Epigenética e Biologia do Cancro (GEBC)

O GEBC foi estabelecido em 2008 e integra investigadores pré- e pós-doutorados, com formação académica diversa, incluindo Biólogos, Bioquímicos, licenciados em Anatomia Patológica, Citológica e Tanatológica e Médicos de várias especialidades, incluindo Patologistas, Urologistas, Ginecologistas, Radiologistas, Hemato-oncologistas e Oncologistas.

No contexto da Oncologia de Precisão, estamos a desenvolver vários projectos de investigação translacional em biologia do cancro centrados nos pacientes e com foco na biologia dos tumores, biopatologia, epigenética, epitranscriptómica, metabolismo tumoral e imunologia.

COORDENADOR CIENTÍFICO

Carmen Jerónimo, PhD
ORCID ID: 0000-0003-4186-5345
Investigadora Auxiliar
Coordenadora da TL2 – Cancro / RISE@CI-IPO (Rede de Investigação em Saúde, Centro de Investigação IPO)
Coordenadora Científica do Banco de Tumores – Serviço de Anatomia Patológica
Professora Catedrática Convidada do ICBAS-UP
Email: carmenjeronimo@ipoporto.min-saude.pt/cljeronimo@icbas.up.pt

EQUIPA

Investigadores Sénior

Rui Henrique, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-3171-4666
Investigador Sénior
Assistente graduado de Anatomia Patológica, Serviço de Anatomia Patológica
Professor Catedrático Convidado do ICBAS-UP
Email: henrique@ipoporto.min-saude.pt / rmhenrique@icbas.up.pt

Margareta P. Correia, PhD
ORCID ID: 0000-0003-4378-0820
Investigadora Auxiliar
Docente (Protocolo IPO/ICBAS) no Mestrado em Oncologia no ICBAS-UP & Mestrado em Medicina Molecular e Oncologia na FMUP
Professora Adjunta Convidada na ESS.IPP
Email: margareta.correia@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Júnior

Carla Bartosch, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0003-0646-7667
Assistente graduado de Anatomia Patológica, Serviço de Anatomia Patológica
Docente (Protocolo IPO/ICBAS) em Patologia, Mestrado Integrado em Medicina no ICBAS-UP
Email: carla.bartosch@ipoporto.min-saude.pt

João Lobo, MD, PhD
ORCID ID: 0000-0001-6829-1391
Interno de Anatomia Patológica no IPO Porto
Docente (Protocolo IPO/ICBAS) em Patologia, Mestrado Integrado em Medicina no ICBAS-UP & Biopatologia, Mestrado Integrado em Medicina Dentária na FMDUP
Email: jpedro.lobo@ipoporto.min-saude.pt

Nair Lopes, PhD
ORCID ID: 0000-0003-4732-7361
Email: nair.ribeiro.lopes@ipoporto.min-saude.pt

Vera Miranda-Gonçalves, PhD
ORCID ID: 0000-0002-4231-5532
Docente (Protocolo IPO/ICBAS) no Mestrado em Oncologia no ICBAS-UP & Mestrado em Medicina Molecular e Oncologia na FMUP
Email: vera.miranda.goncalves@ipoporto.min-saude.pt

Investigadores Convidados

Bianca Troncarelli Flores, PhD
ORCID ID: 0000-0002-6490-6309
Investigadora Convidada, Investigadora Auxiliar; Departamento de Genética Clínica
Vejle Sygehus, Sygehus Lillebælt; Dinamarca
E-mail: i37321@ipoporto.min-saude.pt; bianca.troncarelli@rsyd.dk

Sara Monteiro-Reis, PhD
ORCID ID: 0000-0002-2193-2793
Investigadora Convidada, Investigadora Bolseira de Pós-Doutoramento
Instituto de Engenharia Mecânica e Gestão Industrial – INEGI
E-mail: sara.raquel.reis@ipoporto.min-saude.pt; sreis@inegi.up.pt

