessing real-life effectiveness of novel cancer therapies in real-time; EU; 424 434,75 € (2022-2026); Johanna Mattson – HUS Helsinki University Hospital (PI) & Luisa Lopes-Conceição (co-lead of WP4)

O projeto ONCOVALUE pretende aumentar as capacidades dos hospitais oncológicos europeus para recolher, de forma fácil e rápida, dados do mundo real, desenvolvendo recursos de processamento e recolha de dados estruturados, ferramentas baseadas em inteligência artificial. Estes recursos e ferramentas permitirão a utilização eficaz de dados, estruturados e não estruturados, e frameworks de qualidade, para o desenvolvimento contínuo dos tratamentos, melhoria dos resultados, e apoiar a tomada de decisão de órgãos reguladores e de avaliação de tecnologias de saúde sobre o valor de novos tratamentos oncológicos.

CO(r)RECT Me; Metastatic COloREctal Cancer Treatment Pathway; LPCC; 13 500 € (2024-2025); Teresa Monjardino (PI) & Dânia Marques (PI)

O objetivo principal do estudo CO(r)RECT Me é descrever e comparar padrões de tratamento do cancro colorretal (CCR) metastático em centros participantes de cinco países europeus. Tendo em conta que a sobrevivência dos pacientes diagnosticados com CCR varia amplamente na Europa, uma análise minuciosa das práticas clínicas de tratamento desta doença em diferentes países permitirá compreender em que medida esta disparidade é atribuível a diferentes práticas de tratamento.

ISCCP; Incidence and survival for childhood cancer in Portugal from 2010-2020: a nationwide population-based study; LPCC; 15 000 € (2024-2025); Teresa Monjardino (PI)

O objetivo deste projeto é analisar as tendências temporais de incidência e sobrevivência do cancro infantil em Portugal, por sexo, idade, localização do cancro e região geográfica. Como objetivo secundário avaliaremos o risco de múltiplos tumores nesta coorte de doentes. Com este projeto esperamos obter estimativas pontuais e tendências temporais atualizadas de incidência e sobrevivência de cancro infantil. Estes indicadores são fundamentais para o planeamento e implementação de estratégias de prevenção e controlo do cancro.

RISK; New mRNA signatures as risk markers in cancers triggered by tobacco smoking; FCT; EXPL/SAU-PUB/1073/2021; 50 000 € (orçamento global) (2021-2023); Isabel Pereira Castro (PI) & Maria José Bento (co-PI)

O projeto RISK visa identificar, validar e explorar o potencial de novos marcadores de risco e alvos terapêuticos (kit de diagnóstico de assinaturas de mRNA e vetores de mRNA) a serem usados em doentes com cancro do pulmão, bexiga e cabeça e pescoço. Este projeto permitirá melhorar o conhecimento atual sobre os mecanismos da doença, fornecerá novos marcadores de risco do tabaco e abrirá novas oportunidades para intervenções terapêuticas na prática clínica.

CancerCOV; The impact of the COVID-19 pandemic on the diagnosis, treatment and survival of cancer patients; FCT; EXPL/SAU-EPI/1606/2021; 49 538.10 € (orçamento global) (2022-2024); Luisa Lopes-Conceição (PI) & Samantha Morais (co-PI)

O projeto CancerCOV pretende estudar o impacto da pandemia no diagnóstico, cuidados e sobrevivência de doentes oncológicos do IPOP ao longo da pandemia, comparando 3 períodos, cobrindo as 3 vagas após o início do surto em Portugal, com os mesmos 3 períodos anteriores.

Immunotherapy in recurrent/metastatic head and neck cancer: real-world data from six European countries; DIGICORE; 11 572,66 € (2022-2023); Rita Calisto (PI) & Claudia Vieira (co-PI)

Na última década, vários ensaios clínicos tem gerado evidência para a utilização de agentes anti-proteína de morte celular programada 1 (anti-PD-1) para o tratamento do carcinoma espinocelular avançado de cabeça e pescoço (HNSCC) por se associarem a melhor sobrevivência global em comparação com o tratamento padrão. Os estudos com dados do mundo real podem superar as limitações associadas dos ensaios clínicos, nomeadamente relacionadas à sub-representação de alguns grupos populacionais. Este estudo pretende descrever e comparar características e tratamentos da população do mundo real de doentes com HNSCC recorrente ou metastático, entre sete centros participantes em seis países europeus, através da recolha de informação retrospetiva sobre a utilização de imunoterapia nestes pacientes.

CIPNETH; The Causes and Consequences of Incomplete Paclitaxel Administration during the Neoadjuvant treatment of Early Triple negative and HER2 positive breast cancer; DIGICORE; 70 000 € (orçamento global) (2022-2023); Luisa Lopes-Conceição (PI) & Claudia Vieira (co-PI)

O cancro da mama é o mais comum nas mulheres, sendo na maioria das doentes diagnosticado em estádio inicial, pelo que o objetivo do tratamento é aumentar a sobrevivência através da redução do risco de recorrência da doença. Os doentes que apresentam um risco elevado são aconselhados a realizar tratamento sistémico. A terapêutica padrão consiste na administração sequencial de antraciclinas e ciclofosfamida, precedida ou seguida de taxano, com trastuzumab e/ou pertuzumab, no caso de cancro da mama HER2 positivo. No entanto, a toxidade associada à administração mensal de paclitaxel é ainda hoje um motivo de grande preocupação, sendo que até 70% dos doentes desenvolvem neuropatia periférica, não existindo nenhuma estratégia estabelecida para tratar ou prevenir este efeito secundário. Contudo não existe até à data evidência do impacto da redução da intensidade da dose administrada de paclitaxel na efetividade do tratamento. Este estudo pretende realçar o impacto potencial da redução da intensidade da dose administrada de paclitaxel, em contexto neoadjuvante, na efetividade do tratamento de doentes com cancro da mama triplo negativo e HER2 positivo em estado precoce, medida pela taxa de resposta patológica completa e pela sobrevivência livre de doença invasiva.

COLABORAÇÕES EM PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

PAINLESS; Pain relief in palliative care of cancer using home-based neuromodulation and predictive biomarkers; EU; 342 250,00 € (2022-2027); Maria Teresa Carrillo-de-la-Peña – University of Santiago de Compostela (PI) & Rui Medeiros (lead of WP1)

Este projeto pretende implementar uma intervenção inovadora, baseada em terapias de neuro-estimulação, para reduzir a dor e melhorar a qualidade de vida dos doentes com cancro e dor crónica.

Caracterização epidemiológica da população de doentes com leucemia mieloide crónica tratados no IPO do Porto; Associação Portuguesa Contra a Leucemia, Sociedade Portuguesa de Hematologia e Novartis; 15 000 € (2023); Ana Meireles (PI)

A introdução dos inibidores de tirosina cínase (TKI) foi revolucionária no tratamento da leucemia mieloide crónica (LMC). O foco passou de atrasar a progressão da doença para fases mais avançadas, para a obtenção de uma sobrevida semelhante à população geral, atingir uma resposta molecular profunda e descontinuar a terapêutica mantendo remissão. Para além disso, é cada vez mais importante ter em conta os efeitos dos TKI na qualidade de vida dos doentes e os patient-reported outcomes na abordagem terapêutica. Há vários estudos sobre as respostas e efeitos adversos em doentes com LMC. No entanto, a caracterização destes doentes em Portugal ainda não é conhecida. Este projeto tem como objetivo principal descrever a população de doentes com LMC tratados no IPOP e, paralelamente, descrever efeitos adversos dos TKI documentados nestes doentes e quais os doentes candidatos a suspensão do TKI e se houve necessidade de retomar TKI.

BENCHISTA; International benchmarking of population-based childhood cancer survival by stage at diagnosis; 349 746,50 £ (orçamento global) (2021-2024); Kathy Pritchard-Jones and Gemma Gatta (PI) & Ana Maia Ferreira (PI no IPOP)

O projeto BENCHISTA é um projeto de investigação colaborativo entre vários registros oncológicos de base populacional dentro e fora da Europa. O projeto foi desenvolvido para compreender as razões da variação nas taxas de sobrevivência de cancro infantil entre diferentes países e destacar áreas alvo de intervenção para melhorar a sobrevivência destes doentes. O projeto pretende ainda incentivar a aplicação das diretrizes de Estadiamento de Toronto por um grande número de registros de cancro europeus e não europeus para os tumores sólidos pediátricos mais comuns. O projeto se concentra nos seguintes tumores: meduloblastoma, osteossarcoma, sarcoma de Ewing, rabdomiossarcoma, neuroblastoma e tumor de Wilms. Mais de 60 registos de cancro irão recolher informações desses tumores, diagnosticados entre 2014-2017, atribuirão o estágio de Toronto ao diagnóstico e recolheram outros dados relevantes sobre o prognóstico e sobrevivência.

CCI4EU; Comprehensive Cancer Infrastructures for the European Union; EU; 9 984 080.00€; Carla Finocchiaro, Valentina Lungheu and Maurizio Cicero – Organisation of European Cancer Institutes (PI)

O objetivo do consórcio CCI4EU é reforçar a capacidade de investigação das infraestruturas Comprehensive Cancer (ICC), através: da definição do modelo de maturidade das ICC; conceber intervenções personalizadas do Programa de Capacitação; ministrar cursos de treinamento on-line; implementação de intervenções específicas no local; disseminar, explorar e reportar resultados.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

RHiP; Avaliação da tolerância à administração de paclitaxel no Instituto Português de Oncologia do Porto; IPOP-CES 030/024; Teresa Monjardino (PI), Henriqueta Sampaio (PI), Joana Gomes (PI)

A existência de reações de hipersensibilidade (RHS) à quimioterapia citotóxica leva a um dilema no tratamento do doente. As alternativas que se colocam são manter a terapêutica, assumindo o risco de evolução para uma reação mais grave ou mesmo fatal, ou interromper, adiar ou substituir por outro esquema terapêutico, que pode não ser tão eficaz como o tratamento inicialmente prescrito. No IPOP permanece por analisar como são tratadas e geridas as RHS ao paclitaxel. Este estudo pretende caracterizar as RHS ao paclitaxel no IPOP e relacioná-las com os protocolos de administração atualmente aprovados e com características clínicas e demográficas do doente.

A influência dos Incêndios Florestais na incidência de Cancro em Portugal; IPOP-CES 014/024; Rita Calisto (PI)

Vários estudos têm avaliado a relação entre incêndios florestais e doenças respiratórias agudas, mas apenas um estudo analisou esta correlação com o risco de cancro. Sendo Portugal um país frequentemente devastado por incêndios florestais, é da maior importância abordar quais as consequências na saúde da população, tais como no risco de cancro. O objetivo principal deste estudo é analisar a relação entre a exposição aos incêndios florestais em Portugal desde 2000 e a incidência de cancros de 2010 a 2020. Como objetivo secundário tentaremos avaliar o risco de desenvolver cancro em relação à área queimada e à concentração PM no ar.

Correlation between exposure to radon and the incidence of cancer in mainland Portugal; IPOP-CES 006/024; Teresa Garcia (PI)

O objetivo deste projeto é analisar a correlação entre a exposição ambiental ao radão e a incidência de vários tipos de cancro, no triénio 2018-2020, nas diferentes freguesias de Portugal continental.

Incidence patterns of cancer in the population under 50 years of age, in Portugal, between 2011 and 2019; IPOP-CES 040/024; Teresa Garcia (PI)

O objetivo deste projeto é caracterizar padrões de incidência de cancro de 2001 a 2019 em indivíduos com menos de 50 anos, estratificados por sexo, faixa etária, estadio ao diagnóstico, área de residência e tipo de cancro.

ULCER2C; Avaliação do custo do tratamento de úlceras por pressão em doentes oncológicos; PI 173-CI-IPOP 07-2022; 3 527,40 € (2021-2024); Luisa Lopes-Conceição (PI).

O projeto ULCER2C tem os seguintes objetivos:

i) Estimar o custo do tratamento de úlceras por pressão associadas aos cuidados de saúde em doentes oncológicos internados no IPOP, aplicando o método TDABC;

ii) Quantificar a associação entre a ocorrência de úlceras por pressão associadas aos cuidados de saúde em doentes oncológicos internados no IPOP e o tempo de permanência no internamento hospitalar.

COLABORAÇÕES EM PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

Análise epidemiológica do cancro da mama em mulheres idosas, em seguimento no Instituto Português de Oncologia do Porto, e o seu impacto em programas de rastreio; IPOP-CES 033/024; Filipa Pereira (PI)

No presente projeto de investigação pretendemos avaliar os novos casos, a mortalidade do cancro da mama em mulheres idosas em seguimento no IPOP, tal como o percurso da sua doença, de forma a avaliar o impacto da extensão da idade de rastreio do cancro da mama a idades mais avançadas.

Mesotelioma Maligno da Pleura – Incidência e Mortalidade em Portugal; IPOP-CES 129/023; Cátia dos Santos – Escola Nacional de Saúde Pública (PI)

Amplamente utilizado desde a antiguidade, pelas suas importantes características químicas e físicas, o amianto é reconhecido pela Agência Internacional de Investigação do Cancro (IARC) como cancerígeno para o homem em todas as suas variedades e como a principal causa de exposição profissional associada ao cancro em países industrializados. Embora a relação entre a exposição ao amianto e o Mesotelioma Maligno da Pleura (MMP) seja bem conhecida, ainda muito se desconhece sobre o consumo de amianto e a sua localização, bem como sobre a incidência e mortalidade do MMP. Em Portugal, estima-se, que cerca de 97% dos casos de MMP, são subnotificados como doença profissional. Apesar do uso de amianto ter sido banido em 1999, continua a não haver um programa de vigilância nacional, e consequentemente a não se conhecer a verdadeira dimensão deste problema no país.

MultiDPCa; Active surveillance for prostate cancer: a multidimensional study of a prospective cohort; Rui Freitas (PI)

O objetivo principal deste projeto é desenvolver um estudo prospetivo longitudinal numa coorte de pacientes com cancro de próstata de baixo risco durante um período de 84 meses. Para além de resultados clínicos, serão analisados parâmetros de qualidade de vida e custo-efetividade. Estes serão comparados com os resultados de doentes com cancro da próstata de baixo risco (e casos selecionados de risco intermediário) que optam por tratamentos alternativos em vez de vigilância ativa, como prostatectomia radical, braquiterapia e radioterapia por feixe externo.

Melanocytic Tumours in Dogs and Cats – Comparative Study with the Human Counterpart; IPOP-CES 039/024; Andreia Santos – ICBAS (PI)

O objetivo deste projeto é analisar a distribuição dos tumores melanocíticos em cães e gatos portugueses, tendo em conta a raça, sexo, idade e concelho de residência, e realizar uma análise comparativa com os mesmos tumores em humanos, destacando as semelhanças e analisando a distribuição geográfica.

Costs analysis, effectiveness and safety associated with Chimeric Antigen Receptor-T cell therapy: results from a Portuguese Comprehensive Cancer Center; IPOP-CES 188/020; (2019-2024); Sergio Chacim (PI)

Na população de doentes tratados com CAR T cells no IPOP, pretende-se:
– Avaliar a taxa de resposta global, taxa de resposta completa e parcial, bem como duração da mesma
– Avaliar a sobrevivência livre de progressão e sobrevivência global
– Avaliar a qualidade de vida durante o tratamento
– Avaliar as toxicidades durante o tratamento
– Calcular os custos diretos associados com o tratamento
– Comparar as taxas de respostas obtidas com tratamento CAR T cells com uma coorte retrospetiva de características idênticas, tratada entre 2014 – 2018 no IPOP.

Publicações

Chacim, S., Monjardino, T., Cunha, J. L., Medeiros, P., Redondo, P., Bento, M. J., Mariz, J. M., Costs, effectiveness, and safety associated with Chimeric Antigen Receptor (CAR) T-cell therapy: Results from a Comprehensive Cancer Center. PLoS ONE. 2022; 17(12): e0278950.

Comparação entre doentes com segundos tumores primários e doentes apenas com um tumor primário (cancro da mama feminina, da próstata, do cólon e reto, do pulmão e da tiroide), relativamente à incidência, sobrevivência e utilização de cuidados de saúde; IPOP-CES 50/019; (2019-2024); Filipa Fontes (PI)

Este projeto como objetivos principais estimar a incidência cumulativa de segundos cancros primários (SCPs) em quatro coortes de base populacional de casos com primeiro cancro primário (PCP) da mama feminina, da próstata, do cólon e reto, do pulmão e da tiroide, seguidas por 10 anos, de acordo com características sociodemográficas e de PCP. Pretende-se também descrever e comparar a utilização de cuidados de saúde dos doentes com SCPs e doentes sem SCPs tratados no IPOP e quantificar e comparar os custos associados aos cuidados de saúde dos doentes com SCPs e doentes sem SCPs tratados no IPOP.

FAROL; Implementation of a financing model based on the measurement of clinical and non-clinical outcomes and integrated disease management in lung cancer at IPO Porto; (2018-2023); Marta Soares (PI)

O projeto-piloto FAROL, com foco nos Resultados em Saúde e na Gestão Integrada da Doença, consiste no desenvolvimento de um modelo de financiamento centrado na medição de resultados com incentivos associados à qualidade.

Publicações Selecionadas

Botta L, Gatta G, Capocaccia R, Stiller C, Cañete A, Dal Maso L, Innos K, Mihor A, Erdmann F, Spix C, Lacour B, Marcos-Gragera R, Murray D, Rossi S; EUROCARE-6 Working Group. Long-term survival and cure fraction estimates for childhood cancer in Europe (EUROCARE-6): results from a population-based study. Lancet Oncol. 2022 Dec;23(12):1525-1536. doi: 10.1016/S1470-2045(22)00637-4. Epub 2022 Nov 16. PMID: 36400102.
Cardoso R, Guo F, Heisser T, Hackl M, Ihle P, De Schutter H, Van Damme N, Valerianova Z, Atanasov T, Májek O, Mužík J, Nilbert MC, Tybjerg AJ, Innos K, Mägi M, Malila N, Bouvier AM, Bouvier V, Launoy G, Woronoff AS, Cariou M, Robaszkiewicz M, Delafosse P, Poncet F, Katalinic A, Walsh PM, Senore C, Rosso S, Vincerževskienė I, Lemmens VEPP, Elferink MAG, Johannesen TB, Kørner H, Pfeffer F, Bento MJ, Rodrigues J, Alves da Costa F, Miranda A, Zadnik V, Žagar T, Lopez de Munain Marques A, Marcos-Gragera R, Puigdemont M, Galceran J, Carulla M, Chirlaque MD, Ballesta M, Sundquist K, Sundquist J, Weber M, Jordan A, Herrmann C, Mousavi M, Ryzhov A, Hoffmeister M, Brenner H. Colorectal cancer incidence, mortality, and stage distribution in European countries in the colorectal cancer screening era: an international population-based study. Lancet Oncol. 2021 Jul;22(7):1002-1013. doi: 10.1016/S1470-2045(21)00199-6. Epub 2021 May 25. PMID: 34048685.
Girardi F, Rous B, Stiller CA, Gatta G, Fersht N, Storm HH, Rodrigues JR, Herrmann C, Marcos-Gragera R, Peris-Bonet R, Valkov M, Weir HK, Woods RR, You H, Cueva PA, De P, Di Carlo V, Johannesen TB, Lima CA, Lynch CF, Coleman MP, Allemani C; CONCORD Working Group. The histology of brain tumors for 67 331 children and 671 085 adults diagnosed in 60 countries during 2000-2014: a global, population-based study (CONCORD-3). Neuro Oncol. 2021 Oct 1;23(10):1765-1776. doi: 10.1093/neuonc/noab067. PMID: 33738488; PMCID: PMC8485444.
Libânio D, Rodrigues JR, Bento MJ, Ebigbo A, Messman H, Verhoeven RHA, Van Damme N, Bisschops R, Spaander MCW, Dinis-Ribeiro M. Gastric cancer incidence and mortality trends 2007-2016 in three European countries. Endoscopy. 2022 Jul;54(7):644-652. doi: 10.1055/a-1673-1118. Epub 2021 Dec 16. PMID: 34666399.
Ghione P, Palomba ML, Patel AR, Bobillo S, Deighton K, Jacobson CA, Nahas M, Hatswell AJ, Jung AS, Kanters S, Snider JT, Neelapu SS, Ribeiro MT, Brookhart MA, Ghesquieres H, Radford J, Gribben JG. Comparative effectiveness of ZUMA-5 (axi-cel) vs SCHOLAR-5 external control in relapsed/refractory follicular lymphoma. Blood. 2022 Aug 25;140(8):851-860. doi: 10.1182/blood.2021014375. PMID: 35679476; PMCID: PMC9412012

COLABORAÇÕES NACIONAIS

Registo Oncológico Nacional de Todos os Tumores na População Residente em Portugal, em 2019
Registo Oncológico Nacional
A publicação do Registo Oncológico Nacional (RON) tem como objetivo a divulgação de informação relativa à incidência e mortalidade do cancro em Portugal em 2019. Os dados apresentados são relativos a todos os tumores na população residente em Portugal à data do diagnóstico, e não incluem os casos tratados ao abrigo de protocolos de cooperação, por exemplo, com os Países Africanos de Língua Oficial Portuguesa. A publicação compreende dados de incidência e mortalidade, mapas de distribuição de incidência dos principais tipos de tumor e a avaliação da qualidade da informação, através da razão mortalidade/incidência e da comparação com a incidência nacional de 2010 e 2018.

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

E-OEN – European Oncology Evidence Network
A Rede Europeia de Dados em Oncologia é uma rede de investigação que inclui os maiores hospitais que tratam cancro na Europa e que trabalham com a IQVIA para fornecer dados reais de alta qualidade que refletem a atual prática clínica. A rede E-OEN visa simplificar a disseminação de evidência científica atual através de dados do mundo real.

