Grupo de Abordagem de Lesões Pré-Cancerosas & Cancro Precoce
O grupo PRECAM representa uma rede ímpar na área da investigação clínica e de translação em Cancro Precoce, com maior foco em Oncologia Gastrointestinal, reunindo investigadores de diferentes instituições de referência no cancro, como o IPO do Porto, IPO de Coimbra e o Centro Hospitalar Universitário do Porto.
Esta equipa multidisciplinar revê-se na missão principal de criar novo conhecimento e avaliar tecnologias novas e disruptivas numa visão compreensiva e integrativa, com o intuito de melhorar o diagnóstico e seguimento de doentes com lesões precursoras e cancro precoce, através da personalização dos cuidados em saúde.
COORDENADOR CIENTÍFICO
Mário Dinis Ribeiro, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-0121-6850
Ciência ID: 731E-7010-177F
Assistente Graduado Sénior
Diretor do Departamento de Medicina IPOP
Sub-coordenador LT2 – Cancro / RISE@CI-IPO (Rede de Investigação em Saúde, Centro de Investigação IPO)
Professor Catedrático Convidado MEDCIDS / FMUP
E-mail: mario.ribeiro@ipoporto.min-saude.pt
EQUIPA
Investigadores Sénior
Ana Carina Pereira, PhD
ORCID ID: 0000-0003-4302-2501
Ciência ID: 3515-2BE2-B60D
Investigadora Auxiliar
Investigadora Auxiliar CI-IPOP
E-mail: ana.martins.pereira@ipoporto.min-saude.pt
Filipa Fontes, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9246-589X
Ciência ID: 5F10-FB9E-C805
Investigadora Auxiliar
Investigadora Auxiliar CI-IPOP
E-mail: filipa.fontes@ipoporto.min-saude.pt
Miguel Areia, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9787-8175
Ciência ID: 3516-7AAD-D948
Assistente Hospitalar Graduado de Gastrenterologia IPOC
Co-Editor Associado GE Portuguese Journal of Gastroenterology
Membro da Equipa Editorial do jornal Endoscopy
E-mail: miguel.areia75@gmail.com
Pedro Pimentel Nunes, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-7308-3295
Ciência ID: 0616-5C59-DC3B
Assistente Hospitalar Graduado
Diretor Clínico de Gastrenterologia Unilabs
Professor Associado Convidado FMUP
E-mail: pedronunesml@gmail.com
Ricardo Marcos Pinto, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-9695-8261
Ciência ID: 791D-EF1B-B4C7
Assistente Hospitalar Graduado
Assistente Hospitalar Graduado de Gastrenterologia CHUSA
Professor Auxiliar Convidado ICBAS
E-mail: ricardomarcospinto@sapo.pt
Investigadores Júnior
Ana Paula Santos, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-8896-305X
Ciência ID: BC1E-DE39-17DF
E-mail: anapaulasantos@ipoporto.min-saude.pt
Andreia Albuquerque, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-5258-2987
Ciência ID: DD1A-51B5-316E
E-mail: a.albuquerque.dias@gmail.com
Diogo Libânio, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-2691-7522
Ciência ID: 1C13-7D9E-A4B5
E-mail: diogo.monteiro@ipoporto.min-saude.pt
Ricardo Kuttner Magalhães, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0002-8522-5756
Ciência ID: F31A-B091-3D92
E-mail: rkuttner@gmail.com
Doutorandos
Catarina Lopes, MSc
ORCID ID: 0000-0003-0176-286X
Ciência ID: 6719-02C2-856E
E-mail: catarina.p.lopes@ipoporto.min-saude.pt
Assistentes de Investigação
Tatiana Cruz Almeida, MSc
ORCID ID: 0000-0002-9444-8257
Ciência ID: CD18-88C4-CE90
E-mail: tatiana.almeida@ipoporto.min-saude.pt
Outros colaboradores
Catarina Brandão, MD
Diretora Serviço de Gastroenterologia
ORCID ID: 0009-0005-4718-9693
Ciência ID: 7D14-540E-A6BC
Inês Marques de Sá, MD
Assistente Hospitalar de Gastrenterologia IPOP
Ciência ID: F113-E6A1-43FD
Jéssica Chaves, MD
Interna de Gastrenterologia IPOP
ORCID ID: 0009-0009-2734-4755
Ciência ID: 6A17-89D0-34C7
Raquel Ortigão, MD
Assistente Hospitalar de Gastrenterologia IPOP
Ciência ID: CD1F-EABB-DC3B
OBJETIVOS
O grupo PRECAM tem como objetivos estruturantes no rastreio, diagnóstico e abordagem de condições/lesões precursores e cancro precoce digestivo (1) investigar o potencial do diagnóstico não invasivo, nomeadamente pelo recurso a biópsias líquidas e dispositivos point-of-care; (2) otimizar o diagnóstico minimamente invasivo através da avaliação de diferentes outcomes de tecnologias novas e disruptivas (p.e. endoscopia, qualidade em endoscopia, inteligência artificial); e (3) desenhar e avaliar abordagens e serviços clínicos compreensivos (p.e. definição de regras de decisão clínica, desenvolvimento de intervenções e estudos de custo-efetividade). Propomo-nos ainda explorar estas abordagens/plataformas noutros modelos tumorais.
PROJETOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO
AIDA – An Artificially Intelligent Diagnostic Assistant for gastric inflammation; Horizon Europe; 101095359; 6 334 803,75€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP e líder de pacote de trabalhos)
A maioria dos casos de cancro gástrico (CG) é detetada numa fase avançada, quando os doentes têm uma esperança média de vida de cerca de 12 meses. Diagnosticar os doentes numa fase inicial, pré-sintomática e normalmente envolvendo a inflamação gástrica crónica, pode melhorar significativamente o prognóstico.
A Inteligência Artificial (IA) pode auxiliar a equipa médica a melhor compreender os dados, automatizando grande parte do tratamento e análise, que exige trabalho manual e anos de experiência. Mas pode fazer ainda mais: pode reunir dados de várias origens numa fonte robusta e correlacionar os dados por forma a derivar uma escala de risco para CG e esclarecer mecanismos da sua evolução.
O objetivo do AIDA é precisamente esse! Ajudar os investigadores a compreender os mecanismos que desencadeiam a carcinogénese gástrica, a diagnosticar a inflamação pré-cancerosa o mais cedo possível, a informar estratégias terapêuticas personalizadas para o tratamento e vigilância, assim como recomendações personalizadas para monitorização do estado de saúde dos doentes, contribuído assim para a prevenção de cancro gástrico. Isto posiciona o AIDA diretamente na agenda europeia de Staying healthy in a rapdly changing society.
Este consórcio reúne as maiores autoridades europeias no domínio da inflamação e cancro gástrico, peritos em IA e machine learning, governação de dados e privacidade, e representantes da administração pública e doentes. O AIDA tem também fortes ligações à indústria.
O desenho robusto e princípios do AIDA, a sua relevância social e durabilidade prometem um ecossistema dinâmico focado na inflamação crónica gástrica, sua compreensão e tratamento que pretende inspirar outras colaborações de dados na área da saúde – para outras inflamações crónicas, modelos de cancro ou doenças em geral.
TOGAS – TOwards GAstric cancer Screening implementation in the European countries; EU4H; 101101252; 11 337 063,81€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP e líder de pacote de trabalhos)
Atualmente, na Europa não existe nenhuma estratégia de rastreio eficaz na prevenção de cancro gástrico (CG). Espera-se, no entanto, que a erradicação da Helicobacter pylori conduza a uma redução da mortalidade em 40%. Outra abordagem passa pela deteção precoce de lesões pré-cancerosa e seu seguimento.
O objetivo principal do TOGAS é gerar conhecimento baseado na evidência para informar planos de implementação de estratégias de prevenção na União Europeia. Os resultados do TOGAS pretendem auxiliar os decisores políticos na inclusão do rastreio do CG nas suas prioridades em cuidados de saúde, sem ignorar a eficácia, aplicabilidade e aceitabilidade com os potenciais efeitos adversos a longo prazo.
O TOGAS envolverá a implementação de três estudos-piloto, cada um desenhado para abordar aspetos específicos do rastreio e deteção precoce de CG. Este consórcio reúne 18 parceiros e três parceiros associados que representam instituições de ensino superior, estruturas de investigação, clínicas e organizações da sociedade civil de 14 estados-membros.
ONCOSCREEN – A European “shield” against colorectal cancer based on novel, more precise and affordable risk-based screening methods and viable policy pathways; HORIZON EUROPE; 101097036; 12 972 076,25€ (2023-2026); Mário Dinis-Ribeiro (IP@IPOP) e Luís Lima (Co-IP@GPTE)
Uma campanha multinível para melhorar o rastreio de cancro colorretal.
O rastreio de cancro colorretal (CCR) de base populacional é recomendado na União Europeia (EU), no entanto apenas um em cada sete cidadãos da EU participa nestes programas, representado o CCR 12,4% de todas as mortes por cancro. O ONCOSCREEN pretende inverter este cenário através da promoção de abordagens precisas, não invasivas, custo-eficazes, baseadas em tecnologias inovadoras para uma maior sensibilização para esta doença. Variáveis genéticas, económicas e fatores ambientais serão integrados nestas abordagens personalizadas, permitindo uma estratificação de risco para CCR. O consórcio ONCOSCREEN reúne 38 parceiros e está alinhado com a Missão Cancro do Horizonte Europa.