Estudantes de Doutoramento

Ana Fernandes Rodrigues, MD (IPOP/ICO, L’Hospitalet, Barcelona, Espanha); Email: ana.fernandes.rodrigues@ipoporto.min-saude.pt
Ana Catarina Macedo-Silva, MSc (IPOP/Università degli studi della Campania “Luigi Vanvitelli”, Nápoles, Itália); Email: ana.catarina.macedo.silva@ipoporto.min-saude.pt
Bárbara Costa Matos, MSc (IBIMED-UA/IPOP-FCT SFRH/BD/146032/2019); Email: barbaracostamatos@ua.pt
Catarina Guimarães-Teixeira, MSc (IPOP-FCT-DFA/BD/6038/2020); Email: catarina.guimaraes.teixeira@ipoporto.min-saude.pt
Catarina Lourenço, MSc (IPOP/i3S-FCT 2021.06731.BD); Email: i37296@ipoporto.min-saude.pt
Cláudia Martins-Lima, MSc (IPOP/ Università degli studi della Campania “Luigi Vanvitelli”, Nápoles, Itália); Email: claudia.martins.lima@ipoporto.min-saude.pt
Daniela Barros-Silva, MSc (IPOP/Erasmus MC, Roterdão, Países Baixos-FCT-SFRH/BD/136007/2018); Email: daniela.silva@ipoporto.min-saude.pt
Diana Montezuma Felizardo, MD (IPOP); Email: diana.m.felizardo@ipoporto.min-saude.pt
Isaac Braga, MD (IPOP/CHUP); Email: isaac.braga@ipoporto.min-saude.pt
João André Carvalho, MD (IPOP); Email: joao.m.carvalho@ipoporto.min-saude.pt
Lígia Gonçalves, MD (IPOP); Email: ligiagoncalves@ipoporto.min-saude.pt
Maria Miguel Castro, MSc (i3S/IPOP-FCT-2020.07439.BD); Email: i37273@ipoporto.min-saude.pt
Marta Peixoto, MD (FMUP/IPOP); Email: martamesquitapeixoto@gmail.com
Mónica Pires, MD (CINTESIS/IPOP); Email: monica.pires@ipoporto.min-saude.pt
Nuno Coimbra, MD (IPOP); Email: nuno.coimbra@ipoporto.min-saude.pt
Rita Canário, MD (i3S/IPOP-FCT-PD/BD/128001/2016); Email: rita.canario@ipatimup.pt
Rui Freitas, MD (IPOP); Email: antoniofreitas@ipoporto.min-saude.pt
Sandra P. Nunes, MSc (IPOP/CIEMAT, Madrid, Espanha-FCT-SFRH/BD/144241/2019); Email: sandra.pinto.nunes@ipoporto.min-saude.pt
Sérgio Chacim, MD (IPOP); Email: sergio.chacim@ipoporto.min-saude.pt
Sofia Salta, MSc (IPOP-FCT-SFRH/BD/143717/2019); Email: sofia.salta@ipoporto.min-saude.pt
Tânia Lima, MSc (IBIMED-UA/IPOP-FCT- SFRH/BD/136904/2018); Email:tanialima@ua.pt
Vera Constâncio, MSc (IPOP/FChampalimaud- LCF/BQ/DR20/11790013); Email: vera.salvado.constancio@ipoporto.min-saude.pt

Assistentes de Investigação

Carina Carvalho-Maia, MSc (MindGaP- Horizon2020-FETOPEN-829040; Email: carina.carvalho.maia@ipoporto.min-saude.pt
Filipa Moreira-Silva, MSc (NORTE-01-0145-FEDER-072678 – TeamUp4Cancer); Email: filipa.m.silva@ipoporto.min-saude.pt
Gonçalo Outeiro-Pinho, MSc (NORTE-01-0145-FEDER-072678 – TeamUp4Cancer); Email: goncalo.outeiro.pinho@ipoporto.min-saude.pt
José Pedro Sequeira, MSc (LPCC-Norte); Email: jose.leite.sequeira@ipoporto.min-saude.pt
Nuno Tiago Tavares, MSc (NORTE-01-0145-FEDER-072678 – TeamUp4Cancer); Email: i12807@ipoporto.min-saude.pt