Link: https://www.iqvia.com/solutions/real-world-evidence/evidence-networks/oncology-evidence-network

VENUSCANCER – Women’s cancers: do variations in patterns of care explain the world-wide inequalities in survival and avoidable premature deaths?
O projeto VENUSCANCER, financiado pela UE, procura compreender as razões associadas diferentes padrões de sobrevivência e mortes evitáveis em cancros que afetam mulheres em todo o mundo. Este projeto mostrará que é possível (a) recolher informação clínica completa e de alta qualidade ao nível da população, mesmo em países de baixo e médio rendimento; (b) explicar as desigualdades marcantes na sobrevivência ao cancro das mulheres em todo o mundo, e (c) resumir estas desigualdades num único número (mortes evitáveis) como uma ferramenta poderosa que motiva os decisores políticos a reduzir as desigualdades na sobrevivência.

Link: https://cordis.europa.eu/project/id/772345

PancreOS – Pancreatic cancer overall survival registry in Europe
O PancreOS pretende ser uma rede europeia de registos de cancro do pâncreas para melhorar a recolha de um conjunto abrangente de dados prospetivos de doentes com cancro do pâncreas em qualquer fase da doença, de modo a preencher a lacuna da falta de recolha organizada de dados e promover uma melhor compreensão da doença e o desenvolvimento de estratégias de diagnóstico mais eficazes e tratamentos personalizados. Os objetivos específicos são: implementar uma rede europeia de registos de cancro do pâncreas para fornecer uma visão abrangente da gestão dos doentes com cancro do pâncreas na Europa; identificar e apresentar as desigualdades na notificação de dados sobre o cancro do pâncreas; promover uma melhor compreensão da doença e o desenvolvimento de estratégias de diagnóstico mais eficazes e tratamentos personalizados.

Link: https://pancreaticcancereurope.eu/project/pancreos-pancreatic-cancer-overall-survival-registry-in-europe-2021/

VOICE – Value based healthcare for Outcomes In breast and lung Cancer in Europe
O projeto baseia-se no modelo de Value-Based Health Care (VBHC) que propõe um quadro estratégico inovador destinado a orientar os serviços de saúde na sua reorganização, com o objetivo de proporcionar aos doentes cuidados de saúde de maior valor ao melhor custo, focando-se nos cancros da mama e do pulmão.

Link: https://www.kronikgune.org/en/european-community-voice/
www.kronikgune.org/en/the-voice-community-nominated-for-the-value-based-dragons-grant-endorsement-2021-awards/

DigiCore – DiGital Institute for Cancer Outcomes Research
DIGICORE é uma rede de investigação pan-europeia criada para acelerar a implementação da oncologia de precisão na Europa. A rede DIGICORE promove a utilização de rotina de registos de saúde eletrónicos e de informações de diagnóstico molecular para automatizar ensaios, investigação em resultados do mundo real, diagnóstico digital e gestão da qualidade dos cuidados. O objetivo é moldar uma infraestrutura de investigação digital baseada na interoperabilidade digital entre seus membros. A rede promove a melhoria da qualidade e integridade dos dados, desenvolvimento de novas fontes e ferramentas de dados, partilhada das melhores práticas digitais e promoção de métodos de investigação inovadores.

Link: https://digicore-cancer.eu/

OECI Working Group on Cancer Economics and Benchmarking
Prof. Wim H. van Harten
O grupo de trabalho tem como principais objetivos demonstrar a potencialidade das análises custo-benefício em oncologia e estabelecer normas para a elaboração de análise de impacto orçamental para os membros da OECI.

Link: https://www.oeci.eu/WG.aspx?id=12&group=1

IPAAC – Innovative Partnership for Action Against Cancer WP7 PILOT 2
Italian National Institute of Health, Italy
A Ação Conjunta IPAAC reúne 24 Parceiros Associados (com Entidades Afiliadas, 44 parceiros) em toda a Europa, e os principais objetivos são aproveitar os resultados da Ação Conjunta CANCON e implementar abordagens inovadoras para o controlo do cancro. O principal produto desta ação conjunta será um roteiro para a implementação e sustentabilidade das ações de luta contra o cancro.

Link: https://www.ipaac.eu/

CONCORD – Global surveillance of cancer survival
London School of Hygiene & Tropical Medicine, UK
O CONCORD é o programa de vigilância mundial das tendências de sobrevivência de cancro, liderado pela London School of Hygiene & Tropical Medicine. O programa CONCORD conta com a colaboração de 40 agências nacionais e internacionais, incluindo a OMS EURO, a Organização para Cooperação e Desenvolvimento Econômico (OCDE) e o Banco Mundial.

Link: https://csg.lshtm.ac.uk/research/themes/concord-programme/

WASABY – WAter & Soil contamination and Awareness on Breast cancer risk in Young women
Istituto Nazionale Tumori di Milano, Italy
O projeto WASABY propõe o desenho de um modelo capaz de identificar áreas com maiores taxas de cancro, para estudar em que medida a contaminação por poluentes pode ser uma causa para o aumento do risco de cancro. Assim, visa melhorar a saúde dos cidadãos da União Europeia e reduzir as desigualdades na saúde.

Link: http://www.wasabysite.it/

EUROCARE – Survival of cancer patients in Europe
Instituto Nazionale Tumori di Milano and of the Italian National Institute of Health, Italy
O projeto EUROCARE é o maior projeto de investigação colaborativa sobre a sobrevivência de doentes com cancro na Europa. O projeto começou em 1989 sob a iniciativa do Istituto Nazionale Tumori (Milão, Itália) e do Istituto Superiore di Sanità (Roma, Itália), com a participação de vários registos oncológicos de toda a Europa. Os objetivos do estudo são: fornecer uma descrição atualizada das tendências e diferenças do tempo de sobrevivência de cancro entre os países europeus, medir a prevalência de cancro e estudar os padrões de cuidados de saúde fornecidos aos doentes oncológicos.

Link: http://www.eurocare.it/

RARECAREnet – Surveillance of Rare Cancers in Europe
Istituto Nazionale Tumori di Milano, Italy
Com base na experiência do projeto anterior RARECARE e, em colaboração com Rare Cancers Europe, o projeto RARECARENet visa construir uma rede abrangente de informação de cancros raros para ser disseminada pela comunidade (oncologistas, clínicos gerais, investigadores, autoridades de saúde, doentes e seus familiares).

Link: https://www.rarecarenet.eu/

IICC – International Incidence of Childhood Cancer
International Agency for Research on Cancer (IARC) and the International Association of Cancer Registries (IACR), France
Este projeto tem como objetivo divulgar os dados disponíveis sobre a incidência de cancro infantil em todo o mundo através da publicação do terceiro volume da série IICC (IICC-3). Para este propósito foram recolhidos, validados, analisados e avaliados dados fornecidos por 440 registros oncológicos dos cinco continentes.

Link: https://iicc.iarc.fr/

EURECCA – EUropean REgistry of Cancer CAre or EURopEan CanCer Audit
ESSO (European Society of Surgical Oncology), Belgium
EURECCA é uma plataforma multidisciplinar internacional de clínicos e epidemiologistas que tem como objetivo melhorar a qualidade dos cuidados prestados em oncologia por meio de registro de dados, feedback, formação de planos de melhoria e partilha de conhecimento sobre desempenho e ciência. O projeto EURECCA visa ampliar a plataforma e a infraestrutura europeia para cooperar com os registros nacionais ou estruturas de auditoria, expandir a cobertura dos dados sobre resultados dos doentes com cancro e auditar a qualidade do tratamento multidisciplinar do cancro.

Link: https://www.essoweb.org/projects/eurecca-cancer-care/

EurocanPlatform for Translational Cancer Research
Karolinska Institutet, Sweden
O objetivo da EurocanPlatform é diminuir a mortalidade por cancro, através de três áreas principais de investigação estratégica: prevenção, deteção precoce e melhoria do tratamento. Pretende construir os recursos e know-how necessários para todo o continuum da investigação desde a investigação básica, investigação translacional inicial e tardia, investigação clínica e epidemiológica, implementação de cuidados e investigação em resultados de saúde a nível populacional.

Link: https://eurocanplatform.eu/category/industries/

UNCAN.eu, a European initiative to UNderstand CANcer
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, France
A iniciativa UNCAN.eu pretende criar um centro europeu de dados federados de investigação em oncologia e gerar uma série de casos de uso, abordando os principais desafios na investigação em cancro. Os resultados desses casos de uso alimentarão o hub de dados de investigação em cancro que serão localizáveis, acessíveis, interoperáveis e reutilizáveis (FAIR). Estes dados de investigação serão combinados com dados da saúde dos pacientes e quaisquer outros dados relevantes (por exemplo, informação de coortes longitudinais, observações geográficas, dados de consumo e estilo de vida) numa escala sem precedentes.

Link: https://uncan.eu/

GRELL – Group for Cancer Epidemiology and Registration in Latin Language Countries

Link: https://www.grell-network.org/

CRICCS – Cancer Risk in Childhood Cancer Survivors: understanding the causes to target prevention

Link: https://criccs.iarc.who.int/

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respetivo coordenador.

Grupo de Epigenética & Biologia do Cancro

O GEBC foi estabelecido em 2008 e integra investigadores pré- e pós-doutorados, com formação académica diversa, incluindo Biólogos, Bioquímicos, licenciados em Anatomia Patológica, Citológica e Tanatológica e Médicos de várias especialidades, incluindo Patologistas, Urologistas, Ginecologistas, Radiologistas, Hemato-oncologistas e Oncologistas.

No contexto da Oncologia de Precisão, estamos a desenvolver vários projetos de investigação fundamental e pré-clincal em biologia do cancro centrados nos pacientes e com foco na biologia dos tumores, biopatologia, epigenética, epitranscriptómica, metabolismo tumoral e imunologia.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Carmen Jerónimo, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4186-5345 / CE16-29CB-EDD1
Investigadora Auxiliar
Diretora do Centro de Investigação
Coordenadora da TL2 – Cancro / CI-IPOP@RISE-Laboratório Associado
Coordenadora Científica do Banco de Tumores – Serviço de Anatomia Patológica
Professora Catedrática Convidada do ICBAS-UP
Presidente ASPIC – Associação Portuguesa de Investigação em Cancro
Chair da Secção de Investigação de Translação da Associação Europeia de Urologia
E-mail: carmenjeronimo@ipoporto.min-saude.pt/ cljeronimo@icbas.up.pt

EQUIPA
Investigadores Sénior

Rui Henrique, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-3171-4666 / 641F-FE09-15E6
Investigador Sénior
Assistente graduado sénior de Anatomia Patológica e Diretor, Serviço de Anatomia Patológica
Professor Catedrático Convidado do ICBAS-UP
E-mail: henrique@ipoporto.min-saude.pt/ rmhenrique@icbas.up.pt

Margareta P. Correia, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4378-0820 / CB11-3261-9D4F
Investigadora Auxiliar
Líder do tópico de investigação: Onco-Imuno-Epigenética
Docente do ICBAS-UP ao abrigo do Protocolo IPO Porto & ICBAS-UP
E-mail: margareta.correia@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Carla Bartosch, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-0646-7667 / 881F-BDAC-46FE
Assistente graduada de Anatomia Patológica, Serviço de Anatomia Patológica
Líder do tópico de investigação: Tumores Ginecológicos
Docente em Patologia do ICBAS-UP ao abrigo do Protocolo IPO Porto & ICBAS-UP
E-mail: carla.bartosch@ipoporto.min-saude.pt

João Lobo, MD, PhD
Assistente de Anatomia Patológica, Serviço de Anatomia Patológica
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-6829-1391 / 8A14-8221-1CBF
Líder do tópico de investigação: Tumores do Testículo
Prof. Auxiliar Convidado, ICBAS-UP
E-mail: jpedro.lobo@ipoporto.min-saude.pt

María Gallardo Gómez, PhD
Investigadora de Pós-Doutoramento – Instituto de Investigación Sanitaria Galicia Sur (IISGS), Vigo, Espanha
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4856-9322 / 3B13-67B3-72E2
E-mail: maria.gomez@ipoporto.min-saude.pt

Sara Monteiro-Reis, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-2193-2793 / 3014-05F4-935F
Gestora Projeto – EUnetCCC JA
Docente do ICBAS-UP ao abrigo do Protocolo IPO Porto & ICBAS-UP
E-mail: sara.reis@ipoporto.min-saude.pt

Vera Miranda-Gonçalves, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4231-5532 / 8E1B-B722-284F
Gestora Laboratório 3
Docente do ICBAS-UP ao abrigo do Protocolo IPO Porto & ICBAS-UP
E-mail: vera.miranda.goncalves@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Diana Montezuma, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-9551-4589 / 8614-D72D-4861
E-mail: diana.m.felizardo@ipoporto.min-saude.pt

Liliana Raimundo, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-9003-2601 / B21B-623F-AA05
E-mail: liliana.raimundo@ipoporto.min-saude.pt

Sofia Salta, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-6707-1263 / 6119-2B18-6A26;
E-mail: sofia.salta@ipoporto.min-saude.pt

Óscar Rapado González, DDS, PhD
Investigador de Pós-Doutoramento – Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago de Compostela (IDIS), Santiago de Compostela, Espanha
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8419-7004 / C019-EAAE-BBB8
E-mail: oscar.gonzalez@ipoporto.min-saude.pt

Agnese Orsatti, MD
Interna de Anatomia Patológica – Universidade de Bologna, Itália
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0005-8560-1925 / 3614-3DC8-B863
E-mail: agnese.orsatti@studio.unibo.it

Estudantes de Doutoramento

Com Financiamento Externo

Orientação
Amal Magdy Mohamed, MSc (em colaboração com KU Leuven, Belgium; PROSTAMET – H2020 MSCA-GA No. 101120283)
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0004-0514-9725 / BB1D-00E9-DB8C
E-mail: aml.mohamed@ipoporto.min-saude.pt

Ana Teixeira-Marques, MSc (em colaboração com i3S/ Centro de investigación Hospital Universitario 12 de Octubre, Espanha; FCT2023.01232.BD);
ORCID ID/Ciência ID: 0000-0003-1396-3466/ 601F-802B-922D;
E-mail: ana.t.marques@ipoporto.min-saude.pt

Catarina Lourenço, MSc (em colaboração com i3S; FCT2021.06731.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-0644-0202/ 9A1E-2DE0-A004;
E-mail: i37296@ipoporto.min-saude.pt

Filipa Domingues dos Reis, MSc (em colaboração com Leiden University Medical Center, The Netherlands; FCT UI/BD/154816/2023);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-9897-5612/ C014-A6CE-0341;
E-mail: filipa.reis@ipoporto.min-saude.pt

Filipa Moreira Silva, MSc (em colaboração com Bern Univ Hospital, Bern, Switzerland; FCT 2023.00300.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-7272-7300/ 7019-D06D-3E3F;
E-mail: filipa.m.silva@ipoporto.min-saude.pt

Íris da Rocha Carriço, MSc (em colaboração com MFRRP; FCT UI/BD/154815/2023);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4977-8273/ 3617-1D5C-EE2D;
E-mail: iris.carrico@ipoporto.min-saude.pt

João Martins da Gama, MD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5274-4114 / 9E1A-51E8-0B2C
E-mail: joaomartinsgama@gmail.com

João Moura e Silva, MD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8579-6543 / 241A-85E2-1BF3
E-mail: jricardo.moura.silva@gmail.com

José Pedro Sequeira, MSc (em colaboração com Health Research Institute of Santiago de Compostela-IDIS, Spain; FCT2022.11060.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4687-3347/ FE1E-E1CF-6983;
E-mail: jose.leite.sequeira@ipoporto.min-saude.pt

Marta Avelar, MSc (em colaboração com i3S; FCT2025.02786.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-1961-6513 / 331A-DB95-F399
E-mail: marta.avelar@ipoporto.min-saude.pt

Nuno Tiago Tavares, MSc (em colaboração com University of California, San Diego, USA; FCT2022.09566.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8426-1838/ 2718-0ED1-9F74;
E-mail: i38161@ipoporto.min-saude.pt

Vera Constâncio, MSc (em colaboração com Champalimaud Foundation/Beatson Institute, Glasgow, Scotland; LCF/BQ/DR20/11790013);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3151-0367/ 3116-280A-8462;
E-mail: vera.salvado.constancio@ipoporto.min-saude.pt

Co-Orientação

Mariana Carvalho, MSc (INEGI; FCT2022.09480.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8620-9718/ 7713-CE2C-47D2;
E-mail: mariana.carvalho@ipoporto.min-saude.pt

Maria Miguel Castro, MSc (i3S; FCT2020.07439.BD);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5016-2567/ F41B-905E-E21F;
E-mail: mcastro@i3s.up.pt

Sanjana Vig, MSc (REQUIMTE;H2020 MSCA-GA ID: 861138);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-7939-6500/ 911E-5E8D-888C;
E-mail: sanjana@fmd.up.pt

IPO PORTO STAFF

Ana Fernandes Rodrigues, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-2955-055 / 371A-3A6B-696F;
E-mail: ana.fernandes.rodrigues@ipoporto.min-saude.pt

Carlos Ochoa Leite, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-0489-9677 / 7B14-471C-19A5;
E-mail: carlos.ochoa.leite@ipoporto.min-saude.pt

Carina Carvalho-Maia, MSc;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-7011-8341 / B116-C629-89AC;
E-mail: i13035@ipoporto.min-saude.pt

Isaac Braga, MD (in collaboration with CHUP);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-9265-4324 / A31B-745C-57EA;
E-mail: isaac.braga@ipoporto.min-saude.pt

João André Carvalho, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8564-2050 / B318-599E-9623;
E-mail: joao.m.carvalho@ipoporto.min-saude.pt

Lígia Gonçalves, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5864-8526 / 0D10-301A-79F6;
E-mail: ligiagoncalves@ipoporto.min-saude.pt

Mónica Pires, MD (CINTESIS@RISE);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-2238-5135/ 451E-BFE8-40BF;
E-mail: monica.pires@ipoporto.min-saude.pt

Rui Freitas, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4448-6458/ F01F-89CB-26E6;
E-mail: antoniofreitas@ipoporto.min-saude.pt

Rui Silva-Santos, MSc; Pathology Technician
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-6392-1785/ 0E14-7605-B96D;
E-mail: rui.silva.santos@ipoporto.min-saude.pt

Sérgio Chacim, MD;
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-6316-8789/ A317-C226-0F98; E-mail: sergio.chacim@ipoporto.min-saude.pt

Sofia Paulino, MSc; Pathology Technician
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-1244-4066/ C31D-B4FF-D098
E-mail: sofia.paulino@ipoporto.min-saude.pt

Técnicos Superiores/Assistentes de Investigação

Fernanda Fernandes-Pontes, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0007-3931-0443 / 1C19-894E-FD30
E-mail: fernanda.pontes@ipoporto.min-saude.pt

Mariana Lima-Costa, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0001-3257-3693 / 261D-7564-4CD4
E-mail: mariana.l.costa@ipoporto.min-saude.pt

Mariana Silva-Ferreira, MSc (PTDC/EME-APL/1342/2020);
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5896-051X/ 521F-556D-5E8E;
E-mail: mariana.ferreira@ipoporto.min-saude.pt

Estudantes de Mestrado

Anatasiia Ponosova; Integrated Master in Medicine, ICBAS-UP
Bárbara Amorim Fernandes, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Beatriz Parente Gonçalves, BSc, Master in Bioengineering, FEUP/ICBAS-UP
Berta Camille, BSc, Master in Biomedical Sciences-Molecular Mechanisms of Diseases, University of Antwerp, Belgium
Diana Almeida-Pereira, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Emilie Van Oproy, BSc, Master in Biomedical Sciences-Molecular Mechanisms of Diseases, University of Antwerp, Belgium
Francesca Roma, BSc; Master in Molecular Medicine & Medical Biotechnology, University of Bari, Italy
Gabriela Assunção, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Gonçalo Silva-Rodrigues, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Jéssica Cordeiro, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Jéssica Sousa, BSc; Master in Molecular and Cellular Biology, FCUP
Lara Silva Cunha; Integrated Master in Medicine, ICBAS-UP
Margarida Morais, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Maria Inês Reis, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Mariana Melo e Costa, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP
Marta Rodrigues, BSc; Master in Oncology, ICBAS-UP

Outros colaboradores

Alexandra Lapa, MSc; Resident in Pathology
Ana Isabel Varelas, MSc; Attending Pathologist
Ana Luísa Cunha, MD; Consultant Pathologist
Ana Teresa Martins, MSc; Pathology Technician
Andreia Coutada, MSc; Resident in Pathology
Ângelo Rodrigues, MD; Consultant Pathologist
Candy Paiva, BSc; Pathology Technician
Carla Renata Dias, MD; Consultant Pathologist
Carolina Duque, MSc; Resident in Pathology
Davide Gigliano, MD; Attending Pathologist
Fernanda Silva, BSc; Pathology Technician
Isa Carneiro, MSc; Pathology Technician
Jorge Torres-Ferreira, MSc; Pathology Technician
Júlia Azevedo, MD; Resident in Pathology
Maria Alzamora; MD; Resident in Pathology
Nuno Coimbra, MD; Consultant Pathologist
Paula Dias, BSc; Pathology Technician
Paula Lopes, BSc; Pathology Technician
Paula Monteiro, MD; Consultant Pathologist
Renata Vieira, BSc; Pathology Technician
Rita Guimarães, MSc; Pathology Technician
Sérgio Lopes, PhD; Cell Therapy Clinical Scientist
Verónica Ferreira, BSc; Pathology Technician

Objectivos

O objectivo principal do nosso grupo é descrever em profundidade mecanismos de epigenética/epitranscriptómica envolvidos na carcinogénese, que possam ser utilizados como ferramentas clínicas para a detecção precoce, diagnóstico, prognóstico, e predição à terapia. A investigação de mecanismos e funções de fármacos de modulação epigenética (epi-fármacos) é outro objectivo importante. Para além disso, devido à relevância que a imuno-oncologia tem vindo a demonstrar em anos recentes, estamos também a explorar a modulação epigenética de biomoléculas envolvidas em respostas imunes, com o objectivo de melhorar estratégias imunoterapêuticas.

PROJECTOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO (CLIQUE PARA MAIS INFORMAÇÕES)

PROJECTOS COM FINANCIAMENTO INTERNO (CLIQUE PARA MAIS INFORMAÇÕES)

PATENTES

(2012) Methods and biomarkers for detection of bladder cancer; US 20130210011/ EP 2630261 A1/ WO 2012052844 A1 (in collaboration Oslo University Hospital)

(2023) Prostate cancer recurrence risk calculator; Provisional Patent PT 20242005764083

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

Aditya Bagrodia | University of California San Diego, USA
Alejandro Sifrim & Johan Swinnem | KU Leuven, Belgium
Ángel Díaz-Lagares | Epigenomics Unit, Translational Medical Oncology (Oncomet), Health Research Institute of Santiago de Compostela-IDIS, Spain
Catherine Muller | IPBS-CNRS, Université de Toulouse, France
Elena Martens-Uzunova | Erasmus Medical Center, Rotterdam, The Netherlands
Florence Le Calvez-Kelm | IARC, Lyon, France
Gabri van der Pluijm | Leiden University Medical Center, The Netherlands
Giuseppina Carbone | Belinzona, Switzerland
Guro Lind | Radium Hospital, Oslo, Norway
Hector Peinado CNIO, Madrid, Spain
Hing Leung | CRUK-Glasgow, UK
Isabelle Bernard-Pierrot | Institut Curie, Paris, France
Jesús M. Paramio & Marta Dueñas | Biomedical Research Institute I+12, University Hospital “12 de Octubre”, Madrid, Spain
Laura Muinelo-Romay & María Mercedes Suárez-Cunqueiro | Liquid Biopsy Analysis Unit, Translational Medical Oncology (Oncomet), Health Research Institute of Santiago de Compostela-IDIS, Spain
Lucia Altucci | Università degli studi della Campania “Luigi Vanvitelli”, Naples, Italy
Manel Esteller | Josep Carreras Leukaemia Research Institute, Barcelona, Spain
Marianna Kruithof-de Julio | Bern Univ Hospital, Switzerland
Mónica Martínez-Fernández, CIMUS, University of Santiago de Compostela, Spain
Paola Arimondo | Institute Pasteur, Paris, France
Sandra Blanco | Centro de Investigación del Cáncer, Salamanca, Spain
Wilbert Zwart | NKI, Amsterdam, The Netherlands
Valérie Taly | Université Paris Descartes, Paris, France

*The information described in the group is the sole responsibility of the respective coordinator.

Grupo de Física Médica, Radiobiologia & Proteção Radiológica

O Grupo de Física Médica, Radiobiologia & Protecção Contra Radiações foi formado no início de 2008, no seio do Centro de Investigação do IPO-Porto. Os seus membros são principalmente físicos e radiobiólogos, mas também incluem outras especialidades, como radiofarmácia e clínicos. É o único grupo de investigação em Física Médica e Radiobiologia em Portugal cujas actividades são desenvolvidas inteiramente em ambiente hospitalar.

O grupo conta com dois membros efectivos (J.A.M. Santos e P.P. Teles) no Grupo Europeu de Dosimetria de Radiação (Eurados) e dois membros correspondentes (J. Lencart e A. G. Dias) nos Grupos de Trabalho 9 e 12, WG9 (Protecção Contra Radiações em Radioterapia), estando envolvido em várias colaborações nacionais e internacionais.

COORDENADOR CIENTÍFICO

João António Miranda dos Santos, PhD
João António Miranda dos Santos, PhD
ORCID ID: 0000-0003-2465-5143
CIENCIA ID: 2514-D31E-2F02
Físico Médico, Coordenador do Grupo, Membro da Comissão de Ética
E-mail: joao.santos@ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA

Investigadores Sénior

Anabela Gregório Dias, PhD
ORCID ID: 0000-0002-2777-321X/ CIENCIA ID: 4C12-5EAB-0C33
Física Médica
E-mail: anabela.dias@ipoporto.min-saude.pt

Isabel Maria Guedes Bravo, PhD
ORCID ID: 0000-0001-6445-6443
CIENCIA ID: 031C-23F5-F5B4
Radiobióloga/Assistente de Investigação
E-mail: isabel.bravo@ipoporto.min-saude.pt

Pedro Peixoto Teles, PhD
ORCID ID: 6D11-4C85-387C/ CIENCIA ID: C61C-4934-500F
Professor Auxiliar; FCUP/UP
E-mail: ppteles@fc.up.pt

Sofia Isabel de Castro e Silva, PhD
ORCID ID: 0000-0002-0056-6034/ CIENCIA ID: 6D11-4C85-387C
Física Médica, IPO Coimbra
E-mail: sofia.i.silva@ipocoimbra.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Inês Campos Monteiro Sabino Domingues, PhD
ORCID ID: 0000-0002-2334-7280/ CIENCIA ID: 971F-F25B-1E79
Professora Auxiliar; ISEC
E-mail: inesdomingues@gmail.com

Estudantes em Doutoramento

Bárbara Adélia Meireles Barbosa, MSc
ORCID ID: 0000-0003-0686-0397/ CIENCIA ID: 721A-00E6-BAC5
Técnica de Radioterapia
E-mail: barbara.barbosa@ipoporto.min-saude.pt

Bruno Miguel Ferreira Mendes, MSc
ORCID ID: 0000-0002-7574-7630
E-mail: brunomendes81@gmail.com

Sara Filipa Coelho Guerreiro, MSc
ORCID ID: 0000-0002-6652-2376/ CIENCIA ID: 7219-29B5-2DDF
School of Health of the Polytechnic of Leiria
E-mail: sara.f.guerreiro@ipleiria.pt

Alunos de Mestrado

Amizito Luís Rajabo
ORCID ID: 0009-0008-3439-7276/ CIENCIA ID: BF11-7036-81F9
E-mail: up202110020@edu.fc.up.pt

Rúben Diogo Oliveira Sousa
ORCID: 0000-0002-0776-5212/ CIÊNCIA ID: 2310-F2F9-4178
E-mail: ruben.d.sousa@ipoporto.min-saude.pt

Outros Colaboradores

Alexandre Baptista Mendes Pereira, BSc
ORCID ID: 0000-0001-8965-274X/ CIENCIA ID: 301D-A86A-60C0
Físico Médico
E-mail: apereira@ipoporto.min-saude.pt

António Luís Soares
CIENCIA ID: A817-239C-7AC4
Físico Médico
E-mail: Antonio.soares@ipoporto.min-saude.pt

Carla Isabel Vaz Tavares Figueiredo Capelo, BSc
CIENCIA ID: 9D1A-6422-C7F7
Radiofarmacêutica
E-mail: carla.capelo@ipoporto.min-saude.pt

Diana Jorge Pimparel Alves Nuno Pinto, BSc
ORCID ID: 0000-0003-2559-3407/ CIENCIA ID: D31C-57A9-559A
Física Médica
E-mail: diana.pinto@ipoporto.min-saude.pt

Filipe Augusto Madeira Dias, MSc
ORCID ID: 0000-0002-2992-5096/ CIENCIA ID: 5412-D0F2-2595
Físico Médico
E-mail: filipe.dias@ipoporto.min-saude.pt

Inês Magalhães da Silva de Lucena e Sampaio, MD, MSc
ORCID ID: 0000-0003-4578-2280/ CIENCIA ID: 3918-4909-EB6E
Especialista de Medicina Nuclear
E-mail: ines.lucena@ipoporto.min-saude.pt

Joana Borges Lencart e Silva, BSc
ORCID ID: 0000-0001-7078-7257/ CIENCIA ID: 7A1A-E9DB-BECE
Física Médica
E-mail: joana.lencart@ipoporto.min-saude.pt

Jorge Barbosa Pereira, MSc
ORCID ID: 0000-0002-7216-1191/ CIENCIA ID: BA13-D305-14A8
Físico Médico
E-mail: jorge.b.pereira@ipoporto.min-saude.pt

Luís Hugo da Silva Trindade Duarte, MD, BSc
ORCID ID: 0000-0002-6867-1180
Especialista de Medicina Nuclear
E-mail: hugo.duarte@ipoporto.min-saude.pt

Luís Paulo Teixeira Cunha, MSc
ORCID ID: 0000-0001-6012-6893/ CIENCIA ID: 7112-7B32-F43F
Físico Médico
E-mail: luis.cunha@ipoporto.min-saude.pt

Pedro Filipe Conde Andrade Silva, MSc
ORCID ID: 0000-0003-3962-4040/ CIENCIA ID: 161C-6CE9-1867
Técnico de Radioterapia e Radiologia
E-mail: pedro.andrade.silva@ipoporto.min-saude.pt

Rogéria Maria Craveiro Pereira, Msc
ORCID ID: 0000-0002-5786-2096/ CIENCIA ID: 0116-CFE3-35C7
Radiobióloga
E-mail: rogeriapereira@ipoporto.min-saude.pt

Sara Patrícia de Almeida Pinto
ORCID ID: 0000-0002-9863-2078/ CIENCIA ID: A214-DDBF-CA6E
Física Médica
E-mail: sara.pinto@ipoporto.min-saude.pt

Susana Margarida Oliveira Gonçalves
ORCID ID: 0000-0003-3036-5847/ CIENCIA ID: C119-01F8-B6F2
Dosimetrista
E-mail: susanamg@ipoporto.min-saude.pt

Vera Catarina Marques Antunes
ORCID ID: 0000-0001-7195-8791/ CIENCIA ID: 8516-92A5-7DE5
Física Médica
E-mail: vera.antunes@ipoporto.min-saude.pt

Rita Correia da Silva Alçada Albergueiro
ORCID: 0009-0009-3211-9501/ CIÊNCIA ID: F610-FB91-C98A
Física Médica
E-mail: ritaalbergueiro@gmail.com

OBJETIVOS

O grupo foca-se na aplicação da metodologia da física e da radiobiologia para resolver problemas específicos relacionados com os cuidados de saúde, especialmente radiações ionizantes, tanto na perspectiva da optimização dos procedimentos do paciente como na perspectiva da protecção em caso de exposição profissional a radiações ionizantes. Já abordou exposições pessoais críticas devido a campos de radiação altamente heterogéneos com simulações de Monte Carlo em fluoroscopia-CT e exposição de pacientes durante radioterapia intra-operatória. Esta metodologia, com o aumento da capacidade computacional nos últimos anos, está a tornar-se um método de referência para simular procedimentos em física de radiações ionizantes, onde a exposição dos sujeitos deve ser muito bem justificada.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

TIPTOP – Artificial Intelligence applied to image based oncological prognosis
PI 145-CI-IPOP-133-2020; Budget: 21.000.00€ (2019 – ongoing); PI: Prof. Inês Domingues

Métodos de inteligência artificial, nomeadamente Machine Learning e a sua componente de Deep Learning, podem ser usados para antecipar o prognóstico e a resposta à terapia. Das modalidades de imagem disponíveis no tratamento e diagnóstico de um paciente com cancro, a CT e a CBCT são amplamente utilizadas. Achados radiográficos têm mostrado uma correlação com diferenças significativas nos padrões de expressão proteica. Neste contexto, a extracção de características de imagens radiográficas usando algoritmos de caracterização de dados (Radiomics) pode fornecer uma ferramenta valiosa para a avaliação do cancro durante o tratamento. A hipótese por trás dos radiomics é que a análise quantitativa de imagens médicas pode ter um poder prognóstico semelhante aos fenótipos e assinaturas de proteínas de genes. A ideia é prever a agressividade do Cancro da Próstata a partir de imagens de TC e a eficácia da terapia de radiação a partir de imagens de CBCT. No entanto, as características são extraídas de uma região de interesse previamente delimitada. Para abordar esta questão, vários métodos de segmentação de imagem serão explorados para a próstata e órgãos de risco, como a bexiga e o recto. Clustering, U-Net, Active Contours e Graph-Based são alguns exemplos de métodos que serão explorados. Além disso, um cenário de segmentação multi-classe também é interessante, pois imita a segmentação manual holística de especialistas médicos.
Este projeto pretende explorar o uso de métodos de inteligência artificial e aumentar as imagens médicas com dados, potencialmente auxiliando na detecção, diagnóstico, prognóstico, respostas ao tratamento e monitorização da doença.

Obra3HT – Optimizing Breast Cancer treatment planning workflow: from 3DCRT to hybrid techniques
PI199-CI-IPOP-35-2023; Budget: 15.000.00€ (2023 – ongoing); PI: Dr. Joana Lencart

A radioterapia conformacional tridimensional (3DCRT) e a radioterapia de intensidade modulada (IMRT) são técnicas comuns utilizadas na radioterapia do cancro da mama. A 3DCRT emprega múltiplos feixes de radiação direcionados ao alvo a partir de diferentes ângulos, usando um colimador de múltiplas lâminas para moldar o feixe e minimizar a dose nos órgãos críticos próximos (OAR). A IMRT modula a intensidade de cada feixe para melhor conformar a dose à forma do alvo, muitas vezes resultando em doses mais baixas nos OAR. A radioterapia híbrida (RT), que combina ambas as técnicas, é utilizada na irradiação de toda a mama (WB) e no boost integrado simultâneo (SIB). Esta abordagem híbrida é particularmente útil quando a concavidade do alvo envolve um OAR, como o coração, ou quando o tumor é grande ou complexo, apresentando desafios para a 3DCRT sozinha em alcançar uma cobertura adequada do alvo mantendo as doses nos OAR dentro dos níveis de tolerância.
O projeto visa validar e propor a integração de técnicas híbridas (3DCRT-IMRT ou 3DCRT-VMAT) nos protocolos institucionais de radioterapia para a irradiação da mama inteira e avaliar a sua aplicabilidade a outros locais anatómicos. Uma seleção de pacientes com cancro da mama previamente tratados com 3DCRT, incluindo casos de mama esquerda e direita, será escolhida aleatoriamente. Planos clinicamente válidos serão gerados utilizando técnicas híbridas com o Sistema de Planeamento de Tratamento do serviço (Varian Eclipse v16.1) e software EZFluence para optimizar o componente 3DCRT. Tanto os algoritmos AAA como Acuros serão utilizados para os cálculos dos planos. A validação dos planos envolve três etapas usando software comercial e equipamento de controlo de qualidade: 1) ClearCheck (Radformation) irá extrair automaticamente as características dosimétricas do TPS para a cobertura do alvo e doses nos OAR; 2) ClearCalc (Radformation) servirá como uma ferramenta de cálculo independente para verificar a precisão; 3) Primo, uma ferramenta de planeamento de tratamento por Monte Carlo validada em projectos anteriores, fornecerá cálculos independentes adicionais. Além disso, a matriz 729 e o Verisoft (PTW), juntamente com outros métodos, serão usados como ferramentas de QA específicas para o paciente. Os planos validados serão agrupados por técnica, e uma análise estatística dos parâmetros dosimétricos relevantes será realizada para comparar as técnicas.

DoReMi – Development and implementation of a MRI-only guided radiotherapy workflow
PI200-CI-IPOP-36-2023; Budget: 13.000.00€ (2023 – ongoing); PI: Dr. Sara Pinto

Na última década, o planeamento de radioterapia (RT) tem utilizado cada vez mais tanto a tomografia computorizada (CT) como a imagiologia por ressonância magnética (MRI). A TC fornece valores de densidade eletrónica para cálculo da dose, enquanto a MRI oferece um contraste superior dos tecidos moles para uma melhor delimitação dos volumes alvo e dos órgãos em risco (OAR). A RT apenas com MRI está a tornar-se mais comum, pois reduz a exposição dos tecidos saudáveis à radiação ionizante derivada da TC, elimina erros de co-registo e diminui o uso de recursos e custos, reduzindo os esforços duplicados entre os departamentos de radiologia diagnóstica e radioterapia.

A MRI para planeamento difere da MRI diagnóstica ao usar scanners de maior diâmetro, mesas planas para dispositivos de imobilização compatíveis com MR, sistemas de laser externos e protocolos dedicados de controlo de qualidade e imagem. Introduzir a RT apenas com MRI na prática clínica apresenta desafios, como o movimento do paciente durante a aquisição e a garantia de precisão geométrica. A precisão geométrica é crucial para avaliar a adequação dos scanners de MRI para planeamento de RT, especialmente para radiocirurgia/radioterapia estereotática (SRS/SRT). O processamento de imagem na radiologia diagnóstica foca-se no contraste qualitativo dos tecidos, em vez da precisão anatómica a nível milimétrico. Consequentemente, os radioncologistas podem usar scans de MRI não corrigidos ou parcialmente corrigidos para planeamento de SRS/SRT. Ainda não foi estabelecido um procedimento padrão abrangente para a correção de distorção na MRI, embora a American Association of Physicists in Medicine (AAPM) esteja a trabalhar em diretrizes. Um protocolo de QA clinicamente viável é necessário para medir a precisão geométrica das imagens de MRI e avaliar a estabilidade a longo prazo.

Optimizar protocolos de MRI para planeamento de RT envolve maximizar a resolução espacial e o contraste dos tecidos, minimizar o tempo de aquisição e manter a congruência anatómica apesar do movimento. Compromissos são necessários, pois a optimização simultânea de todos os fatores é impossível. A relação sinal-ruído (SNR) afecta a percepção das estruturas em imagens de baixa resolução e a distinção de objetos pequenos. Como os pacientes são diagnosticados antes da MRI para RT, uma SNR mais fraca pode ser aceitável se outros parâmetros de qualidade da imagem melhorarem.

A alta resolução espacial, particularmente a espessura de corte, é necessária para distinguir pequenas lesões ou estruturas. No entanto, alta resolução por si só não garante visibilidade sem contraste de imagem suficiente ou SNR. A optimização da imagem requer um equilíbrio entre a resolução espacial adequada para SNR suficiente e a capacidade de ver detalhes finos, mantendo um tempo de aquisição razoável. Os departamentos de radiologia focam-se no diagnóstico preciso, enquanto a radioterapia necessita de imagens que suportem um tratamento eficaz e seguro. A optimização da MRI para RT é demorada, muitas vezes duplicando o tempo de aquisição, e pode necessitar de sacrificar SNR para o conforto do paciente durante a aquisição.

RaAITo – Development of a Chatbot for Radiotherapy using Artificial Intelligence Tools
PI201-CI-IPOP-37-2023; Budget: 15.000.00€ (2023 – ongoing); PI: Dr. Bárbara Barbosa

Face à quarta revolução industrial, mais especificamente à era da digitalização da sociedade e da economia, a transição digital é considerada um instrumento de sustentabilidade para o nosso país, alinhado com os interesses de desenvolvimento e investimentos da União Europeia. Neste contexto, torna-se imperativo desenvolver programas e estratégias que visem impulsionar a competitividade digital e económica. A literatura recente aponta a Inteligência Artificial (IA) como uma área científica cada vez mais influente na resolução de problemas no sector da saúde. Os métodos de IA permitem a resolução de problemas em ambientes clínicos e suportam o processo de tomada de decisão de forma automatizada e inteligente. Atualmente, dada a crescente demanda dos utilizadores de radioterapia por respostas rápidas e eficientes às suas questões ao contactar a instituição e o elevado tempo despendido pelos especialistas, sugere-se a criação de um chatbot utilizando ferramentas de IA. Os chatbots conversacionais usam Processamento de Linguagem Natural (NLP) e Compreensão de Linguagem Natural (NLU), aplicações de IA que permitem às máquinas entender a linguagem humana e as intenções.

Para a implementação deste projeto, o plano de ação seria o desenvolvimento de um chatbot pela equipa de investigação com a colaboração de um estudante de mestrado e um bolseiro. Atualmente, existem várias soluções altamente personalizáveis e fáceis de implementar. Por exemplo, a Google oferece a API de Linguagem Natural para Cuidados de Saúde, especificamente desenhada para analisar texto médico não estruturado e suficientemente flexível para se integrar facilmente com os sistemas internos existentes de uma instituição.

Como regra geral, a implementação desta tecnologia exigirá a criação de um dicionário de intenções (base de dados) pela equipa multidisciplinar do departamento de radioterapia, que permitirá a integração das diferentes especialidades dos profissionais desta área. Cada intenção de conversa contém:

– uma etiqueta (definindo qual é a intenção);
– padrões (padrões de frases para o classificador de texto da rede neural);
– respostas possíveis.

As definições das intenções conversacionais são transformadas num modelo, e uma estrutura de vocabulário é construída para o chatbot processar as respostas. Para aumentar a qualidade e o âmbito da construção deste dicionário de intenções, será também realizado um inquérito por profissionais de diferentes especialidades. Para garantir a relevância e continuidade do projeto, serão implementadas medidas de controlo de qualidade e impacto. Uma abordagem possível seria uma classificação por estrelas do desempenho do chatbot pelo utilizador no final da conversa.

Uma abordagem multidisciplinar é necessária para a gestão de pacientes com cancro. Uma equipa de médicos, físicos, técnicos e enfermeiros proporciona cuidados centrados no paciente e permite a tomada de decisão em diferentes pontos do seu tratamento. Os serviços de apoio, como o atendimento ao cliente para responder a perguntas, também se tornaram uma parte importante dos cuidados oncológicos. Melhorar estes serviços significa garantir a qualidade dos serviços prestados e a continuidade de uma relação próxima entre a instituição e o paciente. Esta proximidade fortalecerá a imagem de excelência e inovação do IPO Porto, baseada na estratégia nacional de modernização administrativa e transformação digital.

LuPET – Lu-177 radiotherapy outcome prediction using image data from Ga-68 PET/CT scans
PI202-CI-IPOP-38-2023; Budget: 10.000.00€ (2023 – ongoing); PI: Prof. João Santos

O projeto visa prever os resultados da radioterapia com Lutécio-177 (Lu-177) em pacientes com tumores neuroendócrinos (NET) utilizando dados de imagem de scans PET/CT com Gálio-68 (Ga-68). Os NETs são malignidades diversas originárias de células neuroendócrinas, e a Terapia com Receptor de Peptídeos Radiomarcados (PRRT) com Lu-177 DOTA-TATE é um tratamento eficaz para casos inoperáveis ou metastáticos. No entanto, as respostas dos pacientes variam, tornando necessária a identificação de marcadores preditivos para a resposta ao tratamento. A radiômica, que extrai características quantitativas dos dados de imagem médica, oferece uma abordagem promissora. O projeto envolverá os seguintes passos:

Recolha de Dados: Recolha retrospectiva de scans PET/CT com Ga-68 e dados clínicos de pacientes com NET tratados com PRRT com Lu-177. Assegurar aprovações éticas e consentimento dos pacientes para o uso dos dados.