BioFaeC – Novel faecal biomarkers for early detection of precancerous lesions and Cancer: Improving the current model for colorectal cancer screening; FCT; 2022.09051.PTDC; 49 909€ (2023-2024); Mário Dinis-Ribeiro (IP) e Luís Lima (Co-IP@GPTE)
Um dos maiores desafios no diagnóstico precoce e consequentemente melhor prognóstico de cancro colorretal (CCR) é a ausência de biomarcadores que permitam uma identificação precisa de doentes com um risco acrescido de progressão maligna. O desenvolvimento de um método de rastreio acessível e não invasivo que identifique também adenomas avançados (risco aumentado de progressão para CCR) fará avançar a deteção precoce de CCR face às atuais estratégias de base populacional aprovadas na União Europeia.
Assim, o BioFaeC propõe-se a identificar e validar um painel de biomarcadores que auxilie o diagnóstico precoce, pela deteção também de adenomas avançados a avaliar a sua aplicabilidade como ferramenta não invasiva.
O BioFaeC é um projeto exploratório, financiado no âmbito do Concurso FCT para Projetos de I&D em Todos os Domínios Científicos 2022 e resulta do consórcio de investigação IPOP e i3s (P.CCC Raquel Seruca) e terá a duração de 18 meses.
No IPOP e num esforço colaborativo, este projeto inovador está a ser desenvolvido nos grupos PRECAM e Grupo de Patologia e Terapêutica Experimental (GPTE).
CAGED – Computer Assisted Gastric Cancer Diagnosis; FCT; PTDC/EEI-EEE/5557/2020; 249.460,00€ (2021-2024); Miguel Coimbra (INESC TEC) & Mário Dinis-Ribeiro
O cancro gástrico é o terceiro mais mortal em todo o mundo e o rastreio minimamente invasivo e a endoscopia gastrointestinal desempenham um papel primordial para um diagnóstico precoce, crucial para a melhoria das taxas de sobrevivência. No entanto, devido a fatores técnicos e cognitivos, o risco de um falso diagnóstico causado por erro humano é possível.
Assim, o principal objetivo deste estudo é criar tecnologias baseadas em visão computacional para analisar, de forma automática, vídeos e imagens obtidos através de endoscopias gastrointestinais não invasivas.
A Inteligência Artificial, e mais especificamente a Visão Computacional, tem o potencial de mitigar as limitações existentes atualmente, ao fornecer ferramentas de avaliação automáticas da endoscopia que não só podem apoiar os médicos na deteção e caracterização de lesões de cancro gástrico, como podem monitorizar a próprias qualidade da endoscopia efetuada.
Publicações
Martins ML, Pedroso M, Libanio D, Dinis-Ribeiro M, Coimbra M, Renna F. Diagnostic Performance of Deep Learning Models for Gastric Intestinal Metaplasia Detection in Narrow-band Images. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2023 Jul;2023:1-4. doi: 10.1109/EMBC40787.2023.10340055.
Lima G, Coimbra M, Dinis-Ribeiro M, Libanio D, Renna F. Analysis of classification tradeoff in deep learning for gastric cancer detection. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2022;2022:2177-2180. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9871040.
Lopes I, Silva A, Coimbra M, Dinis-Ribeiro M, Libanio D, Renna F. Supervised and semi-supervised training of deep convolutional neural networks for gastric landmark detection. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2022;2022:2025-2028. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9870992
Renna F, Martins M, Neto A, Cunha A, Libânio D, Dinis-Ribeiro M, Coimbra M. Artificial Intelligence for Upper Gastrointestinal Endoscopy: A Roadmap from Technology Development to Clinical Practice. Diagnostics (Basel). 2022;12(5):1278. doi: 10.3390/diagnostics12051278
IMAGE – Individualized Gastric Adenocarcinoma Early Diagnosis and Improved Patients’ Survival: From Liquid Biopsies to a Comprehensive Management Approach; NORTE2020; NORTE-01-0145-FEDER-000050; 601.320,91€ (2021 – 2023); Mário Dinis-Ribeiro
O projeto IMAGE visa identificar e validar novos biomarcadores em circulação passíveis de serem facilmente detetados por metodologias não invasivas no diagnóstico precoce de cancro gástrico, que representa um problema social significativo em Portugal. A ferramenta de diagnóstico final abordará a doença numa fase precoce do seu desenvolvimento, resultando num aumento da sobrevida e qualidade de vida dos doentes, pelo recurso a procedimentos terapêuticos menos agressivos e invasivos. Este projeto encontra-se estruturado em três linhas de investigação (LI):
- na LI1 será implementada uma abordagem transcriptómica para identificar e validar um painel de biomarcadores salivares que permita o rastreio e seguimento não invasivo de cancro gástrico;
- na LI2, o foco é o conceito de endoscopia funcional, ou seja, a visão puramente morfológica/imagiológica da endoscopia será desafiada pela integração da informação de biomarcadores no suco gástrico (microbiota);
- na LI3, será desenhada uma regra de decisão clínica compreensiva, integrando dados clínicos, endoscópicos e moleculares com vista a um rastreio e seguimento de cancro gástrico personalizado.