Estudantes de Mestrado

Ana Beatriz Ferreira Costa; Email: ana.f.costa@ipoporto.min-saude.pt
Ana Rita Teixeira-Marques; Email: ana.t.marques@ipoporto.min-saude.pt
Ângela Albuquerque-Castro; Email: i36015@ipoporto.min-saude.pt
Filipa Domingues dos Reis; Email: filipa.reis@ipoporto.min-saude.pt
Guilherme Machado da Silva; Email: guilherme.silva@ipoporto.min-saude.pt
Helena Estevão-Pereira; Email: helena.estevao.pereira@ipoporto.min-saude.pt
Mariana Cantante; Email: mferreira@ipoporto.min-saude.pt
Mariana Silva-Ferreira; Email: i36014@ipoporto.min-saude.pt
Miguel Oliveira Morim; Email: i37298@ipoporto.min-saude.pt
Sara Cardoso: Email: sara.cardoso@ipoporto.min-saude.pt
Saulė Gumauskaitė; Email: i37297@ipoporto.min-saude.pt
Tiago Brito da Rocha; Email: tiago.rocha@ipoporto.min-saude.pt

Outros colaboradores

Andreia Coutada, MSc; Interna de Anatomia Patológica
Ana Isabel Varelas, MSc; Interna de Anatomia Patológica
Ana Luísa Cunha, MD; Assistente graduado de Anatomia Patológica
Ana Teresa Martins, MSc; Técnica de Anatomia Patológica
Ângelo Rodrigues, MD; Assistente graduado de Anatomia Patológica
Davide Gigliano, MD; Assistente de Anatomia Patológica
Fernanda Silva, BSc; Técnica de Anatomia Patológica
Isa Carneiro, MSc; Técnica de Anatomia Patológica
João Pedro Costa, MD; Interno de Anatomia Patológica
João Vaz Silva, MD, PhD; Interno de Anatomia Patológica
Jorge Torres-Ferreira, MSc; Técnico de Anatomia Patológica
Paula Dias, BSc; Técnica de Anatomia Patológica
Paula Lopes, BSc; Técnica de Anatomia Patológica
Paula Monteiro, MD; Assistente graduado de Anatomia Patológica
Renata Vieira, BSc; Técnica de Anatomia Patológica
Rita Guimarães, MSc; Técnica de Anatomia Patológica
Rui Silva-Santos, MSc; Técnico de Anatomia Patológica
Sérgio Lopes, PhD; TSS em Terapia Celular
Sofia Paulino, MSc; Técnica de Anatomia Patológica
Verónica Ferreira, BSc; Técnica de Anatomia Patológica

Objetivo

O objetivo principal do nosso grupo é descrever em profundidade mecanismos de epigenética/epitranscriptómica envolvidos na carcinogénese, que possam ser utilizados como ferramentas clínicas para a deteção precoce, diagnóstico, prognóstico, e predição à terapia. A investigação dos mecanismos e funções de fármacos moduladores da epigenética (epi-fármacos) é outro objetivo importante. Para além disso, devido à relevância que a imuno-oncologia tem vindo a demonstrar em anos recentes, estamos também a explorar a modulação epigenética de biomoléculas envolvidas em respostas imunes, com o objetivo de melhorar as estratégias de imunoterapia.

PROJECTOS COM FINANCIAMENTO EXTERNO

• KYMAB-Immunoprofiling characterisation of clinical samples by IHC and gene expression analysis and correlation with clinical outcomes in support of translational medicine strategies for ICOS and PD-L1-IC antibody therapeutics. Kymab Ltd. (Cambridge, UK); Financiamento: 159K€ (2019-2022) (PI: Prof. Rui Henrique; Co-PI: Prof. Carmen Jerónimo)

Este projecto tem por objectivo apoiar a utilização de medicina de translação, da descoberta precoce ao desenvolvimento clínico, via fortalecimento da compreensão da expressão de alvos terapêuticos em amostras humanas clinicamente relevantes e da correlação com características clínicas de doença e outcome.