Pré-processamento de Imagem: Padronizar as imagens PET/CT com Ga-68, realizando passos de pré-processamento necessários, como normalização, segmentação e registo, para garantir uniformidade e precisão na extração de características.

Extração de Características: Utilizar software de radiômica para extrair características quantitativas das imagens pré-processadas. Estas características podem incluir textura, forma, intensidade e características baseadas em wavelet que descrevem a heterogeneidade do tumor.

Análise de Dados: Integrar as características radiômicas extraídas com os dados clínicos, como demografia dos pacientes, parâmetros de tratamento e resultados. Realizar análise estatística para identificar características significativamente correlacionadas com a resposta à terapia.

Desenvolvimento de Modelos: Desenvolver modelos preditivos usando algoritmos de machine learning. Treinar os modelos em uma parte do conjunto de dados, validando e testando em subconjuntos separados para garantir robustez. Técnicas como validação cruzada, regularização e seleção de características serão empregadas para otimizar o desempenho do modelo.

Validação: Validar os modelos preditivos usando um conjunto de dados independente para confirmar a sua generalizabilidade e precisão. Serão calculadas métricas de desempenho como acurácia, sensibilidade, especificidade e área sob a curva (AUC).

Interpretação e Relatório: Analisar as saídas dos modelos para identificar características preditivas chave e a sua relevância clínica. Preparar relatórios compreensivos e visualizações para comunicar as descobertas aos stakeholders clínicos.

Implementação: Desenvolver diretrizes e ferramentas para implementar os modelos preditivos na prática clínica. Treinar os clínicos no uso destas ferramentas para melhorar o planeamento e a tomada de decisão no tratamento.

Avaliação: Avaliar continuamente o desempenho dos modelos num cenário clínico, fazendo ajustes necessários com base em feedback e novos dados.

A conclusão bem-sucedida deste projeto poderá melhorar significativamente a personalização da PRRT com Lu-177, levando a melhores resultados para os pacientes com NET.

TBIVMAT – Implementation of total body irradiation using volumetric modulated arc therapy as part of an institutional hematopoietic stem cell transplantation program
PI203-CI-IPOP-39-2023; Budget: 45.000.00€ (2023 – ongoing)
PI : Dra. Anabela Dias

A irradiação corporal total (TBI) com feixes de fotões de megavoltagem é utilizada no tratamento de mieloma múltiplo, leucemias, linfomas e alguns tumores sólidos, frequentemente em combinação com quimioterapia como parte do condicionamento antes do transplante alogénico de células estaminais hematopoiéticas. A TBI fornece uma dose uniforme a todo o corpo, alcançando áreas como o sistema nervoso central e os testículos, que a quimioterapia sozinha não consegue atingir. Permite também doses personalizadas através da protecção ou incremento de regiões específicas. A TBI convencional (cTBI) utiliza campos grandes com bloqueios pulmonares para irradiar todo o corpo em posições de pé ou deitado de lado, a distâncias prolongadas, exigindo grandes e dispendiosos recintos de proteção. A cTBI tem tempos de aplicação longos e não consegue poupar individualmente os órgãos em risco (OARs), resultando em toxicidade significativa.

Técnicas avançadas visam direcionar seletivamente os tecidos hematopoiéticos com células malignas enquanto poupam tecidos saudáveis. A irradiação total da medula óssea (TMI) é um tratamento conformacional do esqueleto e uma alternativa à TBI, melhorando a homogeneidade da dose com algoritmos de otimização inversa. A TMI com terapia de arco modulada por volume (VMAT) evita as complicações da cTBI enquanto mantém a eficácia. No entanto, modelos pré-clínicos limitados significam pouca compreensão das diferenças biológicas entre a TBI e a TMI e seus efeitos no enxerto de medula óssea.

Estudos mostram que as técnicas de VMAT reduzem o tempo de tratamento da TBI e melhoram a homogeneidade da dose, embora seu uso não seja generalizado. A VMAT melhora a conformidade e a homogeneidade na distribuição da dose, otimizando múltiplos arcos simultaneamente para planos complexos. Utilizar VMAT para TBI visa alcançar uma cobertura ótima do alvo e poupar OARs como os pulmões, potencialmente reduzindo os efeitos colaterais do tratamento. O desafio é o grande volume alvo de planeamento (PTV), que requer múltiplos tratamentos de arco sobrepostos e reposicionamento devido a limitações da mesa de tratamento.

Este projeto visa implementar a TBI utilizando VMAT num programa de transplante de células estaminais hematopoiéticas. Um fantoma de corpo inteiro é essencial, necessitando da criação de membros de fantoma RANDO. Embora a TBI seja administrada em posição supina, os pacientes precisam de reposicionamento devido aos limites da mesa de tratamento. Um objetivo secundário é desenvolver um sistema de mesa rotativa para planos multi-isocentro sem reposicionar os pacientes. Isso poderia levar a um tratamento 3D de alta precisão, oferecendo uma dose corporal total homogénea e poupando órgãos críticos em comparação com os métodos convencionais.

SyNTHaX – Synergistic effect of gold Nanoparticles in cancer hybrid Therapeutics: hyperthermia coupled with X-ray irradiation
PI204-CI-IPOP-40-2023; Budget: 22.600.00€ (2023 – ongoing); PI: Prof. Pedro Teles

No projeto SyNTHaX, vamos testar os efeitos sinergéticos da combinação de GNRT e hipertermia mediada por AuNPs em culturas de células MCF-7, que são células epiteliais isoladas do tecido mamário de uma paciente de 69 anos, branca, com adenocarcinoma metastático. Isso será feito em quatro modalidades diferentes além do grupo controlo. Numa modalidade, as células serão irradiadas com raios-X de 60 keV e depois excitadas com um laser pulsado otimizado para aquecimento das AuNPs. Na seguinte, as células serão primeiro excitadas com o mesmo laser, e depois irradiadas com os raios-X de 60 keV. Na terceira, serão irradiadas apenas com os raios X de 60 keV e, por fim, na quarta, será utilizado apenas o laser. A viabilidade celular será estudada usando o ensaio Alamar Blue. A resposta dos tecidos e as distribuições de nanopartículas serão medidas espacial e temporalmente usando plataformas de cancro de mama microfluídicas vascularizadas em 3D. As AuNPs serão sintetizadas e caracterizadas no IFIMUP, que já possui uma excelente experiência na fabricação e caracterização de NPs. A sua morfologia será otimizada para aquecimento com laser. Os cálculos de dosimetria serão feitos por meio de simulações de Monte Carlo utilizando códigos de última geração, que permitirão determinar os fatores de aumento de dose que podem ser correlacionados com a viabilidade celular.

Publicações

Amorim JP; Abreu P.H.; Santos, J.; Müller, H., Evaluating Post-hoc Interpretability with Intrinsic Interpretability, arXiv arXiv:2305.03002, https://doi.org/10.48550/arXiv.2305.03002 [IF: n.a.]

Amorim JP, Abreu PH, Santos J, Cortes M, Vila V, Evaluating the faithfulness of saliency maps in explaining deep learning models using realistic perturbations, Information Processing and Management, 60 (2023) 103225, https://doi.org/10.1016/j.ipm.2022.103225 [IF: 8.6]

Barbosa B, Oliveira C, Bravo I, Couto JG, Antunes L, McFadden S, Hughes C, McClure P, Rodrigues J, Dias A. An investigation of Digital Skills of Therapeutic Radiographers/Radiation Therapists: A European survey of proficiency level and future educational needs. Radiography.2023;29(3):479–88 https://doi.org/10.1016/j.radi.2023.02.009 [IF: 2.6]

Catarina Macedo-Silva, Vera Miranda-Gonçalves, Nuno Tiago Tavares, Daniela Barros-Silva, Joana Lencart, João Lobo, Ângelo Oliveira, Margareta P. Correia, Lucia Altucci, Carmen Jerónimo, Epigenetic regulation of TP53 is involved in prostate cancerradioresistance and DNA damage response signaling, Signal Transduction and Targeted Therapy, 2023, 8:395. [IF 39.3]

Silva, MM, Canha M, Salazar D, Neves JS, Ferreira G, Carvalho D, Duarte H, Efficacy, Toxicity, and Prognostic Factors of Re-treatment With [177Lu]Lu-DOTA-TATE in Patients With Progressing Neuroendocrine Tumors: The Experience of a Single Center, Cureus, 2023 Oct 23;15(10):e47506. doi: 10.7759/cureus.47506 [IF: 1.2]

Flood T, O’Neill A, Oliveira C, Barbosa B, Soares A, Muscat K, Guille S, McClure P, Hughes C, McFadden S. Patients’ perspectives of the skills and competencies of Therapy Radiographers/Radiation Therapists (TRs/RTTs) in the UK, Portugal and Malta; a qualitative study from the SAFEEUROPE project. Radiography. 2023;29:S117-S127. https://doi.org/10.1016/j.radi.2023.03.002 [IF: 2.6]

Flood, T., O’Neill, A., Oliveira, C., Barbosa, B., Soares, M. A. L., Muscat, M. K., Guille, S., Mc Clure, P., Hughes, C., & McFadden, S. 2023. “Patients’ perspectives of the skills and competencies of therapy radiographers/radiation therapists (TRs/RTTs) in the UK, Portugal and Malta; a qualitative study from the SAFE Europe project”. Radiography, 29, 1-11. https://doi.org/10.1016/j.radi.2023.03.002 [IF: 2.6]

Julian Malicki, Carla Lopes Castro, Magdalena Fundowicz, Marco Krengli5, Carmen Llacer-Moscardo, Sebastian Curcean, Carles Muñoz Montplet, Luisa Carvalho,Ewelina Konstanty, Tania Hernandez Barragan, Carla Pisani, Istvan Laszlo, Miquel Macià Garau, Marta Kruszyna-Mochalska, Joana Lencart, Dorota Zwierzchowska, Alvar Rosello Serrano, Adelina Brezae, Eva Loureiro Varela, Piotr Milecki, Micol Zannetti, Ovidiu Coza, Eva Gonzalez, Debora Beldì, Ferran Guedea, IROCA-TES: Improving Quality in Radiation Oncology through Clinical Audits — Training and Educationfor Standardization, Reports of Radiotherapy and Oncology, 2023, 28(3):429-432 [IF: 1.2]

Katarina Sjögreen-Gleisner, Glenn Flux, Klaus Bacher, Carlo Chiesa, Robin de Nijs, George C. Kagadis, Thiago Lima, Maria Lyra Georgosopoulou, Pablo Minguez Gabiña, Stephan Nekolla, Steffie Peters, Joao Santos, Bernhard Sattler, Caroline Stokke, Johannes Tran-Gia, Paddy Gilligan, Manuel Bardiès, EFOMP policy statement nº 19: Dosimetry in nuclear medicine therapy – Molecular radiotherapy, European Journal of Medical Physics, 116 (2023) 103166, https://doi.org/10.1016/j.ejmp.2023.103166 [IF: 3.4]

Mariana Morais, Vera Machado, Patrícia Figueiredo, Francisca Dias, Rogéria Craveiro, Joana Lencart, Carlos Palmeira, Kirsi S. Mikkonen, Ana Luísa Teixeira, Rui Medeiros, Silver Nanoparticles (AgNPs) as Enhancers of Everolimus and Radiotherapy Sensitivity on Clear Cell Renal Cell Carcinoma, Antioxidants, 2023, 12(12):2051. [IF 7.0]

Maurício J, I. Domingues, J. Bernardino. Comparing Vision Transformers and Convolutional Neural Networks for Image Classification: A Literature Review. Applied Sciences. 2023; 13(9): 5521. [IF: 2.7]

Mendes B, I. Domingues, F. Dias, J. Santos. Cone Beam Computed Tomography Radiomics for Prostate Cancer: Favourable vs Unfavourable Prognosis Prediction. Applied Sciences. 2023; 13(3):1378. [IF: 2.7]

Miriam Seoane Santos, Pedro Henriques Abreu, Nathalie Japkowicz, Alberto Fernández, João Santos, A unifying view of class overlap and imbalance: Key concepts, multi-view panorama, and open avenues for research, Information Fusion 89 (2023) 228–253, https://doi.org/10.1016/j.inffus.2022.08.017 [IF: 18.6]

O Neil A, Hughes C, McClure P, Barbosa B, Muscat K, Oliveira C, Soares AL, McFadden S. 2023. Patient-reported perspectives of therapeutic radiographers when undergoing radiotherapy. A European multi-centre study. Radiography 29:S32-S39. doi:10.1016/j.radi.2023.01.027 [IF: 2.6]

Oliveira C, Barbosa B, Couto JG, Bravo I, Hughes C, McFadden S, Khine R, McNair H. Advanced practice roles of therapeutic radiographers/radiation therapists: An European survey. .Radiography. 2023;29 (2): 261-273. DOI: 10.1016/j.radi.2022.12.003 [IF: 2.6]

Oliveira C, Barbosa B, Couto JG, Bravo I, Hughes C, McFadden S, Khine R, McNair H. Advanced practice amongst therapeutic radiographers/radiation therapists: Exploring the potential of the four pillars: preliminary results from a European perspective. J. Med. Imaging Rad Science 53 (4), S26_27 DOI: 10.1016/j.jmir.2022.10.088 [IF: 1.8]

Pires AM L. Carvalho, A.C. Santos, A.M. Vilaça, A.R. Coelho, F. Fernandes, L. Moreira,J. Lima, R. Vieira, M.J. Ferraz, M. Silva, P. Silva, R. Matias, S. Zorro, S. Costa, S. Sarandão,A.F. Barros, Radiotherapy skin marking with lancets versus electric marking pen (CONFORTATTOO)- 6 Months Results on Cosmesis, Fading, and Patients’ Satisfaction From a Randomized, Doubçe-Blind Trial, Radiography, VOLUME 9, ISSUE 3, 101404, MARCH, 2024 (Published:November 05, 2023) [IF: 2.6]

Pires AM, Borges F, Dias AG, Lencart J, Matos M, Gonçalves J, Paraffin gauze bolus as tissue compensator on photon irradiation for mycosis fungoides – regarding a case study, Journal of Radiotherapy in Practice 22 (e82) 2023. https://doi.org/10.1017/S1460396923000109 [IF: 0.148]

Rodrigues A, N. Rodrigues, J. Santinha, M. V. Lisitskaya, A. Uysal, C. Matos, I. Domingues, N. Papanikolaou. Value of handcrafted and deep radiomic features towards training robust machine learning classifiers for Prediction of Prostate Cancer Disease Aggressiveness. Scientific Reports. 2023; 13(6206). [IF: 4.6]

Soares AL, Buttigieg SC, Bak B, McFadden S, McClure P, Couto JG, Bravo I. A Review of the Applicability of Current Green Practices in Healthcare Facilities. Int J Health Policy Manag. 2023;12:6947. doi: 10.34172/ijhpm.2023.6947 [IF: 2.9]

Soares AL, Buttigieg SC, Couto JG, Bak B, McFadden S, Bravo I. An evaluation of knowledge of circular economy among Therapeutic Radiographers/Radiation Therapists (TR/RTTs): Results of a European survey to inform curriculum design. Radiography (Lond). 2023 Mar;29(2):274-283. doi:10.1016/j.radi.2022.12.006 [IF: 2.6]

Ana Arriaga; Cláudia Gonçalves; P. Teles; Joana Santos; Paula Simãozinho; Patrick Sousa, Establishment of local diagnostic reference levels for abdomen and chest radiographies in the region of Algarve, Portugal, European Journal of Radiology, 170 (2023) 111248, DOI: 10.1016/j.ejrad.2023.111248 [IF: 3.3]

Books, & Book Chapters

M. El Amine Bechar, N. Settouti, and I. Domingues, Deep Learning vs. Super Pixel Classification for Breast Masses Segmentation, Deep Learning for Biomedical Applications, Boca Raton: CRC Press, 2021, pp. 121–156, eBook ISBN9780367855611

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS (até 5)

Mendes B, I. Domingues, F. Dias, J. Santos. Cone Beam Computed Tomography Radiomics for Prostate Cancer: Favourable vs Unfavourable Prognosis Prediction. Applied Sciences. 2023; 13(3):1378. [IF: 2.7]

COLABORAÇÕES NACIONAIS

Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP)
Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar da Universidade do Porto (ICBAS)
Instituto Superior Técnico (IST/CTN)
INESC Porto
Universidade de Aveiro (Dep. Eng. Mecânica)
Universidade de Coimbra (Centro de Informática e Sistemas da Universidade de Coimbra; LIP)
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
Universidade do Minho (MEMS)

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

Institute of Nuclear Physics PAN; Krakow, Polónia
Institution: Radiation Chemistry and Dosimetry Laboratory; Country: Bijenička c. 54, HR-10000 Zagreb, Croatia
Greek Atomic Energy Commission (EEAE), Dosimetry and Calibration Department; Atenas, Grécia
Belgian Nuclear Research Centre, Unit Research in Dosimetric Applications; Bélgica
Safe and Free Exchange of EU Radiography Professionals across Europe (SAFE EUROPE); Multi-institutional; European Consortium
European Radiation Dosimetry Group – EURADOS; EURADOS e. V.

Grupo de Patologia & Terapêutica Experimental

O grupo dedica-se à compreensão dos mecanismos fisiopatológicos do cancro e à identificação de biomarcadores/alvos moleculares para oncologia de precisão, combinando estratégias multi-ómicas, engenharia genética, modelos celulares e animais. Desenvolve investigação básica, translacional e clínica com o objetivo de melhorar a gestão clínica do doente oncológico. O grupo trabalha em proximidade com empresas biofarmacêuticas e está ativamente comprometido com o desenvolvimento de soluções para melhoria dos cuidados de saúde em oncologia por meio da inovação, apoiando ensaios clínicos, novas empresas e treino pós-graduado. Apoia também a criação de unidades de investigação oncológica e centros clínicos nos países africanos de língua portuguesa.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Lúcio Lara Santos, MD; PhD
ORCID ID: 0000-0002-0521-5655
Cirurgião Sénior
Professor Associado com habilitação em cirurgia oncológica;
E-mail: lucio.santos@ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA

Investigadores Sénior

José Alexandre Ferreira, PhD
ORCID ID: 0000-0002-0097-6148
Investigador Auxiliar
Coordenador da linha de investigação “Glicobiologia de sistemas aplicado ao cancro”; CEO da start up GlycoMatters Biotech (www.glycomatters.com)
E-mail: jose.a.ferreira@ipoporto.min-saude.pt

Carlos Alberto Palmeira de Sousa, PhD
ORCID ID: 0000-0002-4833-2202
Técnico Superior de Saúde do Laboratório de Imunologia
Coordenador da linha de investigação “Imunologia do cancro”; Professor Auxiliar em Imunologia e Histopatologia
E-mail: carlospalmeira@ipoporto.min-saude.pt

Luís Carlos Oliveira Lima, PhD
ORCID ID: 0000-0001-8152-9237
Investigador Júnior
Coordenador da linha de investigação “Biomarcadores de cancro”
E-mail: luis.carlos.lima@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Andreia Filipa Ferreira Peixoto, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9514-0775
E-mail: andreia.peixoto@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Maria do Rosário Lima Viseu de Carvalho Pinto Leite, PhD
Colaboradora/ Geneticista
CHTMAD
E-mail: mlleite@chtmad.min-saude.pt

Doutorandos

Adriana Carneiro, MSc, CIPOP/ INL Braga; E-mail: adriana.carneiro@ipoporto.min-saude.pt
Ana Carolina Fernandes Vieira de Castro, MSc, IPOP; E-mail: ana.castro@ipoporto.min-saude.pt
Catarina Alexandra da Rocha Rodrigues, MSc, IPOP/ I3s; E-mail: catarina.rodrigues@ipoporto.min-saude.pt
Clara Alice Gentil Daher Mota, MSc, FADEUP / IPOP; E-mail: clara.mota@ipoporto.min-saude.pt
Dora Maria Barrocas Bernardo, MSc, IPOP; E-mail: dora.bernardo@ipoporto.min-saude.pt
Dylan Gomes Ferreira, MSc, IPOP/CIMA Institute; E-mail: i38795@ipoporto.min-saude.pt
Eliana Janine de Paiva Soares, MSc, IPOP/ UA; E-mail: eliana.paiva.soares@ipoporto.min-saude.pt
João Miguel Monteiro Antunes, MSc, IPOP/ FADEUP; E-mail: joao.monteiro.antunes@ipoporto.min-saude.pt
Maria de Fátima Sousa e Santos, MSc, IPOP; E-mail: maria.fatima.santos@ipoporto.min-saude.pt
Marta Filipa Relvas dos Santos, MSc, IPOP/ FCUP; E-mail: marta.relvas.santos@ipoporto.min-saude.pt
Rui Filipe Neves Freitas, MSc, IPOP/ I3s; E-mail: i37063@ipoporto.min-saude.pt
Sofia Ribeiro Cotton, MSc, IPOP; E-mail: sofia.ribeiro.cotton@ipoporto.min-saude.pt

Assistentes de Investigação

Andreia Rafaela Linhares Miranda; E-mail: i37220@ipoporto.min-saude.pt
Patrícia Pilar Gomes Oliveira Maia; E-mail: patricia.maia@ipoporto.min-saude.pt

Mestrandos

Ana Catarina Oliveira Trigo; E-mail: up201605261@edu.icbas.up.pt
Beatriz Faria Alves Oliveira; E-mail: i37311@ipoporto.min-saude.pt
Carina Caneppele; E-mail: i37288@ipoporto.min-saude.pt
Daniela Rocha Santos; E-mail: –
Eduardo da Silva Ferreira; E-mail: i37310@ipoporto.min-saude.pt
Fabrício Figueira Fernandes; E-mail: i37290@ipoporto.min-saude.pt
Lícia Beatriz Alves Araújo; E-mail: up201504400@edu.icbas.up.pt
Mafalda Barbosa Pedrosa; E-mail: i37305@ipoporto.min-saude.pt
Samuel da Silva Barbosa; E-mail: i37306@ipoporto.min-saude.pt

Outros colaboradores

Cristina Patrícia Mendes Santos, PhD; Psicóloga
Luís Pedro Fernandes Afonso; MSc, MD; Médico Patologista

OBJETIVOS

O grupo conta com quatro equipas:
A equipa de Infeção em Cancro e Translação Clínica tem como objetivo estudar a carcinogénese causada por agentes infeciosos com o objetivo de melhorar a intervenção clínica. Também se dedica à definição de programas personalizados de mitigação de risco em oncologia.
A equipa de glicobiologia de sistemas aplicado ao cancro dedica-se a entender a glicosilação do cancro, integrando abordagens multi-ómicas. Foca-se ainda na identificando assinaturas tumorais específicas e sua exploração em contexto de medicina de precisão.
A equipa de imunologia do cancro aborda os mecanismos de resistência à imunoterapia e avaliação pré-clínica de terapias combinadas em modelos celulares e animais.
A equipa de biomarcadores de cancro estuda células tumorais circulantes e biomarcadores não invasivos visando a oncologia de precisão.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

RESOLVE: Desenvolvimento de uma Nanovacina Multivalente Inspirada no Código Glicosídico Das Células Tumorais para Imunoterapia em Cancro Gástrico; Fundação para a Ciência e Tecnologia de Portugal; PTDC/MED-OUT/2512/2021; 250k€ (Janeiro 2022-Dezembro 2025); PI: José Alexandre Ferreira; Co-PI: Juan Lasarte (CIMA, Spain)

RESOLVE foca-se na interrogação compreensiva do glicoproteoma do cancro gástrico usando técnicas avançadas de espectrometria de massa. Um dos principais objetivos é a identificação de assinaturas moleculares específicas de cancro gástrico para melhor estratificação dos doentes. Pretende ainda explorar estas assinaturas no desenvolvimento de glicovacinas anti-tumorais inovadoras com base em nanotecnologia. O objetivo é estabelecer as bases pré-clínicas para uma imunoterapia inovadora contra este tipo de tumores.