Espera-se que as evidências que derivem deste estudo acrescentem ao conhecimento e melhorem as tecnologias disponíveis no diagnóstico precoce e vigilância de cancro gástrico. O recurso a biópsias líquidas permitirá potencialmente diminuir as disparidades no acesso aos cuidados de saúde, oferecendo melhores cuidados a quem mais beneficiará dos mesmos.
Publicações
Lopes C, Almeida TC, Pimentel-Nunes P, Dinis-Ribeiro M, Pereira C. Linking dysbiosis to precancerous stomach through inflammation: Deeper than and beyond imaging. Front Immunol. 2023;14:1134785. doi: 10.3389/fimmu.2023.1134785
Lopes C, Chaves J, Ortigão R, Dinis-Ribeiro M, Pereira C. Gastric cancer detection by non-blood-based liquid biopsies: A systematic review looking into the last decade of research. United European Gastroenterol J. 2023;11(1):114-130. doi: 10.1002/ueg2.12328
PUBLICAÇÕES SELECIONADAS
- Rei A, et al. Metachronous lesions after gastric endoscopic submucosal dissection: First assessment of the FAMISH predicting score. Endoscopy. 2023 May 9. doi: 10.1055/a-2089-6849
- Arribas J, et al. Standalone performance of artificial intelligence for upper GI neoplasia: a meta-analysis. Gut 2020. doi.org/10.1136/gutjnl-2020-321922
- Libânio D, et al. Prospective comparative study of endoscopic submucosal dissection and gastrectomy for early neoplastic lesions including patients’ perspectives. Endoscopy 2019;51(1):30-39. doi.org/10.1055/a-0628-6601
- Areia M, et al. Endoscopic screening for gastric cancer: A cost-utility analysis for countries with an intermediate gastric cancer risk. United European Gastroenterol J 2018;6(2):192-202. doi.org/10.1177/2050640617722902
- Hess T, et al. Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer. EBioMedicine. 2023;18(92):104616. doi: 10.1016/j.ebiom.2023.104616
COLABORAÇÕES NACIONAIS
Miguel Coimbra | INESC TEC
Adelino Leite-Moreira | UnIC
Conceição Calhau | CINTESIS / UNL
Salomé Pinho | i3s
Diogo Caetano & Elisabete Fernandes | INESC MN & INL
COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS / CONSÓRCIOS
Johannes Schumacher
Centro de Genética Humana, Universidade de Marburgo | Alemanha
Marino Venerito / Peter Malfertheiner
Consórcio: staR – European Network on the Germline Genetics of Gastric Cancer | Alemanha
Javier P. Gisbert / Francis Megraud / Colm O’Morain / Adrian G. McNicholl
Consórcio: Hp-EuReg – European Registry on the Management of Helicobacter Pylori Infection | Espanha
Rodrigo Jover | Consórcio: European Polyp Surveillance (EPoS) Trials | Europa
Talía Malagón / Kimon Chatzistamatiou / Elisabeth McClymont / Staci Sudenga / Anna R Giuliano
Consórcio: IPVS Early Career Working Group | Suiça
Tania Fleitas / Marcis Leja / Fátima Carneiro / Javier P. Gisbert / Leticia Moreira / Tamara Matysiak-Budnik / Laimas Jonaitis / Mário Dinis-Ribeiro / Manon Spaander
Consórcio: AIDA Consortium | Espanha
Marcis Leja / Tamara-Matysiak-Budnik / Iris Vogelaar-Lansdorp / Zorana Maravic / Javier P. Gisbert / Juozas Kupcinskas / Dan Lucian Dumitrascu / Annemieke Smet / Mike Morrissey / Katarzyna Neubauer / Nadan Rustemovic / Sandra Milic / Wessel vaonn de Veerdonk / Victoria McEneaney / Jochen Weigt
Consórcio: TOGAS Consortium | Grécia
Anax Fotopoulos / Markus Mohler |
Consórcio: ONCOSCREEN Consortium | Grécia