• MindGaP- Bridging the gap between Mind, Brain and Body: Exosome role and monitoring-H2020-FETOPEN, Financiamento: 799K€ (2019-2023) (PI: Prof. Rui Henrique; Co-PI: Prof. Carmen Jerónimo). Em colaboração com a UCoimbra, Escola de Engenharia do IPP e universidades europeias (LINU, VTT e UOULU)

O projecto MindGAP procura indicadores sensíveis de saúde em exossomas que circulam no corpo e que podem sofrer alterações em contexto de doença. Para esse fim, é explorada a possibilidade de utilizar a meditação MINDFULNESS enquanto ferramenta relacionada com a mente para controlar a carga de exossomas. Se a meditação for bem-sucedida na alteração do comportamento e atitudes de muitas pessoas, isso significa que a carga de exossomas pode ser alterada durante este processo. O conhecimento obtido tem por objectivo abrir portas a um dispositivo inovador que possa ser utilizado por todos para compreender o seu estado de saúde.

Publicações

Monteiro-Reis S, Carvalho-Maia C, Bart G, Vainio SJ, Pedro J, Silva ER, Sales G, Henrique R, Jerónimo C. Secreted Extracellular Vesicle Molecular Cargo as a Novel Liquid Biopsy Diagnostics of Central Nervous System Diseases.Int J Mol Sci. 22(6):3267, 2021. doi: 10.3390/ijms22063267.

• TRIMARKCHIP- Assessing the trifecta of cancer circulating biomarkers: a combined microfluidics platform for detection of CTCs, exosomes and ctDNA EM COLABORAÇÃO com INEB/i3S”, Agência financiadora: Fundação para a Ciência e Tecnologia (Technology and Science Foundation) – POCI-01-0145-FEDER-030831- (PTDC/BTM-TEC/30831/2017), Financiamento: 41K€ (2018-2022) (Co-PI: Prof. Carmen Jerónimo, PI-Prof. Fernando J Monteiro).

O projeto proposto foca-se no desenvolvimento de um sistema avançado de microfluidos one-chip para isolamento e caracterização de três biomarcadores em circulação presentes no sangue periférico de pacientes oncológicos: células tumorais circulantes (CTCs em inglês), DNA tumoral circulante (ctDNA em inglês) e exossomas. Este sistema avançado será aplicado no diagnóstico e prognóstico de cancro do pulmão, para auxiliar na selecção de tratamento e avaliar a resposta celular à terapia. O cancro do pulmão continua a ser o tipo de cancro mais mortífero a nível mundial, é difícil de diagnosticar em estadios precoces e encontra-se inacessível para biópsias tumorais. São necessárias novas estratégias para detecção precoce do tumor primário e metástases e para a correcta selecção de tratamentos específicos para os pacientes, dependendo das mutações tumorais. Este sistema seria uma ferramenta poderosa e minuciosa para avaliar, através de uma simples colheita de sangue, o panorama genético completo da doença, do tumor primário a possíveis metástases, auxiliando numa monitorização contínua e em tempo real de cada doença.

Publicações

Carvalho Â, Ferreira G, Seixas D, Guimarães-Teixeira C, Henrique R, Monteiro FJ, Jerónimo C. Emerging Lab-on-a-Chip Approaches for Liquid Biopsy in Lung Cancer: Status in CTCs and ctDNA Research and Clinical Validation. Cancers (Basel). 13(9):2101, 2021. doi: 10.3390/cancers13092101.
Lourenço C, Constâncio V, Henrique R, Carvalho Â, Jerónimo C. Urinary Extracellular Vesicles as Potential Biomarkers for Urologic Cancers: An Overview of Current Methods and Advances. Cancers (Basel). 13(7):1529, 2021. doi: 10.3390/cancers13071529.

PROJECTOS COM FINANCIAMENTO INTERNO

• MethylBiom4Can – Assessment and validation of a panel of methylation-based Biomarkers in cell free DNA for Detection of recurrent first primary cancer (RFPC) and second primary cancers (SPC) (CI-IPOP-74-2016), Financiamento: 192K€ (2016-2022) (PI: Prof. Carmen Jerónimo)

As abordagens standard atuais para o follow-up de doentes oncológicos incluem um conjunto reduzido de testes clínicos, imagiológicos e serológicos de eficiência limitada e sobretudo focados na detecção de recidiva e progressão da doença primária. Assim, um teste que possa simultaneamente fornecer informação sobre a recidiva do tumor primário (RFPC em inglês) e o surgimento de segundos tumores primários (SPC em inglês) pode produzir um forte impacto na gestão de pacientes. O objectivo principal deste projecto é o desenvolvimento de um teste multigenético, apoiado num conjunto de marcadores baseados em metilação e previamente caracterizados, para a detecção de recidiva de tumores primários e/ou detecção de tumores secundários em pacientes diagnosticados com cancro da próstata, mama, pulmão ou colorrectal.