Publicações

Peixoto A, Miranda A, Santos LL, Ferreira JA. A roadmap for translational cancer glycoimmunology at single cell resolution. J Exp Clin Cancer Res. 2022 41(1):143. doi: 10.1186/s13046-022-02335-z.

Caraterização fosfoproteómica de células tumorais de bexiga submetidas a hipóxia e privação de glucose: contribuições para a oncologia de sistemas; European Proteomics Infrastructure Consortium; EPIC-XS-0000341 (Junho 2021-Maio 2023); PI: José Alexandre Ferreira em colaboração com o laboratório Heck na Universidade de Utrecht
Descrição do projeto
A hipoxia um evento resultante da vascularização ineficaz de certos nichos tumorais devido ao crescimento celular descontrolado. Este microambiente é responsável pela manutenção de células tumorais extremamente agressivas, estando frequentemente associado a pior prognóstico. A diminuição da oxigenação dos tumores é normalmente acompanhada por escassez de nutrientes, no entanto, as adaptações moleculares e funcionais resultantes destes eventos ainda são pouco conhecidas. Este projeto explora de forma integrada diferentes “ómicas”, com enfase na glicómica e glicoproteómica, para caracterizar as adaptações moleculares e celulares experienciadas pelas células tumorais na adaptação a estes ambientes. O objetivo é desenvolver métodos de deteção e terapias dirigidas.

Publicações

Peixoto A, Freitas R, Ferreira D, Relvas-Santos M, Paulo P, Cardoso C, Soares J, Gaiteiro C, Palmeira C, Teixeira F, Ferreira R, Oliveira MJ, Silva AMN, Santos LL, Ferreira JA. Metabolomics, Transcriptomics and Functional Glycomics Reveals Bladder Cancer Cells Plasticity and Enhanced Aggressiveness Facing Hypoxia and Glucose Deprivation. bioRvx 2021 doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.14.431133

IPOScore: Prever o risco de complicações do tratamento cirúrgico e definir o prognóstico em pacientes com cancro através da integração de dados clínicos e patológicos; Fundação para a Ciência e Tecnologia de Portugal; DSAIPA/DS/0042/2018; 247k€ (Janeiro 2019-Julho 2022); PI: Rafael Costa

O projeto IPOScore aplica uma abordagem inovadora baseada em modelação orientada por dados, integrando dados clínicos, biopatológicos e fisiológicos de doentes oncológicos para prever o risco de complicações (pós-)operatórias. Prevê-se a criação de uma plataforma online de fácil utilização, incluindo uma base de dados para armazenar/gerir os dados recolhidos. O estabelecimento de abordagens computacionais e modelos de previsão para calcular uma pontuação de índice de risco específico (IPOScore) para a população portuguesa é também um importante objectivo do projeto. A plataforma fornecerá um sistema inteligente de apoio à decisão clínica com valor acrescentado para cirurgiões oncológicos.

Publicações

Fernandes E, Ferreira D, Peixoto A, Freitas R, Relvas-Santos M, Palmeira C, Martins G, Barros A, Santos LL, Sarmento B, Ferreira JA. Glycoengineered nanoparticles enhance the delivery of 5-fluoroucil and paclitaxel to gastric cancer cells of high metastatic potential. Int J Pharm. 2019 570:118646. doi: 10.1016/j.ijpharm.2019.118646.

Fernandes A, Rodrigues J, Lages P, Lança S, Mendes P, Antunes L, Santos CS, Castro C, Costa RS, Lopes CS, da Costa PM, Santos LL. Root causes and outcomes of postoperative pulmonary complications after abdominal surgery: a retrospective observational cohort study. Patient Saf Surg. 2019 13:40. doi: 10.1186/s13037-019-0221-5.

Fernandes E, Sores J, Cotton S, Peixoto A, Ferreira D, Freitas R, Reis CA, Santos LL, Ferreira JA. Esophageal, gastric and colorectal cancers: Looking beyond classical serological biomarkers towards glycoproteomics-assisted precision oncology. Theranostics. 2020 10(11):4903-4928. doi: 10.7150/thno.42480.

Fernandes A, Rodrigues J, Antunes L, Lages P, Santos CS, Moreira-Gonçalves D, Costa RS, Sousa JA, Dinis-Ribeiro M, Santos LL. Development of a preoperative risk score on admission in surgical intermediate care unit in gastrointestinal cancer surgery. Perioper Med (Lond). 2020 9:23. doi: 10.1186/s13741-020-00151-7.

Sousa Menezes A, Fernandes A, Rocha Rodrigues J, Salomé C, Machado F, Antunes L, Castro Silva J, Monteiro E, Lara Santos L. Optimizing classical risk scores to predict complications in head and neck surgery: a new approach. Eur Arch Otorhinolaryngol. 2021 278(1):191-202. doi: 10.1007/s00405-020-06133-1.

AFRICA: Painel subsariano de linhas tumorais: de células derivadas de pacientes a tratamento populacional especializado de cancro na ancestralidade africana; Fundação para a Ciência e Tecnologia de Portugal; PTDC/BIA-MOL/3986/2021; 250k€ (Janeiro 2022-Dezembro 2024); Co-PI: Lúcio Lara Santos

O projeto AFRICA visa desenvolver o primeiro banco de células primárias derivadas de doentes oncológicos oriundos da África subsariana, permitindo caracterizar fenótipos moleculares específicos de indivíduos de ascendência africana e o ajustamento do tratamento a estas populações.

PROTECT: Pré-habilitação para melhorar o tratamento oncológico em doentes com adenocarcinoma da junção gastroesofágica e do estômago; Fundação para a Ciência e Tecnologia de Portugal; PTDC/SAU-DES/7945/2020; 250k€ (Janeiro 2021-Dezembro 2023); PI: Lúcio Lara Santos

O projeto PROTECT prevê a pré-habilitação multimodal de doentes com cancro gástrico proximal e da junção gastroesofágica por meio de atividade física. O objetivo é promover a recuperação após cirurgia sem comprometer a segurança e eficácia do tratamento.

Efeito antitumoral sinérgico da termoterapia a laser combinada com imunomoduladores para tratamento de melanoma maligno; Clinical Laserthermia Systems AB; 78k€; PI: Carlos Alberto Palmeira de Sousa; Co-PI: Lúcio Lara Santos

O projeto Laserthermia visa avaliar o efeito antitumoral sinérgico da termoterapia à base de laser associada a imuno-moduladores clinicamente implementados em modelos de camundongos com melanoma B16F10 pouco imunogénicos.

REVERENT: 50k€ (início em 2023); PI: Andreia Peixoto; Co-PI: José Alexandre Ferreira

O projeto visa a validação de uma glicovacina para o cancro de bexiga em contexto pré-clínico, usando modelos tumorais animais relevantes, com o intuito translacional para estudos clínicos.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

GlycoBodies: Desenvolvimento de anticorpos monoclonais baseados em glicobiomarcadores para aplicação terapêutica em cancro de bexiga quimio-resistente; Centro de Investigação IPO; CI-IPOP-58-2015; 182k€ (2015-2022); PI: José Alexandre Ferreira; Co-PI: Lúcio Lara Santos

O projeto dedica-se a uma caracterização compreensiva do glicoma e do glicoproteoma do cancro da bexiga nas suas múltiplas manifestações patológicas, com ênfase nos tumores que não respondem à quimioterapia. O objetivo geral é identificar assinaturas específicas e desenvolver anticorpos para deteção e eliminação células tumorais mais agressivas.

Publicações

Peixoto A, Fernandes E, Gaiteiro C, Lima L, Azevedo R, Soares J, Cotton S, Parreira B, Neves M, Amaro T, Tavares A, Teixeira F, Palmeira C, Rangel M, Silva AM, Reis CA, Santos LL, Oliveira MJ, Ferreira JA. Hypoxia enhances the malignant nature of bladder cancer cells and concomitantly antagonizes protein O-glycosylation extension. Oncotarget. 2016 7(39):63138-63157. doi: 10.18632/oncotarget.11257.

Azevedo R, Peixoto A, Gaiteiro C, Fernandes E, Neves M, Lima L, Santos LL, Ferreira JA. Over forty years of bladder cancer glycobiology: Where do glycans stand facing precision oncology? Oncotarget. 2017 8(53):91734-91764. doi: 10.18632/oncotarget.19433.

Lima L, Neves M, Oliveira MI, Dieguez L, Freitas R, Azevedo R, Gaiteiro C, Soares J, Ferreira D, Peixoto A, Fernandes E, Montezuma D, Tavares A, Ribeiro R, Castro A, Oliveira M, Fraga A, Reis CA, Santos LL, Ferreira JA. Sialyl-Tn identifies muscle-invasive bladder cancer basal and luminal subtypes facing decreased survival, being expressed by circulating tumor cells and metastases. Urol Oncol. 2017 35(12):675.e1-675.e8. doi: 10.1016/j.urolonc.2017.08.012.

Azevedo R, Soares J, Gaiteiro C, Peixoto A, Lima L, Ferreira D, Relvas-Santos M, Fernandes E, Tavares A, Cotton S, Daniel-da-Silva AL, Santos LL, Vitorino R, Amado F, Ferreira JA. Glycan affinity magnetic nanoplatforms for urinary glycobiomarkers discovery in bladder cancer. Talanta. 2018 184:347-355. doi: 10.1016/j.talanta.2018.03.028.

Azevedo R, Soares J, Peixoto A, Cotton S, Lima L, Santos LL, Ferreira JA. Circulating tumor cells in bladder cancer: Emerging technologies and clinical implications foreseeing precision oncology. Urol Oncol. 2018 36(5):221-236. doi: 10.1016/j.urolonc.2018.02.004.

Peixoto A, Relvas-Santos M, Azevedo R, Santos LL, Ferreira JA. Protein Glycosylation and Tumor Microenvironment Alterations Driving Cancer Hallmarks. Front Oncol. 2019 9:380. doi: 10.3389/fonc.2019.00380.

Fernandes E, Freitas R, Ferreira D, Soares J, Azevedo R, Gaiteiro C, Peixoto A, Oliveira S, Cotton S, Relvas-Santos M, Afonso LP, Palmeira C, Oliveira MJ, Ferreira R, Silva AMN, Lara Santos L, Ferreira JA. Nucleolin-Sle A Glycoforms as E-Selectin Ligands and Potentially Targetable Biomarkers at the Cell Surface of Gastric Cancer Cells. Cancers (Basel). 2020 12(4):861. doi: 10.3390/cancers12040861.

Ferreira JA, Relvas-Santos M, Peixoto A, M N Silva A, Lara Santos L. Glycoproteogenomics: Setting the Course for Next-generation Cancer Neoantigen Discovery for Cancer Vaccines. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2021 19(1):25-43. doi: 10.1016/j.gpb.2021.03.005.

Peixoto A, Ferreira D, Azevedo R, Freitas R, Fernandes E, Relvas-Santos M, Gaiteiro C, Soares J, Cotton S, Teixeira B, Paulo P, Lima L, Palmeira C, Martins G, Oliveira MJ, Silva AMN, Santos LL, Ferreira JA. Glycoproteomics identifies HOMER3 as a potentially targetable biomarker triggered by hypoxia and glucose deprivation in bladder cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2021 40(1):191. doi: 10.1186/s13046-021-01988-6.

Cotton S, Ferreira D, Soares J, Peixoto A, Relvas-Santos M, Azevedo R, Piairo P, Diéguez L, Palmeira C, Lima L, Silva AMN, Lara Santos L, Ferreira JA. Target Score-A Proteomics Data Selection Tool Applied to Esophageal Cancer Identifies GLUT1-Sialyl Tn Glycoforms as Biomarkers of Cancer Aggressiveness. Int J Mol Sci. 2021 22(4):1664. doi: 10.3390/ijms22041664.

Freitas R, Relvas-Santos M, Azevedo R, Soares J, Fernandes E, Teixeira B, Santos LL, Silva AMN, Ferreira JA. Single-pot enzymatic synthesis of cancer-associated MUC16 O-glycopeptide libraries and multivalent protein glycoconjugates: a step towards cancer glycovaccines. New Journal of Chemistry 45 2021, 9197-9211, doi:10.1039/d0nj06021f.

Peixoto A, Cotton S, Santos LL, Ferreira JA. The Tumour Microenvironment and Circulating Tumour Cells: A Partnership Driving Metastasis and Glycan-Based Opportunities for Cancer Control. Adv Exp Med Biol. 2021 1329:1-33. doi: 10.1007/978-3-030-73119-9_1.

Glycoproteogenomics characterizes the CD44 splicing code associated with bladder cancer invasion. Theranostics. 2022 12(7):3150-3177. doi: 10.7150/thno.67409.

Peixoto A, Miranda A, Santos LL, Ferreira JA. A roadmap for translational cancer glycoimmunology at single cell resolution. J Exp Clin Cancer Res. 2022 41(1):143. doi: 10.1186/s13046-022-02335-z.

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

Alexandre L, Costa RS, Santos LL, Henriques R. Mining Pre-Surgical Patterns Able to Discriminate Post-Surgical Outcomes in the Oncological Domain. IEEE J Biomed Health Inform. 2021 25(7):2421-2434. doi: 10.1109/JBHI.2021.3064786. (IF: 5.77)

Xavier CPR, Castro I, Caires HR, Ferreira D, Cavadas B, Pereira L, Santos LL, Oliveira MJ, Vasconcelos MH. Chitinase 3-like-1 and fibronectin in the cargo of extracellular vesicles shed by human macrophages influence pancreatic cancer cellular response to gemcitabine. Cancer Lett. 2021 501:210-223. doi: 10.1016/j.canlet.2020.11.013. (IF: 8.68)

Gaiteiro C, Soares J, Relvas-Santos M, Peixoto A, Ferreira D, Paulo P, Brandão A, Fernandes E, Azevedo R, Palmeira C, Freitas R, Miranda A, Osório H, Prieto J, Lima L, Silva AMN, Santos LL, Ferreira JA. Glycoproteogenomics characterizes the CD44 splicing code associated with bladder cancer invasion. Theranostics. 2022 12(7):3150-3177. doi: 10.7150/thno.67409 (IF: 11.56)

Carneiro A, Piairo P, Teixeira A, Ferreira D, Cotton S, Rodrigues C, Chícharo A, Abalde-Cela S, Santos LL, Lima L, Diéguez L. Discriminating Epithelial to Mesenchymal Transition Phenotypes in Circulating Tumor Cells Isolated from Advanced Gastrointestinal Cancer Patients. Cells. 2022 11(3):376. doi: 10.3390/cells11030376. (IF: 4.32)

PATENTES

Ferreira JA. et al. Detection and isolation of cancer cells from body fluids based on a glycosylation pattern and methods of use thereof. WO/2018/217116 (2018); EP3645703 (2020).

Videira PA et al. L2A5 antibody or functional fragment thereof against tumour antigens. WO/2019/147152 (2019); EP3743726 (2020); and US20210033616 (2021).

Ferreira JA. et al. Method for cancer detection, prognosis, and therapeutic selection based on short CD44 glycoproteoforms. PT20211000033741 (Provisional).

Ferreira JA. et al. CD44 glycoepitopes and chimeric vaccine glycoconjugates for cancer therapy and synthesis methods thereof. PT20211000033743 (Provisional).

COLABORAÇÕES NACIONAIS

Celso Reis; Cristina Xavier; Fátima Gartner; Isabel Castro; João Vinagre; Luísa Pereira; Maria Helena Vasconcelos; Maria José Oliveira; Paula Soares; Raquel Almeida; Sérgia Velho; Nuno Mendes; i3S-Instituto de Investigação e Inovação em Saúde da Universidade do Porto
Francisco Amado, Rita Ferreira, Rui Vitorino; Departamento de Química, Universidade de Aveiro
André Silva; Faculdade de Ciências da Universidade do Porto
Paula Videira, Angelina Palma, Rafael Costa; NOVA School of Science and Technology, Universidade NOVA de Lisboa
Marlene Santos; Escola Superior de Saúde, Instituto Politécnico do Porto
Nome: Lorena Dieguez; International Iberian Nanotechnology Laboratory (INL)
Rui Henriques; Instituto Superior Técnico-Universidade de Lisboa
Daniel Moreira Gonçalves; Faculdade de Desporto da Universidade do Porto
Bruno Neves; Universidade de Aveiro
Paula Oliveira; Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro
Lucília Saraiva; Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Universidade do Porto
Céu Costa; Escola Superior de Saúde Fernando Pessoa

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

Jesus Prieto, Juan José Lasarte; Instituição: Center for Applied Medical Research (CIMA) of the University of Navarre; Espanha
Yvette van kooyk; Amsterdam UMC, Vrije Universiteit Amsterdam; Holanda
Noel Miranda; Instituição: Leiden University Medical Center (LUMC); Holanda
Giovanni De Manzoni; University of Verona; Itália
Rita Azevedo; Instituição: Institut Pasteur; França
Laura Bermejo; Instituição: Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS); Espanha
Luke Cossins; Instituição: Universal Biosensors (UBI); Austrália
Bruno Vedrine; Oncocellex at BUSI Incubateur d’Entreprises Auvergne; França
André Carvalho; International Agency for Research on Cancer/ World Health Organization; França
Isabel M. dos Santos Silva; London School of Hygiene & Tropical Medicine; Reino Unido
Pamela Borges; Hospital Universitário Agostinho Neto; Cabo Verde
André Carvalho; International Agency for Research on Cancer/ World Health Organization; França
Carla Carrilho; Faculdade de Medicina da Universidade Eduardo Mondlane; Moçambique
Fernando Miguel; Instituição: Instituto Angolano de Controlo de Cancro; Angola

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respectivo coordenador.