Publicações

Constâncio V, Nunes SP, Moreira-Barbosa C, Freitas R, Oliveira J, Pousa I, Oliveira J, Soares M, Dias CG, Dias T, Antunes L, Henrique R, Jerónimo C. Early detection of the major male cancer types in blood-based liquid biopsies using a DNA methylation panel. Clin Epigenetics. 11(1):175, 2019. doi: 10.1186/s13148-019-0779-x 127. 125.
Nunes SP, Diniz F, Moreira-Barbosa C, Constâncio V, Silva AV, Oliveira J, Soares M, Paulino S, Cunha AL, Rodrigues J, Antunes L, Henrique R, Jerónimo C. Subtyping Lung Cancer Using DNA Methylation in Liquid Biopsies. J Clin Med. 8(9). pii: E1500, 2019. doi: 10.3390/jcm8091500.
Salta S, Nunes SP, Fontes-Sousa M, Lopes P, Freitas M, Caldas M, Antunes L, Castro F, Antunes P, Palma de Sousa S, Henrique R, Jerónimo C. A DNA Methylation-Based Test for Breast Cancer Detection in Circulating Cell-Free DNA. J Clin Med. 7;7(11). pii: E420, 2018. doi: 10.3390/jcm7110420.
Moreira-Barbosa C, Barros-Silva D, Costa-Pinheiro P, Torres-Ferreira J, Constâncio V, Freitas R, Oliveira J, Antunes L, Henrique R, Jerónimo C. Comparing diagnostic and prognostic performance of two-gene promoter methylation panels in tissue biopsies and urines of prostate cancer patients. Clin Epigenetics. 10(1):132, 2018. doi: 10.1186/s13148-018-0564-2.
Nunes SP, Moreira-Barbosa C, Salta S, Palma de Sousa S, Pousa I, Oliveira J, Soares M, Rego L, Dias T, Rodrigues J, Antunes L, Henrique R, Jerónimo C. Cell-Free DNA Methylation of Selected Genes Allows for Early Detection of the Major Cancers in Women. Cancers 10(10). pii: E357, 2018. doi: 10.3390/cancers10100357.
Freitas M, Ferreira F, Carvalho S, Silva F, Lopes P, Antunes L, Salta S, Diniz F, Santos LL, Videira JF, Henrique R, Jerónimo C. A Novel DNA Methylation Panel Accurately Detects Colorectal Cancer Independently of Molecular Pathway J Transl Med 16(1):45, 2018. doi: 10.1186/s12967-018-1415-9.

• DNAmeCERVIX- DNA methylation biomarkers for triage of hrHPV positive cases in the Northern Portugal population-based cervical cancer screening program financiado pelo Centro de Investigação do Instituto Português de Oncologia (PI 142-CI-IPOP-130-2020), Financiamento: 125K€ (2020-2022) (PI: Prof. Carmen Jerónimo; Co-PI: Prof. Rui Henrique). Em colaboração com a ARS-Norte.

As estratégias de rastreio baseadas no HPV podem ser feitas em larga escala devido à automatização e são muito sensíveis, em comparação com a citologia, mas falta-lhes especificidade, sobretudo entre mulheres jovens, consequência da alta prevalência de infecções transientes. Ainda assim, a metilação de DNA constitui um marcador de triagem promissor para encaminhamento para colposcopia de mulheres positivas para HR-HPV, mostrando níveis de sensibilidade superiores à citologia neste contexto. O objectivo principal deste projecto é validar um painel de marcadores baseados em metilação de DNA para triagem de mulheres com testes positivos para HR-HPV no contexto do rastreio de cancro cervical da população geral.

Publicações

Salta S, Maia-Moço L, Estevão-Pereira H, Sequeira JP, Vieira R, Bartosch C, Petronilho S, Monteiro P, Sousa A, Baldaque I, Rodrigues J, Sousa H, Tavares F, Henrique R, Jerónimo C. Performance of DNA methylation-based biomarkers in the cervical cancer screening program of northern Portugal: A feasibility study. Int J Cancer, 149(11):1916-1925, 2021. doi: 10.1002/ijc.33778.

• EpImmunoPCa – Epigenetic regulation of Immune Responses in prostate Cancer financiado pelo Centro de Investigação do Instituto Português de Oncologia (PI 143-CI-IPOP-131-2020), Financiamento: 49K€ (2020-2022) (PI: Prof. Carmen Jerónimo; Co-PI Dr. Margareta P. Correia)

Atualmente, a maioria das estratégias terapêuticas para CRPC metastático (mCRPC, em inglês) não oferecem cura e são largamente ineficazes, apenas aumentando marginalmente a sobrevida de pacientes. Por isso, são necessárias com urgência novas estratégias terapêuticas. À semelhança de outros tumores sólidos, a imunoterapia tem sido investigada para tratar o CRPC, levando à aprovação pela FDA do sipuleucel-T para pacientes com mCRPC, apesar da sobrevida total ser bastante marginal. Uma vez que marcas epigenéticas aberrantes são alterações-chave para a progressão de tumores da próstata, e têm vindo a ser associadas com o escape ao sistema imunitário, alvos terapêuticos epigenéticos podem ser benéficos em imunoterapia tumoral através da reversão do escape ao sistema imunitário utilizado pelas células de cancro da próstata, bem como pela modulação da diferenciação e função das células do sistema imunitário. Assim, neste estudo, queremos identificar o perfil epigenético tanto de células tumorais como de populações de células do sistema imunitário com capacidade de infiltrar tumores, que possam oferecer novas imunoterapias para ultrapassar a resistência primária em mCRPC.

• EpiPaRTy – Advances in Epigenetic targeting for PCa: Dissecting the interplay between ncRNAs and chromatin remodelers and their role as biomarkers of RadioTherapy resistance (PI-159-CI-IPOP-152-2021), Financiamento: 15K€ (2021-2022) (PI: Prof. Carmen Jerónimo).

O cancro da próstata (PCa, em inglês) constitui a neoplasia com maior incidência em homens. Apesar das altas taxas de sobrevivência, alguns destes tumores adquirem um fenótipo agressivo e podem disseminar-se, tornando-se resistentes à terapia. Relativamente às abordagens terapêuticas, a radioterapia é actualmente utilizada com intenções curativas em PCa localizado. Contudo, a eficácia da radiação diminui em estadios mais avançados, com o aparecimento de recidiva bioquímica ou metastização. De acordo com a relação existente entre a resposta à radioterapia e a morte celular, as alterações epigenéticas, incluindo a desregulação de RNAs não codificantes e as modificações de remodelação da cromatina, afectam a expressão de vários genes-alvo críticos para o crescimento celular, reparação de erros de DNA e desregulação do ciclo celular. Assim, neste projecto queremos identificar novas estratégias terapêuticas contra marcadores epigenéticos relevantes que possam reverter o fenótipo radioresistente, bem como novos biomarcadores prognósticos e preditivos com valor clínico para a estratificação de pacientes com PCa.

• PCaEXOBone – Prostate Cancer pre-metastatic niche formation: Exosomal osteotropism (PI 158-CI-IPOP-151-2021), Financiamento: 30K€ (2021-2022). (PI: Prof. Carmen Jerónimo)

O cancro da próstata (PCa, em inglês) é um grande problema de saúde pública a nível mundial. Apesar da alta incidência, as mortes relacionadas com o PCa são sobretudo devidas a doença metastática, para a qual não existem tratamentos curativos. Apesar das metástases ósseas representarem até 84% de todas as metástases de PCa, os mecanismos que controlam o osteotropismo do PCa permanecem largamente desconhecidos. Os exossomas conseguem transferir a sua carga, tendo um impacto funcional nas células que a recebem. Assim, os exossomas têm sido relacionados com a formação de nichos pré-metastáticos através da criação de um ambiente pró-tumoral distante do tumor primário. Para além disso, apesar de os exossomas terem sido associados com o tropismo metastático em vários tipos de cancro, as assinaturas de exossomas e a sua relevância biológica na carcinogénese e metastização do PCa carecem ainda de compreensão. Por isso, o nosso objectivo é desvendar a função dos exossomas derivados do PCa no desenvolvimento de metástases e identificar a carga exossomal que contribui para o ósteotropismo. Para além disso, queremos desenvolver uma ferramenta específica de prognóstico da formação de um nicho ósseo pré-metastático que seja capaz de prever a probabilidade de progressão para doença metastática.