Grupo de Oncogenética

O Grupo de Oncogenética estuda a interação entre a predisposição hereditária para cancro e o padrão de alterações genéticas adquiridas que lhe dão origem, a fim de compreender os mecanismos de iniciação e progressão tumoral e seu papel na resposta e resistência terapêutica. De facto, os campos da genética germinativa e somática estão progressivamente mais interligados, como exemplificado pelas assinaturas mutacionais partilhadas que podem ter valor preditivo semelhante para a terapia alvo do cancro. Vários modelos tumorais biologicamente e clinicamente relevantes são estudados, com ênfase no cancro da próstata. É um grupo de investigação multidisciplinar que inclui médicos, farmacêuticos, bioquímicos e biólogos, todos especializados em Oncogenética.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Manuel R. Teixeira, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-4896-5982
Investigador Coordenador
Diretor do Serviço de Genética Laboratorial do IPO Porto / Coordenador do Grupo de Oncogenética do CI-IPOP / Prof. Catedrático Convidado (Genética Médica e Oncogenética), Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (ICBAS), Universidade do Porto
E-mail: manuel.teixeira[at]ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA
Investigadores Sénior

Paula Paulo, PhD
ORCID ID: 0000-0001-8387-2127
Investigador Auxiliar
Investigador Sénior no Grupo de Oncogenética do CI-IPOP
Email: paula.paulo@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Andreia Brandão, PhD
ORCID ID: 0000-0003-0938-1543
E-mail: andreia.aguiar.brandao[at]ipoporto.min-saude.pt

Bernard Orr, PhD
ORCID ID: 0000-0002-9159-7644
E-mail: i13009@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Sofia Maia, MD, PhD
Ciência ID: 8713-CBDB-1CD0
Assistente Hospitalar de Genética Médica
Centro Hospitalar Universitário de Coimbra
E-mail: s.maia@chuc.min-saude.pt

Doutorandos

Elsa Paiva, MSc (IPOP)
Ciência ID: 8214-06A6-66AB
E-mail: i36026@ipoporto.min-saude.pt

Pedro Gomes, MSc (IPOP/ FPCEUP)
Ciência ID: 1412-DEE3-E085
E-mail: pedro.silva.gomes@ipoporto.min-saude.pt

Rita Canário, MD(IPOP/i3S)
Ciência ID: 4D16-8D65-7129
E-mail: rita.canario@ipoporto.min-saude.pt

Assistentes de Investigação

Manuela Pinheiro, PhD
Ciência ID: 0216-6A5F-4983
E-mail: Manuela.Pinheiro@ipoporto.min-saude.pt

Cátia Gonçalves, MSc
Ciência ID: C01A-FB73-0A85
E-mail: catia.goncalves@ipoporto.min-saude.pt

Mestrandos

Luca Rocha, BSc
Ciência ID: E411-0DDE-36D7
E-mail: luca.rocha@ipoporto.min-saude.pt

Madalena Ribeiro, Bsc
Ciência ID: F317-C67A-EDEE
E-mail: madalena.corado@ipoporto.min-saude.pt

Sofia Costa, BSc
Ciência ID: 0018-D631-03E9
E-mail: sofia.costa@ipoporto.min-saude.pt

Outros colaboradores

Ana Barbosa, PhD
Técnico Superior
Ciência ID: E519-6872-5FE9

Ana Peixoto, PhD
Farmacêutico (Assistente)
Ciência ID: 2014-3C52-DAC7

Adriana Resende, MSc
Técnico Superior
Ciência ID: 2418-F824-8B08

Carla Pinto, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: 271F-E46E-86E8

Carla Escudeiro, MSc
Técnico Superior
Ciência ID: B21B-3C92-5EB8

Catarina Santos, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: AC19-D7A8-6DE9

Cecília Correia, MSc

Técnico Superior de Saúde (Assessor Superior)

Ciência ID: 0E10-1002-4547

Gabriela Soares, MD
Assistente Graduado de Genética Médica
Ciência ID: 311B-86C6-1C9B

Isabel Santos, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assessor)
Ciência ID: 0C13-B632-9D1D

Joana Guerra, MSc (IPOP)
Técnico Superior
Ciência ID: EC17-9634-91E6

Joana Vieira, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: 751D-0AB6-2951

João Silva, MD
Assistente Graduado de Genética Médica
Ciência ID: A217-7877-3BB1

Lurdes Torres, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: A113-39B0-F44B

Patrícia Arinto, MSc
Técnico Superior
Ciência ID: 9F18-FB90-3ED9

Patrícia Rocha, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: 2715-3C44-24D7

Susana Bizarro, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: E011-B9A0-8B3F

Susana Lisboa, MSc
Técnico Superior de Saúde (Assistente)
Ciência ID: 2017-BE12-C7F5

OBJETIVOS

As principais linhas de investigação para o período 2024-2026 são as seguintes:

Caracterizar em maior detalhe a contribuição para a carcinogénese dos genes PRUNE2, BUB1B e IPO4, que descobrimos recentemente como candidatos a genes de predisposição para cancro da próstata, contribuindo para explicar a heritabilidade em falta desta doença.
Compreender a base poligénica da predisposição hereditária para cancro da próstata utilizando uma abordagem integrativa multi-ómica combinando estratégias genómicas e transcriptómicas.
Usar estratégias baseadas em células para rastrear variantes genéticas e compostos direcionados a genes relacionados aos cílios para o desenvolvimento e terapia do cancro da próstata.
Avaliar a utilidade potencial das terapias anti-EGFR em subtipos de cancro da próstata positivos para rearranjos ETS.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

PRUNE2 – “PRUNE2 gene as a novel dual-role biomarker for prostate cancer inherited predisposition and therapy response”; FCT (2023.01928.RESTART); Orçamento: 49,800€ (2023-2025) (PI: Andreia Brandão)

Com base em descobertas anteriores, este projeto visa combinar abordagens genómicas, transcriptómicas e computacionais para consolidar o PRUNE2 como um novo gene de predisposição para cancro da próstata e avaliar seu potencial como biomarcador preditivo.

Publicações

Cardoso M, Maia S, Brandão A, Sahasrabudhe R, Lott P, Belter N, Carvajal-Carmona LG, Paulo P, Teixeira MR. Exome sequencing of affected duos and trios uncovers PRUNE2 as a novel prostate cancer predisposition gene. Br J Cancer. 2023; 128(6):1077-1085. doi: 10.1038/s41416-022-02125-6. PMID: 36564567.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

ctDNA-BRCA – “Identification of somatic and germline mutations in circulating tumor DNA in ovarian cancer patients and in germline BRCA1/BRCA2 mutation carriers undergoing cancer screening” (PI 71-CI-IPOP-35-2016), Orçamento: 90 mil € (2016-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto visa explorar o uso de ctDNA como uma alternativa para testes genéticos preditivos não invasivos para terapia direcionada em pacientes com cancro do ovário com mutações germinativas ou somáticas de BRCA1/2, bem como no cenário de rastreio de cancro em portadores de alto risco com mutações germinativas nos genes BRCA1 /2.

Publicações

Barbosa A, Pinto P, Peixoto A, Guerra J, Pinheiro M, Santos C, Pinto C, Escudeiro C, Bartosch C, Santos R, Brandão A, Silva J, Teixeira MR. Next generation sequencing of tumor and matched plasma samples: identification of somatic variants in ctDNA from ovarian cancer patients. Front Oncol. 2021; 11:754094. doi: 10.3389/fonc.2021.754094. PMID: 34660321.

Barbosa A, Peixoto A, Pinto P, Pinheiro M, Teixeira MR. Potential clinical applications of circulating cell-free DNA in ovarian cancer patients. Expert Rev Mol Med. 2018; 20:e6. doi: 10.1017/erm.2018.5. PMID: 30558693.

ctDNA-Cancer – “Validation of liquid biopsies for predictive biomarker testing, therapy response monitoring, and resistance mechanism identification in cancer patients” (PI 82-CI-IPOP-54-2017), Orçamento: 35 mil € (2017-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo avaliar a deteção de alterações genéticas no ctDNA como ferramenta para testes preditivos de biomarcadores, monitorização da resposta terapêutica e identificação de mecanismos de resistência em pacientes com cancro candidatos ou em tratamento com terapias biológicas dirigidas.

Publicações

Pinheiro M, Peixoto A, Rocha P, Veiga I, Pinto C, Santos C, Pinto P, Guerra J, Escudeiro C, Barbosa A, Silva J, Teixeira MR. KRAS and NRAS mutational analysis in plasma ctDNA from patients with metastatic colorectal cancer by real-time PCR and digital PCR. Int J Colorectal Dis. 2022; 37(4):895-905. doi: 10.1007/s00384-022-04126-6. PMID: 35303157.

CaGaGen – “Identification of germline mutations by gene-panel next generation sequencing in familial tubular and mixed tubular-diffuse gastric cancer” (PI 84-CI-IPOP-56-2017), Orçamento: 90 mil € (2017-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto visa identificar genes adicionais envolvidos na predisposição hereditária para cancro gástrico difuso, tubular e misto, o que pode permitir vigilância clínica e/ou profilaxia orientada pelo genótipo.

Publicações

Guerra J, Pinto C, Pinto P, Pinheiro M, Santos C, Peixoto A, Escudeiro C, Barbosa A, Porto M, Francisco I, Lopes P, Isidoro AR, Cunha AL, Albuquerque C, Claro I, Oliveira C, Silva J, Teixeira MR. Frequency of CDH1, CTNNA1 and CTNND1 germline variants in families with diffuse and mixed gastric cancer. Cancers (Basel). 2023; 15(17):4313. doi: 10.3390/cancers15174313. PMID: 37686589.

Fewings E, Larionov A, Redman J, Goldgraben MA, Scarth J, Richardson S, Brewer C, Davidson R, Ellis I, Evans DG, Halliday D, Izatt L, Marks P, McConnell V, Verbist L, Mayes R, Clark GR, Hadfield J, Chin SF, Teixeira MR, Giger OT, Hardwick R, di Pietro M, O’Donovan M, Pharoah P, Caldas C, Fitzgerald RC, Tischkowitz M. Germline pathogenic variants in PALB2 and other cancer-predisposing genes in families with hereditary diffuse gastric cancer without CDH1 mutation: a whole-exome sequencing study. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2018; 3(7):489-498. doi: 10.1016/S2468-1253(18)30079-7. PMID: 29706558.

Sahasrabudhe R, Lott P, Bohorquez M, Toal T, Estrada AP, Suarez JJ, Brea-Fernández A, Cameselle-Teijeiro J, Pinto C, Ramos I, Mantilla A, Prieto R, Corvalan A, Norero E, Alvarez C, Tapia T, Carvallo P, Gonzalez LM, Cock-Rada A, Solano A, Neffa F, Della Valle A, Yau C, Soares G, Borowsky A, Hu N, He LJ, Han XY; Latin American Gastric Cancer Genetics Collaborative Group; Taylor PR, Goldstein AM, Torres J, Echeverry M, Ruiz-Ponte C, Teixeira MR, Carvajal-Carmona LG. Germline mutations in PALB2, BRCA1, and RAD51C, which regulate DNA recombination repair, in patients with gastric cancer. Gastroenterology. 2017; 152(5):983-986.e6. doi: 10.1053/j.gastro.2016.12.010. PMID: 28024868.

LUNG-ctDNA – “Characterization of targeted therapy resistance mechanisms in EGFR/ALK/ROS1/BRAF-positive NSCLC by gene panel NGS in circulating cell-free DNA” (PI 138-CI-IPOP-126-2019), Orçamento: 15 mil € (2021-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo avaliar a sensibilidade do NGS do ctDNA para detetar a alteração molecular primária em pacientes com CPNPC que progridem após tratamento direcionado de primeira linha com uma terapia biológica aprovada para esses subtipos moleculares, descrever o padrão de mecanismos de resistência em pacientes com CPNPC positivo para EGFR, BRAF, ALK ou ROS1 que progrediu após tratamento de primeira linha, avaliar a taxa de acesso potencial a outras terapias direcionadas aprovadas ou off-label, e para avaliar o impacto potencial desta estratégia para reduzir a taxa de rebiópsias nestes pacientes.

VATER – “Landscape of somatic and germline genetic alterations in ampullary carcinomas” (PI 140-CI-IPOP-128-2020), Orçamento: 15 mil € (2019-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo realizar a pesquisa de mutações BRCA1/BRCA2 em numa grande série de carcinomas da ampôla de Vater para confirmar a associação que identificamos anteriormente de mutações nesses genes com esta neoplasia rara, para avaliar a presença de variantes deletérias da linha germinativa em outros genes envolvidos na reparação de DNA, nomeadamente, genes da via da anemia de Fanconi e genes envolvidos na recombinação homóloga em pacientes com carcinomas ampulares, e caracterizar o padrão de variantes somáticas em genes de reparação de ADN em carcinomas ampulares.

MetPC – “Simultaneous detection of germline and somatic mutations in DNA repair genes by next generation sequencing of tumor samples and cell-free DNA from metastatic prostate cancer patients” (PI 141-CI-IPOP-129-2020), Orçamento: 75 mil € (2021-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo avaliar a viabilidade e a sensibilidade da deteção de mutações germinativas e somáticas em genes de recombinação homóloga em DNA em circulação livre de células (cfDNA) em pacientes com cancro da próstata metastático que não possuem uma amostra de tumor de arquivo analisável ou disponível.

PATHSEARCH – “Understanding the polygenic basis of hereditary predisposition to prostate cancer: a multi-omics integrative approach combining genomics and transcriptomics” (PI 161-CI-IPOP-154-2021), Orçamento: 10 mil € (2022-2028) (PI: Andreia Brandão)

Este projeto visa compreender a base poligénica da predisposição hereditária para cancro da próstata utilizando uma abordagem integrativa multi-ómica, combinando estratégias genómicas e transcriptómicas.

TREATCILIA – “Theragnostic exploitation of ciliogenesis defects in prostate cancer – building bridges” (PI 162-CI-IPOP-155-2021), Orçamento: 45 mil € (2022-2025) (PI: Paula Paulo)

Este projeto visa utilizar estratégias baseadas em células para rastrear variantes genéticas e compostos direcionados a genes relacionados com os cílios para o desenvolvimento e terapia do cancro da próstata.

POLYRISK – “Impact of multigene next generation sequencing and polygenic risk score for breast cancer predisposition” (PI 163-CI-IPOP-156-2021), Orçamento: 10 mil € (2022-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo avaliar a prevalência de variantes patogénicas em genes de suscetibilidade em pacientes com cancro da mama que não preenchem aos critérios da NICE, mas que cumprem aos critérios MCGplus para testes genéticos.

ETS-EGFR-CRC – “Identification of markers of resistance to anti-EGFR therapy in colorectal carcinoma” (PI 205-CI-IPOP-08-2023), Orçamento: 5 mil € (2023-2024) (PI: Paula Paulo)

Este projeto visa compreender se a expressão de fatores de transcrição PEA3 e/ou GRPR está associada à resistência à terapia anti-EGFR em doentes com cancro colo-rectal RASwt, revelando eventualmente uma assinatura molecular que possa orientar abordagens terapêuticas alternativas.

HLEU – “Inherited predisposition to hematological malignancies” (PI 206-CI-IPOP-29-2023), Orçamento: 5 mil € (2023-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo identificar variantes germinativas que sejam responsáveis por predisposição hereditária para neoplasias hematológicas malignas, com ou sem associação com outras neoplasias, em pacientes com histórico pessoal e/ou familiar da doença.

ETS-EGFR-PC – “In vitro exploitation of the therapeutic potential of EGFR pathway inhibitors in prostate cancer cells harboring ETS rearrangements” (PI 207-CI-IPOP-30-2023), Orçamento: 30 mil € (2023-2024) (PI: Paula Paulo)

Este projeto tem como objetivo avaliar o potencial terapêutico de inibidores de EGFR e STAT3 em linhas celulares de cancro da próstata com sobre-expressão de ETV1 ou ETV4 in vitro, isoladamente ou em combinação com um inibidor de GRPR.

ctDNA-Lynch – “Detection of cancer specific genetic alterations in circulating free tumor DNA as a tool for early cancer diagnosis and follow up in Lynch syndrome patients” (PI 72-CI-IPOP-36-2016), Orçamento: 20 mil € (2016-2024) (PI: Manuel Teixeira)

Este projeto tem como objetivo avaliar a deteção de alterações genéticas no ctDNA como ferramenta para diagnóstico precoce e seguimento em pacientes e portadores de alto risco de síndrome de Lynch.

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

Cardoso M, Maia S, Brandão A, Sahasrabudhe R, Lott P, Belter N, Carvajal-Carmona LG, Paulo P, Teixeira MR. Exome sequencing of affected duos and trios uncovers PRUNE2 as a novel prostate cancer predisposition gene. Br J Cancer. 2023; 128(6):1077-1085. doi: 10.1038/s41416-022-02125-6. PMID: 36564567.
Paulo P, Cardoso M, Brandão A, Pinto P, Falconi A, Pinheiro M, Cerveira N, Silva R, Santos C, Pinto C, Peixoto A, Maia S, Teixeira MR. Genetic landscape of homologous recombination repair genes in early-onset/familial prostate cancer patients. Genes Chromosomes Cancer. 2023; 62(12):710-720. doi: 10.1002/gcc.23190. PMID: 37436117.
Bancroft EK, Page EC, Brook MN, Thomas S, Taylor N, Pope J, McHugh J, Jones AB, Karlsson Q, Merson S, Ong KR, Hoffman J, Huber C, Maehle L, Grindedal EM, Stormorken A, Evans DG, Rothwell J, Lalloo F, Brady AF, Bartlett M, Snape K, Hanson H, James P, McKinley J, Mascarenhas L, Syngal S, Ukaegbu C, Side L, Thomas T, Barwell J, Teixeira MR, Izatt L, Suri M, Macrae FA, Poplawski N, Chen-Shtoyerman R, Ahmed M, Musgrave H, Nicolai N, Greenhalgh L, Brewer C, Pachter N, Spigelman AD, Azzabi A, Helfand BT, Halliday D, Buys S, Ramon Y Cajal T, Donaldson A, Cooney KA, Harris M, McGrath J, Davidson R, Taylor A, Cooke P, Myhill K, Hogben M, Aaronson NK, Ardern-Jones A, Bangma CH, Castro E, Dearnaley D, Dias A, Dudderidge T, Eccles DM, Green K, Eyfjord J, Falconer A, Foster CS, Gronberg H, Hamdy FC, Johannsson O, Khoo V, Lilja H, Lindeman GJ, Lubinski J, Axcrona K, Mikropoulos C, Mitra AV, Moynihan C, Ni Raghallaigh H, Rennert G, Collier R; IMPACT Study Collaborators; Offman J, Kote-Jarai Z, Eeles RA. A prospective prostate cancer screening programme for men with pathogenic variants in mismatch repair genes (IMPACT): initial results from an international prospective study. Lancet Oncol. 2021; 22(11):1618-1631. doi: 10.1016/S1470-2045(21)00522-2. PMID: 34678156.
Brandão A, Paulo P, Maia S, Pinheiro M, Peixoto A, Cardoso M, Silva MP, Santos C, Eeles RA, Kote-Jarai Z, Muir K, Ukgpcs Collaborators, Schleutker J, Wang Y, Pashayan N, Batra J, Apcb BioResource, Grönberg H, Neal DE, Nordestgaard BG, Tangen CM, Southey MC, Wolk A, Albanes D, Haiman CA, Travis RC, Stanford JL, Mucci LA, West CML, Nielsen SF, Kibel AS, Cussenot O, Berndt SI, Koutros S, Sørensen KD, Cybulski C, Grindedal EM, Park JY, Ingles SA, Maier C, Hamilton RJ, Rosenstein BS, Vega A, The Impact Study Steering Committee And Collaborators, Kogevinas M, Wiklund F, Penney KL, Brenner H, John EM, Kaneva R, Logothetis CJ, Neuhausen SL, Ruyck K, Razack A, Newcomb LF, Canary Pass Investigators, Lessel D, Usmani N, Claessens F, Gago-Dominguez M, Townsend PA, Roobol MJ, The Profile Study Steering Committee, The Practical Consortium, Teixeira MR. The CHEK2 variant c.349A>G is associated with prostate cancer risk and carriers share a common ancestor. Cancers (Basel). 2020; 12(11):3254. doi: 10.3390/cancers12113254. PMID: 33158149.
Paulo P, Maia S, Pinto C, Pinto P, Monteiro A, Peixoto A, Teixeira MR. Targeted next generation sequencing identifies functionally deleterious germline mutations in novel genes in early-onset/familial prostate cancer. PLoS Genet. 2018; 14(4):e1007355. doi: 10.1371/journal.pgen.1007355. PMID: 29659569.

PATENTES

(2012) Methods and biomarkers for detection of bladder cancer; US 20130210011/ EP 2630261 A1/ WO 2012052844 A1 (in collaboration Oslo University Hospital).

COLABORAÇÕES NACIONAIS

José Bessa, PhD | i3S
Hélder Maiato, PhD | i3S
Carla Oliveira, PhD | i3S
Joana Paredes, PhD | i3S

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

Luis G Carvajal-Carmona, PhD
UC Davis Genome Center | EUA

Rosalind Eeles, MD, PhD (PRACTICAL consortium and IMPACT study)
Institute of Cancer Research | Reino Unido

Georgia Chenevix-Trench, PhD, FAA (CIMBA consortium)
QIMR Berghofer Medical Research Institute | Austrália

Douglas Easton, PhD (BCAC consortium)
University of Cambridge | Reino Unido

Amanda Spurdle, PhD (ENIGMA consortium)
QIMR Berghofer Medical Research Institute | Austrália

Nicoline Hoogerbrugge, MD, PhD (European Reference Network on Genetic Tumour Risk Syndromes, GENTURIS)
Radboud University Medical Center | Holanda

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respetivo coordenador.