• MiRVeBlad- Identification of Exosomal-derived miRNAs as non-invasive high-risk BlCa biomarkers (PI-160-CI-IPOP-153-2021), Financiamento: 25K€ (2021-2022). (PI: Prof. Carmen Jerónimo)

Este projecto tem sido desenvolvido no âmbito do Porto.CCCAs vesículas extracelulares (EVs, em inglês) têm um papel funcional essencial na progressão tumoral localizada, disseminação metastática, e aparecimento de resistência a fármacos em diferentes tipos de cancro. Como tal, as EVs estão a ser exploradas enquanto potenciais marcadores de diagnóstico, prognóstico e preditivos de malignidade. Virtualmente todas as biomoléculas (tais como DNA, RNA, ncRNA ou proteinas) presentes nas EVs podem ser testadas. No contexto de tumores uroteliais, há evidências recentes que sugerem que as EVs reflectem a assinatura molecular das células do tumor primário e podem, por isso, servir como uma ferramenta eficaz para a caracterização molecular dos tumores bem como para revelar biomarcadores clínicos úteis. O nosso objectivo é descobrir e validar estes biomarcadores em biópsias líquidas de pacientes com tumores uroteliais. Biomarcadores eficazes permitirão o diagnóstico precoce de tumores e a estratificação adequada de lesões de alto e baixo risco.

• EpiMetaboK – Epitranscriptomic alterations within renal cancer metabolism reprogramming: uncovering new therapeutic targets (PI 112-CI-IPOP-92-2018), Financiamento: 20K€ (2022-2023) (PI: Prof. Carmen Jerónimo; Co-PI Dr. Vera Miranda-Gonçalves)

O carcinoma de células renais (RCC, em inglês) é a neoplasia mais comum no rim. As terapias actuais são sobretudo curativas para doença localizada, mas não impedem o aparecimento de recidivas e a metastização. Há necessidade de biomarcadores que possam discriminar com precisão os pacientes que são efectivamente curados pela cirurgia daqueles que irão recidivar e desenvolver doença metastática. Neste sentido, um conhecimento alargado da biologia da progressão e metastização dos RCC é imperativa. A epitranscriptómica é uma nova camada da regulação de expressão génica ao nível do RNA. Actualmente, a reprogramação metabólica é considerada um hallmark do cancro, e a sua interacção com a epigenética tem sido estudada por várias equipas de investigação, contrariamente às interacções com a epitranscriptómica, cujas implicações em RCC são em grande parte ainda desconhecidas. Assim, este projecto tem por objectivo explorar o papel da modulação epitranscriptómica em RCC e, especificamente, identificar as enzimas metabólicas que são reguladas pelo m6A.