Grupo de Oncologia Molecular & Patologia Viral

O objetivo principal do GOMPV, estabelecido em 2002, é a caracterização de mecanismos moleculares associados ao desenvolvimento de cancro e resposta ao tratamento anti-neoplásico, através da identificação de biomarcadores moleculares, tais como polimorfismos genéticos, mRNAs, microRNAs, LncRNAs e genomas virais. No âmbito da Medicina de Precisão e Farmacogenómica, o Grupo está focado no estudo e identificação de biomarcadores circulantes, analisados por técnicas minimamente invasivas, com aplicabilidade clínica, centrando os seus estudos na definição de grupos de risco, otimização das estratégias terapêuticas e no estudo da rede de comunicação estabelecida entre hospedeiro e microambiente tumoral.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Rui Medeiros, PharmD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-3010-8373/C51F-5DBE-9C51
Assessor-Farmacêutico
Coordenador Grupo de Oncologia Molecular e Patologia Viral | Diretor do Departamento de Investigação da LPCC-NRN | Membro do Board da European Cancer Organization
E-mail: ruimedei@ipoporto.min-saude.pt

Equipa

Investigadores Sénior

Hugo Sousa, MD, PhD
ORCID ID/CIÊNCIA ID: 0000-0001-5795-2131
Técnico Superior
E-mail: hugo.sousa@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Ana Luísa Pereira Teixeira, PhD
ORCID ID/ CIÊNCIA ID: 0000-0002-7489-2211/ 391C-0BD8-CCF0
E-mail: ana.luisa.teixeira@ipoporto.min-saude.pt

Francisca Guilherme Carvalho Dias, PhD
ORCID ID/ CIÊNCIA ID: 0000-0002-4993-4467 / 851B-027C-DCB3
E-mail: francisca.carvalho.dias@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Áurea Rosa Nunes Pereira Lima, MD, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-9779-0584/ A212-12E7-7E9E
Interna de Oncologia Médica @ Centro Hospitalar de Entre-Douro e Vouga
E-mail: aurea.lima@chedv-min.saude.pt

Carina Sofia Teixeira Fernandes, PhD
IORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-8258-1448/ 5A1B-358C-C56C
Professora Auxiliar @Universidade Fernando Pessoa
E-mail: carinafernandes@ufp.edu.pt

Maria de Fátima Araújo Magalhães Cerqueira, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4513-4654/ CF14-52ED-5DA0
Professora Associada @ Universidade Fernando Pessoa
E-mail: fatimaf@ufp.edu.pt

Maria Raquel Silva
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8170-3119/ 2518-6117-FB25
Professora Associada @ Universidade Fernando Pessoa
E-mail: raquel@ufp.edu.pt

Mariana Gomes Morais, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-8406-8210/ 4215-FC71-B1B7
Diretora de Operações
MEERU | Abrir Caminho
E-mail: mariana.gomes.morais@ipoporto.min-saude.pt

Marlene Elisabete Moreira dos Santos Lima
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5020-5942/ 8311-B967-31C4
Professor Coordenador @ Escola Superior de Saúde (ESS)
E-mail: mes@ess.ipp.pt

Mónica Patrícia Silva Gomes, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-9947-5775/ 5B1A-9FE9-A3AA
Investigadora Pós-doutoramento | Técnico Superior
Instituição de origem: Liga Portuguesa Contra o Cancro, NRN
E-mail: monica.gomes@ligacontracancro.pt

Rui Miguel Gil da Costa Oliveira, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-2151-2449/ 0318-98C4-ADCF
Professor Visitante Sénior @ Universidade do Maranhão
E-mail: rmcosta@fe.up.pt

Assistentes de Investigação

Beatriz Ferreira Almeida, BSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-1674-3576/ E013-DC6E-0137
E-mail: beatrizfalmeida@ua.pt

Beatriz Neto, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5955-9904/ 2617-E240-6096
E-mail: i37300@ipoporto.min-saude.pt

Outros colaboradores/ Técnicos Superiores

Catarina Castro, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-8970-6493/ 0317-97B3-F4C7
Técnica superior
E-mail: i13069@ipoporto.min-saude.pt

Tatiana Nunes Varandas, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5125-3273/ 4F17-4D1E-F11F
Técnica superior
E-mail: tatiana.varandas@ipoporto.min-saude.pt

Doutorandos

Ana Carolina da Mota Carvalho Ferreira, MD, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5400-9447/ C913-FCA3-A39D
E-mail: carolina.ferreira@ipoporto.min-saude.pt

Ana da Conceição Saraiva e Sousa, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3128-3328/ AB17-B086-334A
E-mail: ana.tavares@ipb.pt

Andreia Filipa da Silva Rosário, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4348-0596/ C31C-5972-87F7
E-mail: andreia.rosario@ipoporto.min-saude.pt

Beatriz Medeiros Fonseca, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3909-5903/ 531E-32B9-9138
E-mail: fonsecabeatriz@live.com.pt

Carla Manuela Moutinho Silva Campos, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 000-002-6220-4469/ A71C-B158-BC1F
E-mail: carla.campos@ipoporto.min-saude.pt

Isabel Meireles, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-4513-4654/ CF14-52ED-5DA0
E-mail: isabeldmeireles@gmail.com

Tânia Rôlo Dias, MSc
Ciência ID: F31A-CC37-EC54
E-mail: tania.dias@ipoporto.min-saude.pt

Tiago Terras Ferreira
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-6652-9770/ 5812-0F6E-B44E
E-mail: tiagoterras55@gmail.com

Valéria Delgado Tavares, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-3680-7757/ B715-3863-A1DA
E-mail: valeria.tavares@ipoporto.min-saude.pt

Mestrandos

Ângela Alves; E-mail: i40014@ipoporto.min-saude.pt
Ana Leão; E-mail: ana.leao@ipoporto.min-saude.pt.
Ian Soto; E-mail: up202301316@edu.icbas.up.pt
Inês Marques; E-mail: ines.soares@ipoporto.min-saude.pt
Inês Melo; E-mail: ines.melo@ipoporto.min-saude.pt
Inês Mota; E-mail: ines.mota@ipoporto.min-saude.pt
Mariana Ferreira; E-mail: i40016@ipoporto.min-saude.pt
Vânia Dias; E-mail: vaniacdias05@gmail.com

OBJETIVOS

A principal linha de investigação centra-se na clarificação da dinâmica de comunicação estabelecida entre o hospedeiro e o microambiente tumoral, analisando múltiplos biomarcadores moleculares (polimorfismos genéticos, mRNAs, microRNAs, LncRNAs e genomas virais) aplicados na predição de diferentes outcomes clínicos. O grande foco da nossa investigação é o desenvolvimento do racional de algoritmos de farmacogenómica e de prognóstico baseados no perfil genético do doente em associação com marcadores moleculares, fatores demográficos, informação clínica, assim como estratégia terapêutica de modo a melhorar os atuais sistemas de gestão de doentes a partir de uma abordagem baseada na prática de biópsias líquidas e na Medicina de Precisão.
Paralelamente, considerando o papel de vários agentes virais na oncobiologia, o Grupo desenvolve também estudos para caracterizar a associação entre agentes como o SARS-CoV, HPV, CMV e EBV e o desenvolvimento tumoral.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

OnCOVac.PT; Evaluation of the Immunologic Response to COVID-19 Vaccination in Oncological Patients
Entidade Financiadora: AstraZeneca
Financiamento: 460 000.00 €
PI e Co-PI: Júlio Oliveira | Rui Medeiros

As Autoridades de Saúde Portuguesas decretaram a transmissão ativa do vírus COVID-19 no dia 26 de março de 2020 tendo sido declarado estado de emergência de modo a combater esta pandemia. Os sintomas associados à COVID-19 tendem a variar entre muito leves a graves, incluindo casos que resultaram em morte. Os doentes com cancro são um grupo de risco elevado pois apresentam um sistema imunitário muito comprometido devido à própria doença, bem como, aos tratamentos associados, como a quimioterapia, radioterapia e cirurgia, sendo por isso, uma população mais suscetível de contrair a infeção e consequentemente de desenvolver sintomas graves. Apesar dos dados relativos à COVID-19 ainda serem limitados as organizações médicas e os especialistas tem vindo a indicar a vacinação para a maioria destes doentes. No entanto, é necessária mais informação acerca da segurança e eficácia das vacinas COVID-19, bem como, acerca do efeito das doses de reforço da vacina em pessoas que apresentam sistemas imunitários comprometidos. Deste modo, é de esperar que os doentes com cancro desenvolvam uma resposta imune menos eficiente à vacinação. Assim, é extremamente importante o estudo da resposta imunitária à dose de reforço da vacina COVID-19 em doentes com cancro de modo a obter mais informações acerca da percentagem de não respondedores, bem como, de novos potenciais biomarcadores moleculares, genéticos e epigenéticos que permitam estratificar os doentes em respondedores e não respondedores à vacinação COVID-19. Esta questão tende a ser cada vez mais importante na comunidade científica uma vez que estão a surgir potenciais terapias anti-COVID-19 que podem vir a beneficiar doentes que não respondem eficazmente à vacinação.

Publicações

Almeida B, Dias TR, Teixeira AL, Dias F, Medeiros R. MicroRNAs Derived from Extracellular Vesicles: Keys to Understanding SARS-CoV-2 Vaccination Response in Cancer Patients? Cancers (Basel). 2023 Aug 8;15(16):4017. doi: 10.3390/cancers15164017.

Dias TR, Dias F, Teixeira AL, Sousa H, Oliveira J, Medeiros R. MicroRNAs as Potential Tools for Predicting Cancer Patients’ Susceptibility to SARS-CoV-2 Infection and Vaccination Response. Cells. 2022;11(15), doi: 10.3390/cells11152279

PAINLESS; Pain relief in palliative care of cancer using home-based neuromodulation and predictive biomarkers
Entidade Financiadora: European Union, Horizon Europe Initiative HORIZON-HLTH-2021-DISEASE-04 (2022-2027)
Ref.: 101057243
Financiamento: 5 952 245.00 € (IPO Porto 342 250.00 €)
PI do IPO Porto: Rui Medeiros
Projeto em co-promoção: Universidade de Santiago de Compostela, IPO Porto, Servizo Galego de Saude, Universitaets medizing Goettingen, Aalborg Universitet, Hospice Casa Sperantei, Technion -Israel Institute of Technology, Institutul Oncologic Prof. Dr. Alexandru Trestioreanu Bucuresti, European Association of Palliative Care, European Cancer Patient Coalition, Neuroconn Gmbh, Betthera S.r.o., Software Imagination &Vision Srl, Qst.lab, Mentalab Gmbh, Association
Europeenne des Ligues Contre Le Cancer Asbl

Mais de 50% dos doentes com cancro desenvolvem dor antes da morte: 80% podem ser tratados com medicamentos, mas 20% apresentam baixa resposta ou desenvolvem efeitos adversos graves. Embora intervenções não farmacológicas, como procedimentos neurocirúrgicos, tenham sido testadas, essasalternativas não são uma opção preferencial para tratar a dor oncológica devido ao seu alto custo, risco, invasividade e eficácia nem sempre comprovada.
PAINLESS aborda um componente central do alívio da dor, usando uma abordagem inovadora baseada em evidências. O objetivo é adaptar e implementar uma nova e económica intervenção no domicílio baseada na neuromodulação para reduzir a dor e melhorar a qualidade de vida de
doentes oncológicos com dor crônica. Partindo do pressuposto de que o tratamento da dor crónica pode se beneficiar da pesquisa sobre o cérebro mecanismos da dor, primeiro tentaremos melhorar nossa compreensão do papel da modulação central da dor. O projeto será organizado em 3 estudos: 1) Um estudo longitudinal de coorte para explorar se os biomarcadores de dor central podem ser preditivos da ocorrência de dor crônica em doentes com cancro;2) Um estudo transversal para caracterizar e estratificar doentes com cancro com vs. sem dor crónica; 3) Um estudo piloto para avaliar a viabilidade e eficácia da utilização em casa de equipamento de estimulação elétrica transcraniana de baixa intensidade (tES) para cuidados paliativos de doentes com cancro que sofrem de dor.

EVmiRs4PC; microRNAs derivados de vesículas extracelulares como mediadores da resistência ao tratamento em modelos in vitro 3D esferoides de cancro da próstata
Entidade Financiadora: LPCC-NRN
REF.: CI-IPOP 13-2022
Financiamento: 5 000 €
PI: Ana Luísa Teixeira

O cancro da próstata (CP) é a segunda neoplasia mais frequente no homem a nível mundial, representando 6,8% das mortes por cancro.
A terapia de bloqueio androgénico (TBA) é frequentemente utilizada no tratamento do CP avançado e metastático, uma vez que os tumores prostáticos são altamente dependentes da via dos androgénios para proliferarem e progredirem. Esta forma de tratamento revela-se eficaz numa fase inicial do tratamento, mas em média ao fim de 2-3 anos ocorre o desenvolvimento de resistência, desenvolvendo-se assim o denominado CP resistente à castração (CPRC). A enzalutamida (ENZ) é um antiandrogénio de segunda geração desenvolvido para o tratamento do CPRC. Contudo, aproximadamente 15-20% dos doentes apresenta resistência primária e uma elevada percentagem dos doentes acaba por desenvolver resistência a este novo agente.
Nos últimos anos, os microRNAs (miRNAs) têm surgido como potenciais biomarcadores em diversos modelos tumorais. Em consequência do seu importante papel na regulação da expressão genética, a sua desregulação tem sido frequentemente associada à aquisição de fenótipos de resistência e a formas metastáticas da doença. Para além do seu potencial como biomarcador de diagnóstico e prognóstico, os miRNAs apresentam elevado potencial como agentes terapêuticos, quer pela utilização de mímicos de miRNAs ou de anti-miRNAs (anti-miRs).
Deste modo, pretendemos definir um perfil de miRNAs em VEs associado à aquisição da resistência à ENZ, e analisar a sua dinâmica durante o processo de aquisição de resistência em modelos in vitro 3D esferóides. A identificação destes miRNAs, a par da identificação das proteínas e respetivas vias de sinalização permitirá esclarecer quais os mecanismos moleculares de resistência à ENZ. A utilização clínica deste perfil de miRNAs de resistência poderá, no futuro, não só ser aplicado no follow-up dos doentes submetidos ao tratamento com ENZ para detetar surgimento de resistência, com recurso a biópsias líquidas, como também revelar novos alvos terapêuticos. Ou seja, a identificação do perfil de miRNAs aberrantemente expressos poderá potenciar o desenvolvimento de uma terapia anti-miRs, útil na ressensibilização das células tumorais à terapia de bloqueio androgénico.

Publicações

Tavares I, Morais M, Dias F, Medeiros R, Teixeira AL. Deregulated miRNAs in enzalutamide resistant prostate cancer: A comprehensive review of key molecular alterations and clinical outcomes. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2024 Mar;1879(2):189067, doi: 10.1016/j.bbcan.2023.189067

Nanowar2UrCancer; Sensitization of Urologic Tumors Therapy Driven by Nanotechnology
Entidade Financiadora: Fundação Para a Ciência e a Tecnologia
REF.: PTDC/MED-QUI/29800/2017
Financiamento: 239.937,55 euros
Agosto 2018- Janeiro 2022
PI e Co-PI: Rui Medeiros | João Prior (FFUP| REQUIMTE)

O cancro permanece um dos maiores problemas de saúde pública a nível mundial. De facto, em Portugal tem-se verificado um aumento significativo do número de novos casos diagnosticados ao longo dos últimos anos. Adicionalmente, a falta de resposta ou o desenvolvimento de resistência aos tratamentos anti-neoplásicos representa o maior desafio na área da Oncologia. O aumento de novos casos é acompanhado do aumento dos gastos associados ao tratamento dos doentes, o que tem um grande impacto sob o ponto de vista económico e social. Atualmente, sabe-se que apesar do grande investimento, os fármacos inovadores acabam por falhar, devido ao desenvolvimento precoce de resistências ao tratamento por parte das células tumorais. Este problema leva a uma perda total to investimento financeiro feito, desde o início do tratamento e, infelizmente, sem qualquer benefício para os doentes. O mesmo se aplica a outros tipos de tratamento, como é o caso da radioterapia, onde o investimento em infraestruturas e equipamentos tem sido elevado nos últimos anos. Assim, existe uma urgente necessidade de otimizar a eficácia das terapias antineoplásicas com o objetivo de melhorar a qualidade dos cuidados prestados ao doente. A abordagem proposta para resolver este problema consiste na combinação de nanopartículas de prata (AgNPs) com a administração de quimioterapia e radioterapia, de modo a maximizar a eficácia destes tratamentos standard. É importante referir que, a par do investimento em fármacos inovadores e dos custos associados aos mesmos, observou-se uma diminuição dos custos associados a terapias mais antigas como é o caso da quimioterapia. As AgNPs são fáceis de sintetizar usando uma abordagem de síntese verde, apresentam um baixo custo de produção, os seus efeitos citotóxicos podem ser controlados e podem ser desenhadas de modo a atuarem em alvos específicos, de que são exemplo os recetores membranares das células. A existência de AgNPs dirigidas a células neoplásicas irá permitir um enfraquecimento destas células, o que as tornará mais suscetíveis à quimioterapia e à radioterapia. Adicionalmente, o impacto das AgNPs na eficácia destes tratamentos também se poderá traduzir numa redução das doses administradas dos mesmos, diminuindo assim os efeitos secundários associados.

Publicações

Morais M, Machado V, Dias F, Figueiredo P, Dias F, Craveiro R, Lencart J, Palmeira C, Mikkonen KS, Teixeira AL, Medeiros R. Silver Nanoparticles (AgNPs) as Enhancers of Everolimus and Radiotherapy Sensitivity on Clear Cell Renal Cell Carcinoma. Antioxidants (Basel). 2023 Nov 28;12(12):2051. doi: 10.3390/antiox12122051.

Morais M, Machado V, Dias F, Figueiredo P, Palmeira C, Martins G, Fernandes R, Malheiro AR, Mikkonen KS, Teixeira AL, Medeiros R. Glucose-Functionalized Silver Nanoparticles as a Potential New Therapy Agent Targeting Hormone-Resistant Prostate Cancer cells. Int J Nanomedicine 2022 17: 4321-4337, doi: 10.2147/IJN.S364862. eCollection 2022.

Morais M, Machado V, Dias F, Palmeira C, Martins G, Fonseca M, Martins CSM, Teixeira AL, Prior JAV, Medeiros R. Starch-Capped AgNPs’ as Potential Cytotoxic Agents against Prostate Cancer Cells, Nanomaterials 2021 11(2): 256, doi: 10.3390/nano11020256

Morais M, Teixeira AL, Dias F, Machado V, Medeiros R, Prior JAV. Cytotoxic Effect of Silver Nanoparticles Synthesized by Green Methods in Cancer. Journal of Medicinal Chemistry 2020 63(23): 14308-14335, doi: 10.1021/acs.jmedchem.0c01055

SIRNAC; Novel Therapies Against Metastatic Colorectal Cancer
Entidade Financiadora: Agência de Inovação/ FEDER
REF.: NORTE-01-0247-FEDER-033399
Financiamento: 758 401. 000 euros (IPO 169 378,34)
Junho 2018- Janeiro 2022
Projeto em co-promoção: Phyzat, IPO Porto, INEB
PI do IPO Porto: Rui Medeiros

O presente projeto refere-se uma nova terapia para o cancro colorretal metastático no fígado, que visa reduzir de modo significativo os impactos de uma doença com um custo humano e económico extremamente pesados.
Este projeto cobre a fase de desenvolvimento do novo medicamento, no seguimento de uma fase de descoberta concluída com sucesso pelo líder do consórcio, em que foi feita a prova de eficácia in vitro e in vivo das moléculas eleitas. Engloba nomeadamente o desenvolvimento das moléculas eleitas, o desenvolvimento do sistema de entrega e a validação da relevância clínica e terapêutica, isolado ou em conjunto, dos dois novos alvos.
Este projeto vai permitir terminar a fase de desenvolvimento e licenciar o programa para dar início aos ensaios regulamentares com vista à aprovação da nova terapia.

Publicações

Almeida C, Teixeira AL, Dias F, Morais M, Medeiros R. Extracellular Vesicles as Potential Therapeutic Messengers in Cancer Management. Biology (Basel). 2023 Apr 27;12(5):665. doi: 10.3390/biology12050665.

Almeida C, Teixeira AL, Dias F, Machado V, Morais M, Martins G, Palmeira C, Sousa ME, Godinho I, Batista S, Costa-Silva B, Medeiros R. Extracellular Vesicles Derived-LAT1 mRNA as a Powerful Inducer of Colorectal Cancer Aggressive Phenotype. Biology (Basel), 2022. 11(1), doi: 10.3390/biology11010145

Dias F, Almeida C, Teixeira AL, Morais M, Medeiros R. LAT1 and ASCT2 Related microRNAs as Potential New Therapeutic Agents against Colorectal Cancer Progression. Biomedicines. 2021 16;9(2):195, doi: 10.3390/biomedicines9020195

Lopes C, Pereira C, Medeiros R. ASCT2 and LAT1 Contribution to the Hallmarks of Cancer: From a Molecular Perspective to Clinical Translation. Cancers (Basel). 2021 Jan 8;13(2):203, doi: 10.3390/cancers13020203

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

EXOmiRs4RCC; Renal cell carcinoma-derived exosome: the microRNA content as a new disease predictive biomarker and an opportunity to invasive/metastatic disease management under the genetic background
REF.: CI-IPOP-21-2015
02/01/2019 – 30/12/2025
Financiamento: 5000€
PI e Co-PI: Ana Luísa Teixeira | Rui Medeiros

Um dos maiores paradigmas da oncobiologia é a falta de evidências relativamente ao que leva um tumor a metastizar. Deste modo, a compreensão dos mecanismos do processo metastático irá melhorar significativamente a gestão clínica da doença. A deteção dos níveis circulantes de miRNAs poderá proporcionar uma oportunidade para a definição de novos e mais acessíveis biomarcadores moleculares, úteis na motorização da progressão do CCR, abrindo novas possibilidades para o desenvolvimento de novas terapias dirigidas. Perfis de miRNAs derivados de vesículas extracelulares (VEs-miRNAs) poderão ajudar a caracterizar o curso da doença, e permitir o ajustamento terapêutico antes do desenvolvimento de metástases, melhorando a sobrevivência dos doentes. A análise de um perfil de específico the VEs-miRNAs, avaliado a partir de amostras de sangue, pode ser uma estratégia mais precisa e menos invasiva, com potencial benefício de antecipar progressão do CCR. Adicionalmente, a identificação de polimorfismos genéticos funcionais em genes codificantes de proteínas envolvidas na biogénese de miRNAs poderá ser uma abordagem útil e complementar na compreensão da regulação dos mesmos.

Publicações

Teixeira AL, Patrão AS, Dias F, Silva C, Vieira I, Silva JF, Ferreira M, Morais A, Maurício J and Medeiros R. AGO2 expression levels and related genetic polymorphisms: influence in renal cell progression and aggressive phenotypes. Pharmacogenomics 2021. 22(16):1069-1079, doi: 10.2217/pgs-2021-0072

Dias F; Teixeira AL; Nogueira I; Morais M; Maia J; Bodo C; Ferreira M; Silva A; Vilhena M; Lobo, J; et al. Extracellular Vesicles Enriched in hsa-miR-301a-3p and hsa-miR-1293 Dynamics in Clear Cell Renal Cell Carcinoma Patients: Potential Biomarkers of Metastatic Disease. Cancers (Basel) 2020, 12, doi:10.3390/cancers12061450

Dias F.; Teixeira AL; Nogueira I; Morais M; Maia J; Bodo C; Ferreira M; Vieira I; Silva J; Lobo J; et al. Plasma Extracellular Vesicle-Derived TIMP-1 mRNA as a Prognostic Biomarker in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Pilot Study. Int J MolSci 2020, 21, doi:10.3390/ijms21134624

EUPICPHARMADCP; Pharmacogenomic determinants of therapeutic response of urogynecological cancer
REF.: CI-IPOP-22-2015
01/01/2016 – 30/12/2025
Financiamento: 5000€
PI: Rui Medeiros

O projeto tem como objetivo a caracterização dos mecanismos moleculares associados ao cancro e resposta ao tratamento, através da identificação de biomarcadores moleculares. No âmbito da Medicina de Precisão, o objetivo foca-se no estudo e validação de biomarcadores circulantes com relevância clínica, sendo a estratificação dos doentes e otimização das terapêuticas importantes abordagens na gestão dos doentes. Deste modo, propomos a incorporação da informação genética individual para clarificar como o património genético individual afeta a resposta e eficácia do tratamento ou o desenvolvimento de efeitos secundários ou adversos relacionados com o tratamento.

Publicações

Neto BV, Tavares V, da Silva JB, Liz-Pimenta J, Marques IS, Carvalho L, Salgado L, Pereira D, Medeiros R. Thrombogenesis-associated genetic determinants as predictors of thromboembolism and prognosis in cervical cancer. Sci Rep. 2023, 13 1: 9519-9519. doi.org/10.1038/s41598-023-36161-w.

Silva J, Tavares V, Afonso A, Garcia J, Cerqueira F, Medeiros R. Plasmatic MicroRNAs and Treatment Outcomes of Patients with Metastatic Castration-Resistant Prostate Cancer: A Hospital-Based Cohort Study and In Silico Analysis. Int J Mol Sci. 2023, 24 10: 9101-9101. doi.org/10.3390/ijms24109101

Abreu, SC, Tavares, V, Carneiro, F and Medeiros, R. Venous thromboembolism and prostate cancer: what about genetic markers? Pharmacogenomics. 2021, 22, doi: https://doi.org/10.2217/pgs-2020-0094

Afonso, A.; Silva, J.; Lopes, A.R.; Coelho, S.; Patrão, A.S.; Rosinha, A.; Carneiro, F.; Pinto, A.R.; Maurício, M.J.; Medeiros, R. YB-1 variant and androgen receptor axis-targeted agents in metastatic castration-resistant prostate cancer patients. Pharmacogenomics 2020, 21, 919-928, doi:10.2217/pgs-2020-0008

Tavares, V, Pinto, R, Assis, J, Coelho, S, Brandão, M, Alves, S, Pereira, D and Medeiros, Implications of venous thromboembolism GWAS reported genetic makeup in the clinical outcome of ovarian cancer patients. The pharmacogenomics journal. 2021, 21) DOI: https://doi.org/10.1038/s41397-020-00201-9

Cardoso J, Medeiros R, Dias F, Costa I, Ferrari R, Berardo P and Perini J. DROSHA rs10719 and DICER rs3742330 polymorphisms in endometriosis and different diseases: Case-control and review studies. Exp Mol Pathol 2021, 119:104616. Doi: 10.1016/j.yexmp.2021.104616

Brausi, M.; Hoskin, P.; Andritsch, E.; Banks, I.; Beishon, M.; Boyle, H.; Colecchia, M.; Delgado-Bolton, R.; Höckel, M.; Leonard, K.; et al. ECCO Essential Requirements for Quality Cancer Care: Prostate cancer. Crit Rev Oncol Hematol 2020, 148, 102861, doi:10.1016/j.critrevonc.2019.102861.

Morais, M.; Dias, F.; Resende, T.; Nogueira, I.; Oliveira, J.; Maurício, J.; Teixeira, A.L.; Medeiros, R. Leukocytetelomerelength and hTERT genetic polymorphism rs2735940 influence the renal cell carcinoma clinical outcome. Future Oncol 2020, 16, 1245-1255, doi:10.2217/fon-2019-0795

Morais, M.; Dias, F.; Teixeira, A.L.; Medeiros, R. Telomere Length in Renal Cell Carcinoma: The Jekyll and Hyde Biomarker of Ageing of the Kidney. Cancer Manag Res 2020, 12, 1669-1679, doi:10.2147/cmar.S211225

Pinto, A.R.; Silva, J.; Pinto, R.; Medeiros, R. Aggressive prostate cancer phenotype and genome-wide association studies: where are we now? Pharmacogenomics 2020, 21, 487-503, doi:10.2217/pgs-2019-0123

Tavares, V.; Pinto, R.; Assis, J.; Pereira, D.; Medeiros, R. Venous thromboembolism GWAS reported genetic makeup and the hallmarks of cancer: Linkage to ovarian tumour behaviour. Biochim Biophys Acta Rev Cancer 2020, 1873, 188331, doi:10.1016/j.bbcan.2019.188331

Cardoso, J.V.; Perini, J.A.; Machado, D.E.; Pinto, R.; Medeiros, R. Systematic review of genome-wide association studies on susceptibility to endometriosis. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2020, 255, 74-82, doi:10.1016/j.ejogrb.2020.10.017

MIRNAVIRAL; microRNA-mediated viral regulation of the tumor microenvironment
REF.: CI-IPOP-66-2017
01/01/2018 – 30/12/2025
Financiamento: 5000€
PI: Rui Medeiros

O vírus do papilloma humano de alto risco (human papillomavirus: HPV) é o fator etiológico de diversos tipos de cancro. Adicionalmente, sadmite-se que o microambiente tumoral tem um papel chave na progressão tumoral, permanecendo por clarificar alguns dos mecanismos associados. MicroRNAs e long non-coding RNAs são moléculas desreguladas em vários tipos de cancro induzidos pelo HPV, podendo afetar a biologia e progressão destas neoplasias. Deste modo, torna-se relevante clarificar e avaliar a interação destes intervenientes de modo a clarificar os processos moleculares associados.

Publicações

Costa AC, Santos JMO, Medeiros-Fonseca B, Oliveira PA, Bastos MMSM, Brito HO, Gil da Costa RM, Medeiros R. Characterizing the Inflammatory Microenvironment in K14-HPV16 Transgenic Mice: Mast Cell Infiltration and MicroRNA Expression. Cancers (Basel). 2022 Apr 28;14(9):2216, doi: 10.3390/cancers14092216

Dias TR, Santos JMO, Estêvão D, Costa NR, Mestre VF, Medeiros-Fonseca B, Bastos MMSM, Oliveira PA, Gil DA Costa RM, Medeiros R. Expression of LncRNAs in HPV-induced Carcinogenesis and Cancer Cachexia: A Study in K14-HPV16 Mice. Anticancer Res. 2022 May;42(5):2443-2460, doi: 10.21873/anticanres.15723

Brito HO, Calixto JRR, Medeiros R, da Costa RMG. Comment on DKK1 inhibits canonical Wnt signaling in human papillomavirus-positive penile cancer cells. Transl Oncol. 2022 Feb;16:101326, doi: 10.1016/j.tranon.2021.101326

Dias, T.R., Santos, J.M.O.,Gil da Costa, R.M.,Medeiros, R., Long non-coding RNAs regulate the hallmarks of cancer in HPV-induced malignancies, Crit Rev Oncol Hematol, 161 (2021) 103310, doi: 10.1016/j.critrevonc.2021.103310
Costa, A.C., Santos, J.M.O., Gil da Costa, R.M.,Medeiros, R., Impact of immune cells on the hallmarks of cancer: A literature review. Crit Rev Oncol Hematol, 168 (2021) 103541 DOIhttps://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2021.103541

Mestre, V.F.; Medeiros-Fonseca, B.; Estêvão, D.; Casaca, F.; Silva, S.; Félix, A.; Silva, F.; Colaço, B.; Seixas, F.; Bastos, M.M.; Medeiros R et al. HPV16 is sufficient to induce squamous cell carcinoma specifically in the tongue base in transgenic mice. The Journal of Pathology 2020, 251, 4-11, doi:10.1002/path.5387

Peixoto da Silva S, Santos JMO, Mestre VF, Medeiros-Fonseca B, Oliveira PA, M MSMB, Gil da Costa RM, Medeiros R: Human papillomavirus 16-transgenic mice as a model to study cancer-associated cachexia. Internationaljournal of molecular sciences 2020, 21(14).

NeutroSAC; Cachexia Anorexia Syndrome and its Clinical, Pharmacogenomic and Biochemistry
REF.: CI-IPOP-118-2019
01/01/2020-31/12/2025
Financiamento: 5000€
PI: Rui Medeiros

Uma síndrome denominada caquexia está frequentemente presente em doentes com cancro, aumentando a morbidade e mortalidade. Sabe-se que as citoquinas inflamatórias são peças-chave durante o desenvolvimento desta síndrome. Além disso, os microRNAs também têm emergido como sendo importantes moléculas na caquexia. A nossa hipótese é que os microRNAs podem atuar como mediadores na caquexia induzida pela inflamação.

Publicações

Mota INR, Satari S, Marques IS, Santos JMO, Medeiros R. Adipose tissue rearrangement in cancer cachexia: The involvement of β3-adrenergic receptor associated pathways. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2024 May;1879(3):189103. doi: 10.1016/j.bbcan.2024.189103

Liz-Pimenta J, Tavares V, Neto BV, Santos JMO, Guedes CB, Araújo A, Khorana AA, Medeiros R. Thrombosis and cachexia in cancer: Two partners in crime? Crit Rev Oncol Hematol. 2023 Jun;186:103989. doi: 10.1016/j.critrevonc.2023.103989.

Santos JMO, Peixoto da Silva S, Bastos MMSM, Oliveira PA, Gil da Costa RM, Medeiros R. Decoding the role of inflammation-related microRNAs in cancer cachexia: a study using HPV16-transgenic mice and in silico approaches. J Physiol Biochem. 2022 May;78(2):439-455. doi: 10.1007/s13105-021-00866-1.

Santos JMO, Costa AC, Dias TR, Satari S, Costa E Silva MP, da Costa RMG, Medeiros R. Towards Drug Repurposing in Cancer Cachexia: Potential Targets and Candidates. Pharmaceuticals (Basel). 2021 Oct 26;14(11):1084. doi:10.3390/ph14111084.

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS (Top 5)

Rosário A, Sousa A, Varandas T, Marinho-Dias J, Medeiros R, Martins G, Monteiro P, Sousa H. Impact of cervicovaginal microbiome on the risk of cervical abnormalities development. J Med Virol. 2023;95(5):e28762, doi: 10.1002/jmv.28762

Rosário A, Sousa A, Marinho-Dias J, Medeiros R, Lobo C, Leça L, Coimbra N, Tavares F, Baldaque I, Martins G, Monteiro P, Henrique R, Sousa H. Impact of high-risk Human Papillomavirus genotyping in cervical disease in the Northern region of Portugal: Real-world data from regional cervical cancer screening program. J Med Virol. 2023;95(1):e28414 doi10.1002/jmv.28414

COLABORAÇÕES NACIONAIS

Adhemar Longatto, Escola de Ciências da Vida e da Saúde da Universidade do Minho

Alberto Araújo, Faculdade Farmácia da Universidade do Porto

Bruno Costa-Silva, Fundação Champallimaud

Fátima Barroso, ISEP | REQUIMTE LAQV

Herlander Marques, Escola de Ciências da Vida e da Saúde, Universidade do Minho

João Prior, Faculdade Farmácia da Universidade do Porto | REQUIMTE LAQV

José Carlos Machado, IPATIMUP/ I3S

Margarida Bastos, Departamento Engenharia Química, Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto

Paula Oliveira, Departamento de Ciências Veterinárias, Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

David Boutolleau, Universidade Sorbonne, UPMC Université, Centre d’Immunologie et des Maladies Infectieuses, França

Jamila Perini, Escola Nacional de Saúde Pública, Fundação Oswald Cruz, Brasil

Kirsi Mikkonen, Departamento Food and Nutrition, Faculdade da Agricultura e Florestas, Universidade Helsínquia, Finlândia

Klaas Kok, Departamento Genética, Universidade Medical Center Groningen (UMCG), Holanda

Patrícia Figueiredo, Departamento Food and Nutrition, Faculdade da Agricultura e Florestas, Universidade Helsínquia, Finlândia

Peter S. Nelson, Fred Hutchinson Cancer Research Center (FHCRC), USA

Rui Gil da Costa, Universidade Federal do Maranhão, Brasil

Unidade de Investigação Clínica

A Unidade de Investigação Clínica foi criada no início de 2006 e tem como principais objetivos:

Atrair para o IPO-Porto os melhores Ensaios Clínicos mundiais
Apoiar na sua execução
Zelar pelo cumprimento dos respetivos protocolos e procedimentos, promovendo o envolvimento do maior número possível de profissionais da instituição

Como consequência do trabalho desenvolvido, suportado por uma equipa profissionalizada, registou-se um crescimento progressivo e sustentado do número de Ensaios Clínicos e de doentes recrutados, reduzindo-se o respetivo tempo de implementação, com o consequente ganho em competitividade.

Por estas razões, o IPO-Porto é atualmente um centro de referência para os Ensaios Clínicos realizados em Portugal na esmagadora maioria das patologias tratadas na instituição. A presença ao mais alto nível no universo dos Ensaios Clínicos exige grande rigor e dedicação de todos os profissionais.

A Unidade de Investigação Clínica espera manter nos próximos anos o crescimento sustentado do desempenho e fomentar a participação em Ensaios Clínicos de fases ainda mais precoces (Fase I e II), nomeadamente com a criação de uma unidade específica para Ensaios de Fase I. Para que estes objetivos sejam realidade, o IPO-Porto conta com a colaboração de todos.

O IPO-Porto tem, em desenvolvimento, vários ensaios clínicos em diversas áreas da oncologia, com o objetivo de testar novos métodos e medicamentos na luta contra o cancro.

Unidade de Investigação em Enfermagem Oncológica

A UIEO foi criada em 2022 e integra enfermeiros, essencialmente do IPO Porto, com interesse em desenvolver investigação na área da enfermagem oncológica. Pretende contribuir para os cuidados centrados no doente, por via da compreensão dos fenómenos associados à doença oncológica e ao seu tratamento, bem como do seu impacto em resultados reportados pelos doentes. Tem ainda como missão, estimular e desenvolver a investigação em enfermagem oncológica no IPO Porto, através da valorização das competências dos seus profissionais.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Rui Costa, RN, MA, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-7040-3487 / 4E16-8BAA-8FA5 Enfermeiro no Serviço de Medicina do Trabalho do IPO Porto. Presidente da Sociedade Portuguesa de História da Enfermagem (SPHE)
E-mail: rui.costa@ipoporto.min-saude.pt

EQUIPA

Investigadores Sénior

Isabel Veiga Malta, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3229-0677 / 1911-2A0A-7240
Diretora do Serviço de Esterilização
E-mail: isabel.malta@ipoporto.min-saude.pt

Maria Esmeralda Reis Barreira, RN, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5880-1669 / 341E-D243-5BE3
Enfermeira especialista na Clínica do Pulmão
E-mail: ebarreira@ipoporto.min-saude.pt

Rosa Maria Andrade Proença, PhD
Ciência ID: 6813-201C-7174
Técnica Superior na Escola Portuguesa de Oncologia do Porto
E-mail: rosa.proenca@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Ana Maria Gomes Almeida, RN, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-9725-4159 / 321E-7BD3-AD75
Enfermeira no Departamento de Ciências da Imagem e Radioncologia do IPO Porto
E-mail: ana.m.almeida@ipoporto.min-saude.pt

Assistentes de Investigação

Ana Cristina Rodrigues, RN, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-1670-8842 / 5016-3F18-58F6
Enfermeira Especialista no Serviço de Nefrologia – Unidade de Hemodiálise do IPO Porto
E-mail: anacrodrigues@ipoporto.min-saude.pt

Ana Maria Trigo Macedo Martins, RN, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-5678-4575 / 1B11-4884-D8E6
Enfermeira Especialista no Serviço de Oncologia Cirúrgica do IPO Porto
E-mail: amaria.martins@ ipoporto.min-saude.pt

Andreia Jorge Neves Salvini Guimarães Vieira, RN, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0009-0002-1767-838X / BB1D-956E-2EE5
Enfermeira Especialista no Bloco Operatório de Ambulatório do IPO Porto
E-mail: andreiasalvini@ipoporto.min-saude.pt

Diana Ramada, RN, MSc
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4347-4471 / 4B11-C6D1-15D1
Enfermeira Especialista no Centro de Inovação Terapêutica em Oncologia (CITO) no IPO Porto
E-mail: diana.ramada@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Bruno Magalhães, RN, MSc, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-6049-8646 / 3911-5498-3A15
Professor Coordenador na Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro (UTAD)
E-mail: brunomm@utad.pt

Daniela França, RN, MSc, PhD
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-3687-8312 / D11F-BF21-66E3
Professora Adjunta na Escola Superior de Saúde de Santa Maria
E-mail: daniela.franca@ipoporto.min.saude.pt

Estudantes de doutoramento

Carla Regina Rodrigues da Silva, RN, MSc. Doutoranda na Universidade Católica Portuguesa (UCP)
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-5147-2751 / CA1A-6620-402F
Enfermeira Especialista no Serviço de Oncologia Cirúrgica do IPO Porto. Professora Assistente na Escola Superior de Saúde Norte Cruz Vermelha Portuguesa. Presidente da Sociedade Portuguesa de Enfermagem Oncológica (SPEO)
E-mail: carla.r.silva@ipoporto.min-saude.pt

Maria José Silva Dias, RN, MSc. Doutoranda na Universidade de Barcelona
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0003-0104-8156 / D515-E6F7-50E2
Enfermeira Especialista no Serviço de Gastrenterologia, IPO Porto.
E-mail: mjose.dias@ipoporto.min-saude.pt

Sara Manuela de Sousa Ferreira da Cruz, RN, MSc. Doutoranda na Universidade do Porto – Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (ICBAS)
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0001-7522-2802 / 6F14-F76C-AE5A
Enfermeira Especialista no Serviço de Oncologia Cirúrgica do IPO Porto; Professora Adjunta Convidada na Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário (CESPU).
E-mail: sara.ferreira@ipoporto.min-saude.pt

Luís Filipe Gonçalves da Silva, PT, RDN, MSc. Doutorando na Universidade da Coruña
ORCID ID/ Ciência ID: 0000-0002-4423-7443 / 6E1A-A675-49F4
Diretor Técnico, Gestor de Projetos e responsável pela consulta de Nutrição – no norte – de doenças raras neuromusculares da Associação Portuguesa de Esclerose Lateral Amiotrófica.
E-mail: flip.goncalves@gmail.com

OBJETIVOS

O grupo de investigação pretende contribuir para a compreensão dos processos associados à doença oncológica, e para avaliação do impacto de intervenções centradas nas pessoas e seus familiares/cuidadores. As áreas prioritárias de investigação são: monitorização de complicações e adesão ao regime terapêutico; transição e inovação digital; inovação em oncologia; satisfação e identidade profissional.

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS (até 5)

Moura, D.B., de Fátima Sousa Andrade D., Silva, C.R., Soares-Pinto, I.E. Environmental Comfort in Promoting Sleep in Critically Ill Patients: A Scoping Review. Dimens Crit Care Nurs. 2024; May-Jun 01;43(3):146-157.

Sílvia Fernandes, C., Belém Vale, M., Magalhães, B., Castro, J., Azevedo, M., Lourenço, M. Developing a Card Game for Assessment and Intervention in the Person and the Family in Palliative Care: ” Pallium Game”. Int J Environ Res Public Health. 2023; 20(2):1449.

Salta, S., Lobo, J., Magalhães, B., Henrique, R., Jerónimo, C. DNA methylation as a triage marker for colposcopy referral in HPV-based cervical cancer screening: a systematic review and meta-analysis. Clin Epigenetics. 2023; Aug 2;15(1):125.

Gonçalves, F., Cabral, S., Moreira, A. P., Cunha, J., Magalhães, B. Characterization and monitoring of nutritional risk and nutritional status in oncological patients admitted to an oncological surgery unit: A longitudinal study. Clin Nutr ESPEN. 2023; 57:637-646.

Cunha, R., Ochoa, C., Pires, L.; Morais, M., Costa, R., Rocha, L. COVID-19 vaccine booster in healthcare workers – reasons for refusing. Pulmonology. 2022 Nov-Dec;28(6):476-477.

SCIENTIFIC COORDINATOR

TEAM Senior Researchers

Guest Researchers

PhD Students

Other collaborators

Aims

PROJECTS WITH EXTERNAL FUNDING

Selected publications (up to five)

COORDENADOR CIENTÍFICO

EQUIPA Investigadores Sénior

Investigadores Júnior

Doutorandos

Assistentes de Investigação

Outros colaboradores

OBJETIVOS

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

Publicações

Publicações

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS / CONSÓRCIOS

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respetivo coordenador.

COORDENADOR CIENTÍFICO

EQUIPA Investigadores Sénior

Investigadores Júnior

Investigadores Convidados

Doutorandos

Outros colaboradores:

OBJETIVOS

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

COLABORAÇÕES EM PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

COLABORAÇÕES EM PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

Publicações

Publicações Selecionadas

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respetivo coordenador.

COORDENADOR CIENTÍFICO

EQUIPA Investigadores Sénior

Investigadores Júnior

Investigadores Convidados

Estudantes de Doutoramento

IPO PORTO STAFF

Técnicos Superiores/Assistentes de Investigação

Estudantes de Mestrado

Outros colaboradores

Objectivos

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

*The information described in the group is the sole responsibility of the respective coordinator.

COORDENADOR CIENTÍFICO

EQUIPA

Investigadores Sénior

Investigadores Convidados

Estudantes em Doutoramento

Alunos de Mestrado

Outros Colaboradores

OBJETIVOS

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

Publicações

Books, & Book Chapters

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS (até 5)

COLABORAÇÕES NACIONAIS

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

COORDENADOR CIENTÍFICO

EQUIPA

Investigadores Sénior

Investigadores Júnior

Investigadores Convidados

Doutorandos

Assistentes de Investigação

Mestrandos

Outros colaboradores

OBJETIVOS

PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

Publicações

Publicações

Publicações

PROJETOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

TEAM
Senior Researchers

EQUIPA
Investigadores Sénior

EQUIPA
Investigadores Sénior

EQUIPA
Investigadores Sénior

EQUIPA
Investigadores Sénior