Publicações 

• Guimarães-Teixeira C, Lobo J, Miranda-Gonçalves V, Barros-Silva D, Martins-Lima C, Monteiro-Reis S, Sequeira JP, Carneiro I, Correia MP, Henrique R, Jerónimo C. Downregulation of m6 A writer complex member METTL14 in bladder urothelial carcinoma suppresses tumor aggressiveness. Mol Oncol. 16(9):1841-1856, 2022. doi: 10.1002/1878-0261.13181.
• Miranda-Gonçalves V, Lobo J, Guimarães-Teixeira C, Barros-Silva D, Guimarães R, Cantante M, Braga I, Maurício J, Oing C, Honecker F, Nettersheim D, Looijenga LHJ, Henrique R, Jerónimo C. The component of the m6A writer complex VIRMA is implicated in aggressive tumor phenotype, DNA damage response and cisplatin resistance in germ cell tumors. J Exp Clin Cancer Res. 40(1):268, 2021. doi: 10.1186/s13046-021-02072-9.
• Lobo J, Constâncio V, Guimarães-Teixeira C, Leite-Silva P, Miranda-Gonçalves V, Sequeira JP, Pistoni L, Guimarães R, Cantante M, Braga I, Maurício J, Looijenga LHJ, Henrique R, Jerónimo C. Promoter methylation of DNA homologous recombination genes is predictive of the responsiveness to PARP inhibitor treatment in testicular germ cell tumors. Mol Oncol. 15(4):846-865, 2021. doi: 10.1002/1878-0261.12909.
• Outeiro-Pinho G, Barros-Silva D, Aznar E, Sousa AI, Vieira-Coimbra M, Oliveira J, Gonçalves CS, Costa BM, Junker K, Henrique R, Jerónimo C. MicroRNA-30a-5pme: a novel diagnostic and prognostic biomarker for clear cell renal cell carcinoma in tissue and urine samples. J Exp Clin Cancer Res. 39(1):98, 2020. doi: 10.1186/s13046-020-01600-3.
• Barros-Silva D, Lobo J, Guimarães-Teixeira C, Carneiro I, Oliveira J, Martens-Uzunova ES, Henrique R, Jerónimo C. VIRMA-Dependent N6-Methyladenosine Modifications Regulate the Expression of Long Non-Coding RNAs CCAT1 and CCAT2 in Prostate Cancer. Cancers 12(4): E771, 2020. doi: 10.3390/cancers12040771.

PATENTES

(2012) Methods and biomarkers for detection of bladder cancer; US 20130210011/ EP 2630261 A1/ WO 2012052844 A1 (in collaboration Oslo University Hospital)

COLABORAÇÕES NACIONAIS

Dr. Bruno Costa-Silva, Fundação Champalimaud
Prof. Celso Reis, IPATIMUP, i3S
Prof. Joana Paredes, IPATIMUP, i3S
Prof. Fátima Baltazar & Dr. Bruno Costa, ICVS/3Bs, U. Minho
Prof. Fernando Jorge Monteiro & Dr. Ângela Carvalho; INEB, I3S
Prof. Goreti Sales, U. Coimbra
Prof. João F Mano, CICECO – U. Aveiro
Prof. Luisa Helguero, IBiMED, U. Aveiro
Prof. Margarida Fardilha, IBiMED, U. Aveiro
Prof. Maria José Oliveira, INEB, i3S
Dr. Meriem Lamghari, INEB, i3S
Prof. Paula Guedes & Prof. Márcia Carvalho, REQUIMTE-FF, U. Porto
Prof. Raquel Almeida, IPATIMUP, i3S

COLABORAÇÕES INTERNACIONAIS

Dr. Aamir Ahmed, King’s College London, UK
Prof. Antonio Lopez-Beltran, Cordoba University Medical School, Cordoba, Spain
Dr. Elena Martens-Uzunova, Erasmus Medical Center, Rotterdam, The Netherlands
Dr. Florence Le Calvez-Kelm, IARC, Lyon, France
Dr. Giuseppina Carbone, Belinzona, Switzerland
Dr. Guro Lind, Radium Hospital, Oslo, Norway
Dr. Hector Peinado, CNIO; Madrid, Spain
Dr. Jesús M. Paramio, Molecular Oncology Unit, CIEMAT, & Instituto de Investigacion Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid, Spain
Prof. Lucia Altucci, School in Life Sciences, Università degli studi della Campania “Luigi Vanvitelli”, Naples, Italy
Prof. Marianne G. Rots, Groningen, The Netherlands
Prof. Matthias Schwab, Dr. Margarete Fischer-Bosch Institute of Clinical Pharmacology, Stuttgart, Germany
Dr. Mónica Martínez-Fernández, CiMUS, University of Santiago de Compostela, Spain
Dr. Paola Arimondo, Institute Pasteur, Paris, France
Dr. Wilbert Zwart, NKI, Amsterdam, The Netherlands
Prof. Valérie Taly, Université Paris Descartes, Paris, France

*A informação descrita no grupo é da inteira responsabilidade do respectivo coordenador.